MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 1689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	TAACA	2	10	907	916	60 %	20 %	0 %	20 %	57238732
2	NC_005295	ATATC	2	10	2183	2192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_005295	CTATA	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_005295	TTTCT	2	10	4024	4033	0 %	80 %	0 %	20 %	57238734
5	NC_005295	CATTT	2	10	5225	5234	20 %	60 %	0 %	20 %	57238735
6	NC_005295	GATTT	2	10	5648	5657	20 %	60 %	20 %	0 %	57238735
7	NC_005295	GTTAT	2	10	6192	6201	20 %	60 %	20 %	0 %	57238735
8	NC_005295	ACATA	2	10	7357	7366	60 %	20 %	0 %	20 %	57238737
9	NC_005295	AACAT	2	10	8179	8188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005295	TAATT	2	10	8362	8371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005295	GTAAT	2	10	8550	8559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005295	TACAT	2	10	11437	11446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_005295	ACTAA	2	10	12824	12833	60 %	20 %	0 %	20 %	57238739
14	NC_005295	ACTAA	2	10	12982	12991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_005295	TTTTA	2	10	13276	13285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005295	TCTAT	2	10	14400	14409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_005295	AATGG	2	10	15053	15062	40 %	20 %	40 %	0 %	57238741
18	NC_005295	TTCAG	2	10	15637	15646	20 %	40 %	20 %	20 %	57238742
19	NC_005295	GTAAT	2	10	16130	16139	40 %	40 %	20 %	0 %	57238742
20	NC_005295	AACAA	2	10	18712	18721	80 %	0 %	0 %	20 %	57238743
21	NC_005295	AAAAT	2	10	20372	20381	80 %	20 %	0 %	0 %	57238745
22	NC_005295	GCATA	2	10	20628	20637	40 %	20 %	20 %	20 %	57238746
23	NC_005295	ACTAA	2	10	24415	24424	60 %	20 %	0 %	20 %	57238750
24	NC_005295	TAATT	2	10	24882	24891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005295	TAAAA	2	10	24979	24988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005295	TTGAT	2	10	25054	25063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005295	CTATA	2	10	25815	25824	40 %	40 %	0 %	20 %	57238751
28	NC_005295	TTTAT	2	10	26552	26561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005295	TTTGT	2	10	27223	27232	0 %	80 %	20 %	0 %	57238752
30	NC_005295	ATATA	2	10	27328	27337	60 %	40 %	0 %	0 %	57238752
31	NC_005295	CTTAT	2	10	28491	28500	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_005295	ATGTA	2	10	30309	30318	40 %	40 %	20 %	0 %	57238755
33	NC_005295	TATAA	2	10	31034	31043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005295	GTAGA	2	10	33808	33817	40 %	20 %	40 %	0 %	57238757
35	NC_005295	TGGTA	2	10	34055	34064	20 %	40 %	40 %	0 %	57238757
36	NC_005295	TTTAT	2	10	36322	36331	20 %	80 %	0 %	0 %	57238759
37	NC_005295	TTGAC	2	10	36839	36848	20 %	40 %	20 %	20 %	57238760
38	NC_005295	CTATC	2	10	36897	36906	20 %	40 %	0 %	40 %	57238760
39	NC_005295	TTATT	2	10	37922	37931	20 %	80 %	0 %	0 %	57238761
40	NC_005295	TTAAT	2	10	38926	38935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005295	ATGTA	2	10	40781	40790	40 %	40 %	20 %	0 %	57238762
42	NC_005295	GTGTT	2	10	41161	41170	0 %	60 %	40 %	0 %	57238762
43	NC_005295	TGCCT	2	10	41279	41288	0 %	40 %	20 %	40 %	57238762
44	NC_005295	ATTTT	2	10	41498	41507	20 %	80 %	0 %	0 %	57238762
45	NC_005295	TTTAA	2	10	41624	41633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005295	ATACT	2	10	41991	42000	40 %	40 %	0 %	20 %	57238763
47	NC_005295	ATTTT	2	10	42081	42090	20 %	80 %	0 %	0 %	57238763
48	NC_005295	AATCA	2	10	43722	43731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_005295	TAAAT	2	10	44357	44366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005295	TAGTT	2	10	46111	46120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005295	GATAC	2	10	46209	46218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_005295	ATCAA	2	10	47492	47501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_005295	TTCTT	2	10	47689	47698	0 %	80 %	0 %	20 %	57238767
54	NC_005295	TATAA	2	10	47717	47726	60 %	40 %	0 %	0 %	57238767
55	NC_005295	TTTTA	2	10	47817	47826	20 %	80 %	0 %	0 %	57238767
56	NC_005295	TTTTA	2	10	47904	47913	20 %	80 %	0 %	0 %	57238767
57	NC_005295	TCTAT	2	10	49753	49762	20 %	60 %	0 %	20 %	57238768
58	NC_005295	ATTCT	2	10	49784	49793	20 %	60 %	0 %	20 %	57238768
59	NC_005295	CAAGC	2	10	51796	51805	40 %	0 %	20 %	40 %	57238770
60	NC_005295	TTTAT	2	10	52833	52842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005295	TATGA	2	10	53750	53759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005295	TTGAT	2	10	55010	55019	20 %	60 %	20 %	0 %	57238771
63	NC_005295	TTAAT	2	10	56633	56642	40 %	60 %	0 %	0 %	57238772
64	NC_005295	TAATA	2	10	57736	57745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005295	TGTAA	2	10	58011	58020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005295	TGTAA	2	10	58265	58274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005295	TGTAA	2	10	58520	58529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005295	ATTTT	2	10	58745	58754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005295	ATGGT	2	10	59844	59853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005295	ATTTC	2	10	60985	60994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_005295	ATTTC	2	10	63217	63226	20 %	60 %	0 %	20 %	57238774
72	NC_005295	ATAGT	2	10	63436	63445	40 %	40 %	20 %	0 %	57238774
73	NC_005295	TTTTA	2	10	63651	63660	20 %	80 %	0 %	0 %	57238775
74	NC_005295	AGTTT	2	10	64183	64192	20 %	60 %	20 %	0 %	57238775
75	NC_005295	TTATA	2	10	64193	64202	40 %	60 %	0 %	0 %	57238775
76	NC_005295	TAACG	2	10	65386	65395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_005295	TTTTG	2	10	65774	65783	0 %	80 %	20 %	0 %	57238777
78	NC_005295	TATGA	2	10	66120	66129	40 %	40 %	20 %	0 %	57238777
79	NC_005295	TTGTT	2	10	67631	67640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005295	TTTAT	2	10	68096	68105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005295	TGGAG	2	10	69301	69310	20 %	20 %	60 %	0 %	57238779
82	NC_005295	ATGTA	2	10	71928	71937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005295	TGTAT	2	10	72354	72363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005295	AAACA	2	10	73110	73119	80 %	0 %	0 %	20 %	57238780
85	NC_005295	AAAAG	2	10	74865	74874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005295	ATGCT	2	10	77130	77139	20 %	40 %	20 %	20 %	57238783
87	NC_005295	TTGAT	2	10	77714	77723	20 %	60 %	20 %	0 %	57238783
88	NC_005295	TTATA	2	10	79247	79256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005295	GTATG	2	10	80727	80736	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005295	AAGAT	2	10	81176	81185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005295	ATATT	2	10	81859	81868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005295	TGTAT	2	10	83015	83024	20 %	60 %	20 %	0 %	57238788
93	NC_005295	AATTT	2	10	83767	83776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005295	AAGTG	2	10	84039	84048	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005295	ACGAT	2	10	84348	84357	40 %	20 %	20 %	20 %	57238789
96	NC_005295	ACCAA	2	10	85013	85022	60 %	0 %	0 %	40 %	57238789
97	NC_005295	TTAAT	2	10	86250	86259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005295	TCTGA	2	10	88940	88949	20 %	40 %	20 %	20 %	57238791
99	NC_005295	ATTAC	2	10	89243	89252	40 %	40 %	0 %	20 %	57238791
100	NC_005295	AAATC	2	10	92795	92804	60 %	20 %	0 %	20 %	57238794
101	NC_005295	GTAAT	2	10	94803	94812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005295	GTTTT	2	10	95365	95374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005295	TATGT	2	10	95706	95715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005295	ATATA	2	10	95872	95881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005295	TTATT	2	10	98381	98390	20 %	80 %	0 %	0 %	57238797
106	NC_005295	GAAAA	2	10	98922	98931	80 %	0 %	20 %	0 %	57238797
107	NC_005295	CATTA	2	10	99685	99694	40 %	40 %	0 %	20 %	57238797
108	NC_005295	TATGA	2	10	101017	101026	40 %	40 %	20 %	0 %	57238797
109	NC_005295	TCATA	2	10	101493	101502	40 %	40 %	0 %	20 %	57238797
110	NC_005295	AAAAT	2	10	101891	101900	80 %	20 %	0 %	0 %	57238797
111	NC_005295	AGTTT	2	10	102436	102445	20 %	60 %	20 %	0 %	57238797
112	NC_005295	ATCAC	2	10	103165	103174	40 %	20 %	0 %	40 %	57238797
113	NC_005295	AAGTA	2	10	104034	104043	60 %	20 %	20 %	0 %	57238797
114	NC_005295	TGTAT	2	10	104798	104807	20 %	60 %	20 %	0 %	57238797
115	NC_005295	ACTTT	2	10	104919	104928	20 %	60 %	0 %	20 %	57238797
116	NC_005295	GAACA	2	10	105590	105599	60 %	0 %	20 %	20 %	57238797
117	NC_005295	AAAAT	2	10	108917	108926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005295	AATCA	2	10	110543	110552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_005295	TTATA	2	10	111278	111287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005295	TGTAA	2	10	111979	111988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005295	AAATT	2	10	113209	113218	60 %	40 %	0 %	0 %	57238799
122	NC_005295	GAGCA	2	10	113672	113681	40 %	0 %	40 %	20 %	57238799
123	NC_005295	GTATA	2	10	113915	113924	40 %	40 %	20 %	0 %	57238799
124	NC_005295	TAATG	2	10	114512	114521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005295	TAATT	2	10	114781	114790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005295	AGATT	2	10	114890	114899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005295	GGAAA	2	10	115387	115396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005295	TTATT	2	10	118201	118210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005295	CTACC	2	10	119659	119668	20 %	20 %	0 %	60 %	57238801
130	NC_005295	TACTA	2	10	119826	119835	40 %	40 %	0 %	20 %	57238801
131	NC_005295	AGACT	2	10	120463	120472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_005295	AGTCA	2	10	120887	120896	40 %	20 %	20 %	20 %	57238803
133	NC_005295	ATGGC	2	10	121648	121657	20 %	20 %	40 %	20 %	57238803
134	NC_005295	AGATG	2	10	121818	121827	40 %	20 %	40 %	0 %	57238803
135	NC_005295	AAACT	2	10	122315	122324	60 %	20 %	0 %	20 %	57238803
136	NC_005295	GTTAT	2	10	123514	123523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005295	AGCTG	2	10	123876	123885	20 %	20 %	40 %	20 %	57238804
138	NC_005295	AATAA	2	10	124093	124102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005295	AGTTA	2	10	124244	124253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005295	TAATC	2	10	126169	126178	40 %	40 %	0 %	20 %	57238805
141	NC_005295	GATAT	2	10	128423	128432	40 %	40 %	20 %	0 %	57238806
142	NC_005295	CTTAT	2	10	128772	128781	20 %	60 %	0 %	20 %	57238806
143	NC_005295	TGCTA	2	10	130285	130294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_005295	ATTAT	2	10	131361	131370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005295	TATAT	2	10	131402	131411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005295	TAGTT	2	10	132143	132152	20 %	60 %	20 %	0 %	57238807
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148	NC_005295	TGTTA	2	10	134712	134721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005295	CATAT	2	10	134812	134821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_005295	CATAT	2	10	134949	134958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_005295	TGTTA	2	10	134987	134996	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_005295	GGTAT	2	10	136726	136735	20 %	40 %	40 %	0 %	57238808
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156	NC_005295	TAGTA	2	10	141162	141171	40 %	40 %	20 %	0 %	57238810
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161	NC_005295	CTTAT	2	10	150710	150719	20 %	60 %	0 %	20 %	57238818
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168	NC_005295	TATAT	2	10	158572	158581	40 %	60 %	0 %	0 %	57238821
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186	NC_005295	GAATA	2	10	179556	179565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_005295	GAATA	2	10	179710	179719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_005295	TATTT	2	10	181205	181214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_005295	GTATA	2	10	194249	194258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_005295	TGGTA	2	10	234679	234688	20 %	40 %	40 %	0 %	57238864
248	NC_005295	ATAGT	2	10	235901	235910	40 %	40 %	20 %	0 %	57238864
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253	NC_005295	ATTAT	2	10	237507	237516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_005295	ATTAA	2	10	237769	237778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_005295	ATATC	2	10	238424	238433	40 %	40 %	0 %	20 %	57238866
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258	NC_005295	TAATG	2	10	241305	241314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_005295	AAGTT	2	10	241340	241349	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_005295	ATTTA	2	10	241964	241973	40 %	60 %	0 %	0 %	57238871
261	NC_005295	AAGAA	2	10	242804	242813	80 %	0 %	20 %	0 %	57238871
262	NC_005295	AATTA	2	10	243043	243052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_005295	ACTTA	2	10	243472	243481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_005295	TATAA	2	10	244253	244262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_005295	ATATC	2	10	244977	244986	40 %	40 %	0 %	20 %	57238873
266	NC_005295	AGAAC	2	10	246142	246151	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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268	NC_005295	TATAA	2	10	248712	248721	60 %	40 %	0 %	0 %	57238874
269	NC_005295	GATTA	2	10	249246	249255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_005295	AATAT	2	10	253177	253186	60 %	40 %	0 %	0 %	57238878
273	NC_005295	ATTAT	2	10	254028	254037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_005295	TTAAT	2	10	254946	254955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_005295	TTTTG	2	10	255467	255476	0 %	80 %	20 %	0 %	57238879
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277	NC_005295	CTGTA	2	10	256322	256331	20 %	40 %	20 %	20 %	57238880
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279	NC_005295	AAATT	2	10	259326	259335	60 %	40 %	0 %	0 %	57238881
280	NC_005295	TAGAA	2	10	259582	259591	60 %	20 %	20 %	0 %	57238881
281	NC_005295	GTTGT	2	10	259992	260001	0 %	60 %	40 %	0 %	57238881
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283	NC_005295	AATTA	2	10	260592	260601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_005295	AAATT	2	10	261601	261610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_005295	TTAGT	2	10	261645	261654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_005295	ATAAG	2	10	262123	262132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_005295	TATAT	2	10	263143	263152	40 %	60 %	0 %	0 %	57238883
288	NC_005295	GATAA	2	10	263363	263372	60 %	20 %	20 %	0 %	57238883
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401	NC_005295	ATATG	2	10	355825	355834	40 %	40 %	20 %	0 %	57238940
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406	NC_005295	TTTGT	2	10	364978	364987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_005295	AGAAT	2	10	372108	372117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_005295	AGTTT	2	10	375482	375491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_005295	ATGTA	2	10	376684	376693	40 %	40 %	20 %	0 %	57238951
418	NC_005295	CATTT	2	10	377325	377334	20 %	60 %	0 %	20 %	57238951
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