MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 44494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_005295	TGT	2	6	15473	15478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238741
503	NC_005295	TA	3	6	15483	15488	50 %	50 %	0 %	0 %	57238741
504	NC_005295	TAAG	2	8	15500	15507	50 %	25 %	25 %	0 %	57238741
505	NC_005295	AAC	2	6	15511	15516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_005295	AGA	2	6	15549	15554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238742
507	NC_005295	CTG	2	6	15560	15565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238742
508	NC_005295	AGT	2	6	15574	15579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238742
509	NC_005295	A	6	6	15606	15611	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
510	NC_005295	AAT	2	6	15625	15630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
511	NC_005295	TTCAG	2	10	15637	15646	20 %	40 %	20 %	20 %	57238742
512	NC_005295	ATA	2	6	15694	15699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
513	NC_005295	A	6	6	15711	15716	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
514	NC_005295	TCA	2	6	15745	15750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238742
515	NC_005295	A	7	7	15777	15783	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
516	NC_005295	ATG	2	6	15827	15832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238742
517	NC_005295	TTA	2	6	15837	15842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238742
518	NC_005295	TAA	2	6	15855	15860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
519	NC_005295	TCA	2	6	15889	15894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238742
520	NC_005295	ATA	2	6	15895	15900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
521	NC_005295	A	7	7	15931	15937	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
522	NC_005295	ATA	2	6	16043	16048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
523	NC_005295	TAA	2	6	16059	16064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
524	NC_005295	T	6	6	16081	16086	0 %	100 %	0 %	0 %	57238742
525	NC_005295	GTAAT	2	10	16130	16139	40 %	40 %	20 %	0 %	57238742
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527	NC_005295	TAA	2	6	16200	16205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
528	NC_005295	GT	3	6	16210	16215	0 %	50 %	50 %	0 %	57238742
529	NC_005295	TTA	2	6	16388	16393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238742
530	NC_005295	TAG	2	6	16457	16462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238742
531	NC_005295	TAA	2	6	16475	16480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
532	NC_005295	A	6	6	16479	16484	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
533	NC_005295	TTG	2	6	16580	16585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238742
534	NC_005295	AT	3	6	16596	16601	50 %	50 %	0 %	0 %	57238742
535	NC_005295	TCA	2	6	16621	16626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238742
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539	NC_005295	TTA	2	6	16776	16781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238742
540	NC_005295	GAA	2	6	16922	16927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238742
541	NC_005295	AAT	2	6	16938	16943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
542	NC_005295	ATA	2	6	16961	16966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
543	NC_005295	TAG	2	6	17024	17029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238742
544	NC_005295	AAGA	2	8	17043	17050	75 %	0 %	25 %	0 %	57238742
545	NC_005295	A	8	8	17077	17084	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
546	NC_005295	AAT	2	6	17130	17135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
547	NC_005295	AGA	2	6	17157	17162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238742
548	NC_005295	TTA	2	6	17165	17170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238742
549	NC_005295	TAA	2	6	17199	17204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
550	NC_005295	A	7	7	17217	17223	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
551	NC_005295	AAT	2	6	17271	17276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
552	NC_005295	ATA	2	6	17297	17302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
553	NC_005295	TAA	2	6	17303	17308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
554	NC_005295	TTA	2	6	17321	17326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238742
555	NC_005295	ATA	2	6	17332	17337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
556	NC_005295	CAA	2	6	17360	17365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238742
557	NC_005295	GAA	2	6	17368	17373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238742
558	NC_005295	TA	3	6	17394	17399	50 %	50 %	0 %	0 %	57238742
559	NC_005295	A	6	6	17415	17420	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
560	NC_005295	A	6	6	17427	17432	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
561	NC_005295	A	6	6	17434	17439	100 %	0 %	0 %	0 %	57238742
562	NC_005295	GTT	2	6	17474	17479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238742
563	NC_005295	ATA	2	6	17498	17503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
564	NC_005295	TA	3	6	17534	17539	50 %	50 %	0 %	0 %	57238742
565	NC_005295	TTA	2	6	17555	17560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238742
566	NC_005295	TAA	2	6	17598	17603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238742
567	NC_005295	TAAG	2	8	17619	17626	50 %	25 %	25 %	0 %	57238742
568	NC_005295	AT	3	6	17647	17652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_005295	GAA	2	6	17744	17749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238743
570	NC_005295	A	7	7	17752	17758	100 %	0 %	0 %	0 %	57238743
571	NC_005295	ATC	2	6	17784	17789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238743
572	NC_005295	AGA	2	6	17818	17823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238743
573	NC_005295	ATG	2	6	17850	17855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238743
574	NC_005295	GATA	2	8	17860	17867	50 %	25 %	25 %	0 %	57238743
575	NC_005295	AGC	2	6	17878	17883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238743
576	NC_005295	GATA	2	8	17888	17895	50 %	25 %	25 %	0 %	57238743
577	NC_005295	TGGAAG	2	12	17917	17928	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	57238743
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579	NC_005295	AT	3	6	17973	17978	50 %	50 %	0 %	0 %	57238743
580	NC_005295	GGA	3	9	17993	18001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238743
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582	NC_005295	TGG	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238743
583	NC_005295	GGA	2	6	18085	18090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238743
584	NC_005295	ACA	2	6	18226	18231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238743
585	NC_005295	ATGT	2	8	18261	18268	25 %	50 %	25 %	0 %	57238743
586	NC_005295	GA	3	6	18279	18284	50 %	0 %	50 %	0 %	57238743
587	NC_005295	TTA	2	6	18344	18349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238743
588	NC_005295	AG	3	6	18370	18375	50 %	0 %	50 %	0 %	57238743
589	NC_005295	GTG	2	6	18432	18437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238743
590	NC_005295	TGTA	2	8	18441	18448	25 %	50 %	25 %	0 %	57238743
591	NC_005295	A	7	7	18460	18466	100 %	0 %	0 %	0 %	57238743
592	NC_005295	GAT	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238743
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596	NC_005295	AACAA	2	10	18712	18721	80 %	0 %	0 %	20 %	57238743
597	NC_005295	CTT	2	6	18731	18736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238743
598	NC_005295	TGA	2	6	18745	18750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238743
599	NC_005295	T	7	7	18790	18796	0 %	100 %	0 %	0 %	57238743
600	NC_005295	TAA	2	6	18848	18853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_005295	AATG	2	8	18912	18919	50 %	25 %	25 %	0 %	57238744
602	NC_005295	CTC	2	6	18966	18971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238744
603	NC_005295	GATT	2	8	19007	19014	25 %	50 %	25 %	0 %	57238744
604	NC_005295	TAG	2	6	19067	19072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238744
605	NC_005295	ATT	2	6	19085	19090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238744
606	NC_005295	CTC	2	6	19100	19105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238744
607	NC_005295	CAT	2	6	19228	19233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238744
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609	NC_005295	TAC	2	6	19318	19323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238744
610	NC_005295	ACTA	2	8	19454	19461	50 %	25 %	0 %	25 %	57238744
611	NC_005295	CA	3	6	19561	19566	50 %	0 %	0 %	50 %	57238744
612	NC_005295	TCT	2	6	19575	19580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238744
613	NC_005295	TTAG	2	8	19611	19618	25 %	50 %	25 %	0 %	57238744
614	NC_005295	TAT	2	6	19621	19626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238744
615	NC_005295	GTT	2	6	19629	19634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238744
616	NC_005295	TCT	2	6	19656	19661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238744
617	NC_005295	T	6	6	19712	19717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_005295	TAT	2	6	19774	19779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_005295	ATTT	2	8	19790	19797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_005295	ATA	2	6	19805	19810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238745
621	NC_005295	GTA	2	6	19822	19827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238745
622	NC_005295	TAT	2	6	19874	19879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238745
623	NC_005295	CAA	2	6	19934	19939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238745
624	NC_005295	A	6	6	19950	19955	100 %	0 %	0 %	0 %	57238745
625	NC_005295	TTA	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238745
626	NC_005295	TTG	2	6	19978	19983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238745
627	NC_005295	ATA	2	6	20030	20035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238745
628	NC_005295	TCT	2	6	20051	20056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238745
629	NC_005295	GCT	2	6	20059	20064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238745
630	NC_005295	T	6	6	20104	20109	0 %	100 %	0 %	0 %	57238745
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632	NC_005295	TATT	2	8	20150	20157	25 %	75 %	0 %	0 %	57238745
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