MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	GTCC	2	8	79	86	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002128	AAAC	2	8	282	289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002128	CTGC	2	8	595	602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002128	CAAA	2	8	1282	1289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002128	GGCA	2	8	2195	2202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002128	TTAT	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	10955267
7	NC_002128	ACAG	2	8	2986	2993	50 %	0 %	25 %	25 %	10955267
8	NC_002128	TTCT	2	8	3702	3709	0 %	75 %	0 %	25 %	10955268
9	NC_002128	GTAA	2	8	3864	3871	50 %	25 %	25 %	0 %	10955268
10	NC_002128	ACAG	2	8	5186	5193	50 %	0 %	25 %	25 %	10955268
11	NC_002128	TCAG	2	8	6321	6328	25 %	25 %	25 %	25 %	10955269
12	NC_002128	CACT	2	8	7089	7096	25 %	25 %	0 %	50 %	10955270
13	NC_002128	GAGG	2	8	8888	8895	25 %	0 %	75 %	0 %	10955272
14	NC_002128	CAGG	2	8	9091	9098	25 %	0 %	50 %	25 %	10955272
15	NC_002128	CGGA	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	10955273
16	NC_002128	GGGC	2	8	9426	9433	0 %	0 %	75 %	25 %	10955273
17	NC_002128	GCTG	2	8	9829	9836	0 %	25 %	50 %	25 %	10955274
18	NC_002128	TGAA	2	8	10130	10137	50 %	25 %	25 %	0 %	10955274
19	NC_002128	GCAG	2	8	10326	10333	25 %	0 %	50 %	25 %	10955275
20	NC_002128	ATTA	2	8	10457	10464	50 %	50 %	0 %	0 %	10955275
21	NC_002128	GATC	2	8	10582	10589	25 %	25 %	25 %	25 %	10955275
22	NC_002128	TCTG	2	8	10768	10775	0 %	50 %	25 %	25 %	10955275
23	NC_002128	TCAG	2	8	11022	11029	25 %	25 %	25 %	25 %	10955275
24	NC_002128	GGAG	2	8	11046	11053	25 %	0 %	75 %	0 %	10955275
25	NC_002128	GAGG	2	8	11095	11102	25 %	0 %	75 %	0 %	10955275
26	NC_002128	AACA	2	8	11119	11126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002128	GACA	2	8	11391	11398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002128	ACCC	2	8	12741	12748	25 %	0 %	0 %	75 %	10955277
29	NC_002128	GGCC	2	8	13059	13066	0 %	0 %	50 %	50 %	10955278
30	NC_002128	ATTC	2	8	13234	13241	25 %	50 %	0 %	25 %	10955278
31	NC_002128	TCTG	2	8	13452	13459	0 %	50 %	25 %	25 %	10955278
32	NC_002128	GGGA	2	8	13493	13500	25 %	0 %	75 %	0 %	10955278
33	NC_002128	AGCT	2	8	13524	13531	25 %	25 %	25 %	25 %	10955278
34	NC_002128	ATGG	2	8	13546	13553	25 %	25 %	50 %	0 %	10955278
35	NC_002128	GGCA	2	8	13557	13564	25 %	0 %	50 %	25 %	10955278
36	NC_002128	TCAG	2	8	13589	13596	25 %	25 %	25 %	25 %	10955278
37	NC_002128	CCCG	2	8	13647	13654	0 %	0 %	25 %	75 %	10955278
38	NC_002128	TCCA	2	8	13887	13894	25 %	25 %	0 %	50 %	10955279
39	NC_002128	GCAG	2	8	15265	15272	25 %	0 %	50 %	25 %	10955281
40	NC_002128	GTAA	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002128	ATCA	2	8	15881	15888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002128	TTAT	2	8	16078	16085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002128	GAAA	2	8	16347	16354	75 %	0 %	25 %	0 %	10955282
44	NC_002128	GAAA	2	8	16598	16605	75 %	0 %	25 %	0 %	10955282
45	NC_002128	TAAA	2	8	16619	16626	75 %	25 %	0 %	0 %	10955283
46	NC_002128	TTCT	2	8	17312	17319	0 %	75 %	0 %	25 %	10955283
47	NC_002128	CTTT	2	8	17530	17537	0 %	75 %	0 %	25 %	10955283
48	NC_002128	GAGC	2	8	17560	17567	25 %	0 %	50 %	25 %	10955283
49	NC_002128	AATG	2	8	17857	17864	50 %	25 %	25 %	0 %	10955283
50	NC_002128	TGCT	2	8	17945	17952	0 %	50 %	25 %	25 %	10955283
51	NC_002128	AGAA	2	8	18240	18247	75 %	0 %	25 %	0 %	10955283
52	NC_002128	AACA	2	8	18379	18386	75 %	0 %	0 %	25 %	10955283
53	NC_002128	TATG	2	8	18573	18580	25 %	50 %	25 %	0 %	10955283
54	NC_002128	TTGC	2	8	19703	19710	0 %	50 %	25 %	25 %	10955284
55	NC_002128	TTGC	2	8	20360	20367	0 %	50 %	25 %	25 %	10955284
56	NC_002128	AATA	2	8	20674	20681	75 %	25 %	0 %	0 %	10955284
57	NC_002128	ATGG	2	8	20836	20843	25 %	25 %	50 %	0 %	10955284
58	NC_002128	TTCT	2	8	22245	22252	0 %	75 %	0 %	25 %	10955285
59	NC_002128	TAAA	2	8	22410	22417	75 %	25 %	0 %	0 %	10955285
60	NC_002128	AGGA	2	8	22479	22486	50 %	0 %	50 %	0 %	10955285
61	NC_002128	ATAC	2	8	22811	22818	50 %	25 %	0 %	25 %	10955285
62	NC_002128	GAAA	2	8	23090	23097	75 %	0 %	25 %	0 %	10955285
63	NC_002128	AAAC	2	8	23297	23304	75 %	0 %	0 %	25 %	41223294
64	NC_002128	CATC	2	8	24046	24053	25 %	25 %	0 %	50 %	41223295
65	NC_002128	CAAA	2	8	24207	24214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002128	AGTG	2	8	24462	24469	25 %	25 %	50 %	0 %	10955287
67	NC_002128	TGGA	2	8	24581	24588	25 %	25 %	50 %	0 %	10955287
68	NC_002128	GTGC	2	8	24622	24629	0 %	25 %	50 %	25 %	10955287
69	NC_002128	CGCC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	25 %	75 %	10955287
70	NC_002128	CGGG	2	8	25008	25015	0 %	0 %	75 %	25 %	10955287
71	NC_002128	CACT	2	8	25272	25279	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002128	GACT	2	8	25424	25431	25 %	25 %	25 %	25 %	41223296
73	NC_002128	GAAT	2	8	26050	26057	50 %	25 %	25 %	0 %	41223296
74	NC_002128	CCCA	2	8	26062	26069	25 %	0 %	0 %	75 %	41223296
75	NC_002128	ACTG	2	8	26423	26430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002128	ACTT	2	8	26496	26503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002128	TCAT	2	8	26647	26654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002128	CAGA	2	8	26979	26986	50 %	0 %	25 %	25 %	10955291
79	NC_002128	CTTC	2	8	27614	27621	0 %	50 %	0 %	50 %	10955292
80	NC_002128	GGCG	2	8	27977	27984	0 %	0 %	75 %	25 %	10955292
81	NC_002128	ATAC	2	8	28200	28207	50 %	25 %	0 %	25 %	10955292
82	NC_002128	CATA	2	8	28217	28224	50 %	25 %	0 %	25 %	10955292
83	NC_002128	TACA	2	8	28237	28244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002128	CTCC	2	8	28297	28304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_002128	AGTG	2	8	29375	29382	25 %	25 %	50 %	0 %	10955295
86	NC_002128	CAGC	2	8	29627	29634	25 %	0 %	25 %	50 %	10955295
87	NC_002128	AGGA	2	8	29690	29697	50 %	0 %	50 %	0 %	10955295
88	NC_002128	GCTG	2	8	30089	30096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002128	CCAC	2	8	30843	30850	25 %	0 %	0 %	75 %	10955296
90	NC_002128	GATG	2	8	31050	31057	25 %	25 %	50 %	0 %	10955296
91	NC_002128	GACG	2	8	31064	31071	25 %	0 %	50 %	25 %	10955296
92	NC_002128	GTAA	2	8	31210	31217	50 %	25 %	25 %	0 %	10955296
93	NC_002128	CCAC	2	8	31224	31231	25 %	0 %	0 %	75 %	10955296
94	NC_002128	TTCC	2	8	31389	31396	0 %	50 %	0 %	50 %	10955296
95	NC_002128	TTCC	2	8	32213	32220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002128	TCGC	2	8	32628	32635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002128	TGGA	2	8	33776	33783	25 %	25 %	50 %	0 %	10955299
98	NC_002128	ACTG	2	8	34293	34300	25 %	25 %	25 %	25 %	10955300
99	NC_002128	GAAT	2	8	34518	34525	50 %	25 %	25 %	0 %	10955300
100	NC_002128	GCTG	2	8	34545	34552	0 %	25 %	50 %	25 %	10955300
101	NC_002128	TGGT	2	8	35964	35971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002128	CTTA	2	8	36309	36316	25 %	50 %	0 %	25 %	10955301
103	NC_002128	ACTC	2	8	36445	36452	25 %	25 %	0 %	50 %	10955301
104	NC_002128	ACAG	2	8	36892	36899	50 %	0 %	25 %	25 %	10955301
105	NC_002128	TGGA	2	8	37016	37023	25 %	25 %	50 %	0 %	10955301
106	NC_002128	AGGA	2	8	37238	37245	50 %	0 %	50 %	0 %	10955301
107	NC_002128	CTGG	2	8	37476	37483	0 %	25 %	50 %	25 %	10955301
108	NC_002128	GGAG	2	8	37879	37886	25 %	0 %	75 %	0 %	10955301
109	NC_002128	GTAT	2	8	38073	38080	25 %	50 %	25 %	0 %	10955302
110	NC_002128	GCTG	2	8	38298	38305	0 %	25 %	50 %	25 %	10955302
111	NC_002128	TTCA	2	8	38711	38718	25 %	50 %	0 %	25 %	10955302
112	NC_002128	TGGC	2	8	38833	38840	0 %	25 %	50 %	25 %	10955302
113	NC_002128	CGGG	2	8	38991	38998	0 %	0 %	75 %	25 %	10955303
114	NC_002128	CCGG	2	8	39105	39112	0 %	0 %	50 %	50 %	10955303
115	NC_002128	TGCG	2	8	39387	39394	0 %	25 %	50 %	25 %	10955304
116	NC_002128	GCAG	2	8	39876	39883	25 %	0 %	50 %	25 %	10955304
117	NC_002128	GCGG	2	8	40731	40738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002128	CAGT	2	8	41019	41026	25 %	25 %	25 %	25 %	10955306
119	NC_002128	GCGG	2	8	41680	41687	0 %	0 %	75 %	25 %	10955307
120	NC_002128	ACGG	2	8	42385	42392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002128	GGCA	2	8	42718	42725	25 %	0 %	50 %	25 %	10955309
122	NC_002128	GCCC	2	8	43069	43076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_002128	ACTG	2	8	43587	43594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002128	ATTT	2	8	43819	43826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002128	GTCA	2	8	43858	43865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002128	CGCT	2	8	44575	44582	0 %	25 %	25 %	50 %	10955312
127	NC_002128	CCCG	2	8	44687	44694	0 %	0 %	25 %	75 %	10955312
128	NC_002128	GCCA	2	8	45447	45454	25 %	0 %	25 %	50 %	10955312
129	NC_002128	CAGT	2	8	45729	45736	25 %	25 %	25 %	25 %	10955313
130	NC_002128	GTCT	2	8	46162	46169	0 %	50 %	25 %	25 %	10955313
131	NC_002128	CTGT	2	8	46539	46546	0 %	50 %	25 %	25 %	10955314
132	NC_002128	TGCC	2	8	46800	46807	0 %	25 %	25 %	50 %	10955314
133	NC_002128	CAGA	2	8	47283	47290	50 %	0 %	25 %	25 %	10955315
134	NC_002128	GACT	2	8	47585	47592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002128	ACTA	2	8	47931	47938	50 %	25 %	0 %	25 %	10955316
136	NC_002128	GAAC	2	8	48948	48955	50 %	0 %	25 %	25 %	10955316
137	NC_002128	TCTG	2	8	49316	49323	0 %	50 %	25 %	25 %	10955316
138	NC_002128	GAAG	2	8	49413	49420	50 %	0 %	50 %	0 %	10955316
139	NC_002128	GGAT	2	8	49476	49483	25 %	25 %	50 %	0 %	10955316
140	NC_002128	TCAG	2	8	49514	49521	25 %	25 %	25 %	25 %	10955316
141	NC_002128	CTGG	2	8	49823	49830	0 %	25 %	50 %	25 %	10955316
142	NC_002128	GAGG	2	8	50780	50787	25 %	0 %	75 %	0 %	10955318
143	NC_002128	GGCG	2	8	51543	51550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002128	GTTC	2	8	51866	51873	0 %	50 %	25 %	25 %	10955320
145	NC_002128	TCAG	2	8	51944	51951	25 %	25 %	25 %	25 %	10955320
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.