MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 44494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005295	AACAT	2	10	136377	136386	60 %	20 %	0 %	20 %	57238808
4002	NC_005295	TAG	2	6	136431	136436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238808
4003	NC_005295	TAA	2	6	136482	136487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238808
4004	NC_005295	A	7	7	136486	136492	100 %	0 %	0 %	0 %	57238808
4005	NC_005295	TTA	2	6	136569	136574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238808
4006	NC_005295	GGTAT	2	10	136726	136735	20 %	40 %	40 %	0 %	57238808
4007	NC_005295	ATT	3	9	136757	136765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238808
4008	NC_005295	TGAA	2	8	136773	136780	50 %	25 %	25 %	0 %	57238808
4009	NC_005295	AGA	2	6	136825	136830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238808
4010	NC_005295	GATGTT	2	12	136841	136852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57238808
4011	NC_005295	CTA	2	6	136866	136871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238808
4012	NC_005295	ATC	2	6	137004	137009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238808
4013	NC_005295	ATA	2	6	137010	137015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238808
4014	NC_005295	TGA	2	6	137191	137196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238808
4015	NC_005295	AAGT	2	8	137242	137249	50 %	25 %	25 %	0 %	57238808
4016	NC_005295	TGTT	2	8	137259	137266	0 %	75 %	25 %	0 %	57238808
4017	NC_005295	TCTT	2	8	137408	137415	0 %	75 %	0 %	25 %	57238808
4018	NC_005295	A	7	7	137453	137459	100 %	0 %	0 %	0 %	57238808
4019	NC_005295	AT	3	6	137563	137568	50 %	50 %	0 %	0 %	57238808
4020	NC_005295	GGA	2	6	137572	137577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238808
4021	NC_005295	TAA	2	6	137596	137601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238808
4022	NC_005295	TCATGA	2	12	137611	137622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57238808
4023	NC_005295	TTA	2	6	137860	137865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238808
4024	NC_005295	TTA	2	6	138196	138201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_005295	GAT	2	6	138203	138208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_005295	TTA	2	6	138532	138537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_005295	ATA	2	6	138651	138656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_005295	ATT	2	6	138666	138671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_005295	TTTATA	2	12	138681	138692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_005295	GTA	2	6	138738	138743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_005295	TCA	2	6	138753	138758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_005295	TAA	2	6	138761	138766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_005295	TTA	2	6	138796	138801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_005295	T	6	6	138826	138831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_005295	TA	4	8	138834	138841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_005295	ATA	2	6	138864	138869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_005295	GTA	2	6	138887	138892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_005295	T	6	6	138911	138916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_005295	AT	3	6	138966	138971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_005295	GA	3	6	139008	139013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_005295	TA	3	6	139024	139029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_005295	TA	3	6	139105	139110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_005295	AT	3	6	139119	139124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_005295	TA	3	6	139130	139135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_005295	AAT	2	6	139196	139201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_005295	CA	3	6	139220	139225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_005295	TAT	2	6	139241	139246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_005295	AT	3	6	139245	139250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_005295	TATAT	2	10	139257	139266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_005295	T	7	7	139290	139296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_005295	TA	3	6	139302	139307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_005295	ATAA	2	8	139361	139368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_005295	GTG	2	6	139403	139408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_005295	T	7	7	139410	139416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_005295	TA	3	6	139425	139430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_005295	A	6	6	139438	139443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_005295	TAT	2	6	139461	139466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_005295	ATG	2	6	139654	139659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_005295	AG	3	6	139661	139666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_005295	A	6	6	139668	139673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_005295	ATT	2	6	139680	139685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_005295	AGC	2	6	139701	139706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_005295	TAGTAT	2	12	139736	139747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_005295	TAT	2	6	139782	139787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_005295	AAG	2	6	139803	139808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_005295	ATA	2	6	139835	139840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_005295	AT	3	6	139842	139847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_005295	T	6	6	139851	139856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_005295	TC	3	6	139883	139888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_005295	T	6	6	139900	139905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_005295	AAT	3	9	139915	139923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_005295	ATT	2	6	139941	139946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_005295	T	6	6	139987	139992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_005295	TA	3	6	140021	140026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_005295	TAG	2	6	140060	140065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_005295	TATT	2	8	140081	140088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_005295	T	7	7	140107	140113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_005295	T	6	6	140175	140180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_005295	AAT	2	6	140190	140195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_005295	ATT	2	6	140216	140221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_005295	T	7	7	140262	140268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_005295	TA	3	6	140299	140304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_005295	TAG	2	6	140338	140343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_005295	TATT	2	8	140359	140366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4090	NC_005295	T	6	6	140485	140490	0 %	100 %	0 %	0 %	57238809
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4094	NC_005295	TAG	2	6	140617	140622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238809
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4099	NC_005295	TA	3	6	140892	140897	50 %	50 %	0 %	0 %	57238810
4100	NC_005295	TAG	2	6	140915	140920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238810
4101	NC_005295	TAC	2	6	141003	141008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238810
4102	NC_005295	ACC	2	6	141081	141086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238810
4103	NC_005295	T	6	6	141087	141092	0 %	100 %	0 %	0 %	57238810
4104	NC_005295	ATC	2	6	141129	141134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238810
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4107	NC_005295	TGT	2	6	141198	141203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238810
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4111	NC_005295	TG	3	6	141337	141342	0 %	50 %	50 %	0 %	57238810
4112	NC_005295	AGT	2	6	141363	141368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238810
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4118	NC_005295	TA	3	6	141536	141541	50 %	50 %	0 %	0 %	57238811
4119	NC_005295	ACA	2	6	141599	141604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238811
4120	NC_005295	CTT	2	6	141609	141614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238811
4121	NC_005295	T	6	6	141613	141618	0 %	100 %	0 %	0 %	57238811
4122	NC_005295	TTGA	2	8	141647	141654	25 %	50 %	25 %	0 %	57238811
4123	NC_005295	CAA	2	6	141690	141695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238811
4124	NC_005295	AT	3	6	141700	141705	50 %	50 %	0 %	0 %	57238811
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4126	NC_005295	TCA	2	6	141731	141736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238811
4127	NC_005295	TA	3	6	141737	141742	50 %	50 %	0 %	0 %	57238811
4128	NC_005295	T	7	7	141817	141823	0 %	100 %	0 %	0 %	57238811
4129	NC_005295	ATT	2	6	141836	141841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238811
4130	NC_005295	CTA	2	6	141849	141854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238811
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4132	NC_005295	TAA	2	6	141933	141938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238811
4133	NC_005295	TCAT	2	8	142016	142023	25 %	50 %	0 %	25 %	57238811
4134	NC_005295	TCAT	2	8	142028	142035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_005295	CTTA	2	8	142089	142096	25 %	50 %	0 %	25 %	57238812
4136	NC_005295	TCA	2	6	142123	142128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238812
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