MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF1

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004669	TAAA	2	8	53	60	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004669	ACCC	2	8	550	557	25 %	0 %	0 %	75 %	29377804
3	NC_004669	AAAC	2	8	567	574	75 %	0 %	0 %	25 %	29377804
4	NC_004669	ATTT	2	8	1008	1015	25 %	75 %	0 %	0 %	29377804
5	NC_004669	AATT	2	8	1474	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	29377805
6	NC_004669	ATCG	2	8	1527	1534	25 %	25 %	25 %	25 %	29377805
7	NC_004669	TATT	2	8	1681	1688	25 %	75 %	0 %	0 %	29377805
8	NC_004669	GAAA	2	8	2815	2822	75 %	0 %	25 %	0 %	29377806
9	NC_004669	TGGC	2	8	3685	3692	0 %	25 %	50 %	25 %	29377806
10	NC_004669	AGTA	2	8	4037	4044	50 %	25 %	25 %	0 %	29377807
11	NC_004669	TAGA	2	8	4408	4415	50 %	25 %	25 %	0 %	29377807
12	NC_004669	AGAT	2	8	4448	4455	50 %	25 %	25 %	0 %	29377807
13	NC_004669	AAAT	2	8	4729	4736	75 %	25 %	0 %	0 %	29377807
14	NC_004669	TTGA	2	8	5937	5944	25 %	50 %	25 %	0 %	29377809
15	NC_004669	TTTA	2	8	6154	6161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004669	ATAA	2	8	6201	6208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004669	ACAA	2	8	6272	6279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004669	TATT	2	8	6295	6302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004669	AACA	2	8	6603	6610	75 %	0 %	0 %	25 %	29377810
20	NC_004669	ATCT	2	8	6696	6703	25 %	50 %	0 %	25 %	29377810
21	NC_004669	TAAA	2	8	7547	7554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004669	TCAA	2	8	7764	7771	50 %	25 %	0 %	25 %	29377811
23	NC_004669	ACCT	2	8	8579	8586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004669	TATT	2	8	8644	8651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004669	AAAT	2	8	8953	8960	75 %	25 %	0 %	0 %	29377812
26	NC_004669	GAAA	2	8	9485	9492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004669	AATA	2	8	9493	9500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004669	AAAT	3	12	9660	9671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004669	TTTC	2	8	10025	10032	0 %	75 %	0 %	25 %	29377813
30	NC_004669	ATTT	2	8	10291	10298	25 %	75 %	0 %	0 %	29377813
31	NC_004669	TAAA	2	8	10810	10817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004669	TCAA	2	8	11027	11034	50 %	25 %	0 %	25 %	29377814
33	NC_004669	AACT	2	8	11710	11717	50 %	25 %	0 %	25 %	29377815
34	NC_004669	AAAG	2	8	11783	11790	75 %	0 %	25 %	0 %	29377815
35	NC_004669	TTTA	2	8	11834	11841	25 %	75 %	0 %	0 %	29377815
36	NC_004669	AATA	2	8	12068	12075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004669	AATT	2	8	12149	12156	50 %	50 %	0 %	0 %	29377816
38	NC_004669	TAAT	2	8	12340	12347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004669	GTTG	2	8	12556	12563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004669	CTTT	2	8	12685	12692	0 %	75 %	0 %	25 %	29377817
41	NC_004669	TAAA	2	8	13361	13368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004669	GCAA	2	8	13430	13437	50 %	0 %	25 %	25 %	29377818
43	NC_004669	ATTG	2	8	13886	13893	25 %	50 %	25 %	0 %	29377819
44	NC_004669	ACGA	2	8	14120	14127	50 %	0 %	25 %	25 %	29377819
45	NC_004669	AATA	2	8	14413	14420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004669	TCGT	2	8	15244	15251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004669	ACGA	2	8	15622	15629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_004669	TGGG	2	8	15798	15805	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004669	TTTC	2	8	15870	15877	0 %	75 %	0 %	25 %	29377820
50	NC_004669	TCGT	2	8	16220	16227	0 %	50 %	25 %	25 %	29377820
51	NC_004669	GTTT	2	8	16521	16528	0 %	75 %	25 %	0 %	29377820
52	NC_004669	AATT	2	8	16685	16692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004669	CTTG	2	8	16976	16983	0 %	50 %	25 %	25 %	29377821
54	NC_004669	AACA	2	8	17462	17469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004669	TTCT	2	8	18088	18095	0 %	75 %	0 %	25 %	29377822
56	NC_004669	ACTC	2	8	18112	18119	25 %	25 %	0 %	50 %	29377823
57	NC_004669	TTCG	2	8	18509	18516	0 %	50 %	25 %	25 %	29377823
58	NC_004669	ATTT	2	8	18579	18586	25 %	75 %	0 %	0 %	29377823
59	NC_004669	CCTT	2	8	18655	18662	0 %	50 %	0 %	50 %	29377823
60	NC_004669	TCAA	2	8	18703	18710	50 %	25 %	0 %	25 %	29377823
61	NC_004669	ATCA	2	8	19229	19236	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004669	GACG	2	8	19982	19989	25 %	0 %	50 %	25 %	29377827
63	NC_004669	AAAT	2	8	20423	20430	75 %	25 %	0 %	0 %	29377827
64	NC_004669	ATAA	2	8	20491	20498	75 %	25 %	0 %	0 %	29377827
65	NC_004669	AAAC	2	8	20528	20535	75 %	0 %	0 %	25 %	29377827
66	NC_004669	ACTT	2	8	20723	20730	25 %	50 %	0 %	25 %	29377827
67	NC_004669	TGCT	2	8	20795	20802	0 %	50 %	25 %	25 %	29377827
68	NC_004669	CAAA	2	8	20857	20864	75 %	0 %	0 %	25 %	29377827
69	NC_004669	ATCA	2	8	20942	20949	50 %	25 %	0 %	25 %	29377827
70	NC_004669	ATTT	2	8	21430	21437	25 %	75 %	0 %	0 %	29377827
71	NC_004669	CAGA	2	8	21640	21647	50 %	0 %	25 %	25 %	29377827
72	NC_004669	GTTT	2	8	21992	21999	0 %	75 %	25 %	0 %	29377828
73	NC_004669	TTGG	2	8	22280	22287	0 %	50 %	50 %	0 %	29377828
74	NC_004669	GTTG	2	8	22303	22310	0 %	50 %	50 %	0 %	29377828
75	NC_004669	GTTG	2	8	22369	22376	0 %	50 %	50 %	0 %	29377828
76	NC_004669	TTTA	2	8	22734	22741	25 %	75 %	0 %	0 %	29377828
77	NC_004669	ATAA	2	8	23007	23014	75 %	25 %	0 %	0 %	29377828
78	NC_004669	TCTG	2	8	23044	23051	0 %	50 %	25 %	25 %	29377828
79	NC_004669	ACCA	2	8	23106	23113	50 %	0 %	0 %	50 %	29377828
80	NC_004669	TGAA	2	8	23284	23291	50 %	25 %	25 %	0 %	29377828
81	NC_004669	CAAA	2	8	23741	23748	75 %	0 %	0 %	25 %	29377828
82	NC_004669	ATTA	2	8	24831	24838	50 %	50 %	0 %	0 %	29377830
83	NC_004669	CTTC	2	8	25024	25031	0 %	50 %	0 %	50 %	29377830
84	NC_004669	CTGT	2	8	25453	25460	0 %	50 %	25 %	25 %	29377830
85	NC_004669	TCTT	2	8	25554	25561	0 %	75 %	0 %	25 %	29377830
86	NC_004669	AAAG	2	8	25846	25853	75 %	0 %	25 %	0 %	29377830
87	NC_004669	CGTT	2	8	26535	26542	0 %	50 %	25 %	25 %	29377830
88	NC_004669	GAAA	2	8	26567	26574	75 %	0 %	25 %	0 %	29377830
89	NC_004669	ATTG	2	8	26715	26722	25 %	50 %	25 %	0 %	29377830
90	NC_004669	TATT	2	8	26815	26822	25 %	75 %	0 %	0 %	29377830
91	NC_004669	CTTT	2	8	27176	27183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_004669	CATT	2	8	28546	28553	25 %	50 %	0 %	25 %	29377833
93	NC_004669	TAAC	2	8	28944	28951	50 %	25 %	0 %	25 %	29377834
94	NC_004669	TTCT	2	8	29441	29448	0 %	75 %	0 %	25 %	29377834
95	NC_004669	GCTT	2	8	29526	29533	0 %	50 %	25 %	25 %	29377834
96	NC_004669	TTCA	2	8	29856	29863	25 %	50 %	0 %	25 %	29377835
97	NC_004669	AATT	2	8	29912	29919	50 %	50 %	0 %	0 %	29377836
98	NC_004669	CGCT	2	8	30161	30168	0 %	25 %	25 %	50 %	29377836
99	NC_004669	ATAA	2	8	30210	30217	75 %	25 %	0 %	0 %	29377836
100	NC_004669	TAAA	2	8	30349	30356	75 %	25 %	0 %	0 %	29377837
101	NC_004669	TGTT	2	8	30588	30595	0 %	75 %	25 %	0 %	29377837
102	NC_004669	TGCT	2	8	30873	30880	0 %	50 %	25 %	25 %	29377837
103	NC_004669	TCAC	2	8	30999	31006	25 %	25 %	0 %	50 %	29377838
104	NC_004669	CAAC	2	8	31101	31108	50 %	0 %	0 %	50 %	29377838
105	NC_004669	AATA	2	8	31591	31598	75 %	25 %	0 %	0 %	29377838
106	NC_004669	TCGA	2	8	31989	31996	25 %	25 %	25 %	25 %	29377838
107	NC_004669	CTAT	2	8	32180	32187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004669	GCTT	2	8	32585	32592	0 %	50 %	25 %	25 %	29377839
109	NC_004669	GTTG	2	8	32716	32723	0 %	50 %	50 %	0 %	29377839
110	NC_004669	TAAA	2	8	33023	33030	75 %	25 %	0 %	0 %	29377839
111	NC_004669	GTCG	2	8	33104	33111	0 %	25 %	50 %	25 %	29377840
112	NC_004669	TTGT	2	8	33220	33227	0 %	75 %	25 %	0 %	29377840
113	NC_004669	TTAG	2	8	33365	33372	25 %	50 %	25 %	0 %	29377840
114	NC_004669	AATC	2	8	33514	33521	50 %	25 %	0 %	25 %	29377840
115	NC_004669	GATT	2	8	33641	33648	25 %	50 %	25 %	0 %	29377840
116	NC_004669	AACT	2	8	33649	33656	50 %	25 %	0 %	25 %	29377840
117	NC_004669	TTTG	2	8	33735	33742	0 %	75 %	25 %	0 %	29377840
118	NC_004669	GTTT	2	8	34520	34527	0 %	75 %	25 %	0 %	29377842
119	NC_004669	ATAC	2	8	34671	34678	50 %	25 %	0 %	25 %	29377842
120	NC_004669	TTTC	2	8	34686	34693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_004669	TTTG	2	8	34902	34909	0 %	75 %	25 %	0 %	29377843
122	NC_004669	TAAC	2	8	34953	34960	50 %	25 %	0 %	25 %	29377843
123	NC_004669	TTTC	2	8	35013	35020	0 %	75 %	0 %	25 %	29377843
124	NC_004669	AAGT	2	8	36074	36081	50 %	25 %	25 %	0 %	29377844
125	NC_004669	AAGA	2	8	36202	36209	75 %	0 %	25 %	0 %	29377844
126	NC_004669	TGGT	2	8	36271	36278	0 %	50 %	50 %	0 %	29377844
127	NC_004669	GAAC	2	8	36315	36322	50 %	0 %	25 %	25 %	29377844
128	NC_004669	CTTC	2	8	36426	36433	0 %	50 %	0 %	50 %	29377844
129	NC_004669	TTTG	2	8	36693	36700	0 %	75 %	25 %	0 %	29377844
130	NC_004669	AATT	2	8	37018	37025	50 %	50 %	0 %	0 %	29377844
131	NC_004669	AATC	2	8	37096	37103	50 %	25 %	0 %	25 %	29377844
132	NC_004669	AGTT	2	8	38108	38115	25 %	50 %	25 %	0 %	29377844
133	NC_004669	TTTA	2	8	38195	38202	25 %	75 %	0 %	0 %	29377844
134	NC_004669	TGTT	2	8	38235	38242	0 %	75 %	25 %	0 %	29377844
135	NC_004669	GTTG	2	8	38658	38665	0 %	50 %	50 %	0 %	29377844
136	NC_004669	TGTT	2	8	38993	39000	0 %	75 %	25 %	0 %	29377844
137	NC_004669	ACAA	2	8	39060	39067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004669	ATTG	2	8	39470	39477	25 %	50 %	25 %	0 %	29377845
139	NC_004669	ACTT	2	8	39596	39603	25 %	50 %	0 %	25 %	29377845
140	NC_004669	TACT	2	8	39690	39697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004669	ACCT	2	8	39715	39722	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004669	CTTC	2	8	39728	39735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_004669	TTGC	2	8	39852	39859	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004669	TTAA	2	8	40083	40090	50 %	50 %	0 %	0 %	29377847
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146	NC_004669	CTTC	2	8	40890	40897	0 %	50 %	0 %	50 %	29377848
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.