MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pOSAK1

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002127	TTC	2	6	1	6	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002127	TGG	2	6	33	38	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002127	AGC	2	6	74	79	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002127	TGC	3	9	125	133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002127	CGT	2	6	174	179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002127	CAC	2	6	194	199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_002127	CCG	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_002127	ACA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002127	CAG	2	6	272	277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002127	TTG	2	6	282	287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002127	AGA	3	9	478	486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955263
12	NC_002127	GCT	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10955263
13	NC_002127	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10955263
14	NC_002127	AAG	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955263
15	NC_002127	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002127	ATG	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955264
17	NC_002127	TCA	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955264
18	NC_002127	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955264
19	NC_002127	CCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10955265
20	NC_002127	GAT	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955265
21	NC_002127	TGA	3	9	1603	1611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955265
22	NC_002127	CAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
23	NC_002127	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955265
24	NC_002127	TGG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10955265
25	NC_002127	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10955265
26	NC_002127	TTA	3	9	2018	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955265
27	NC_002127	TCT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10955265
28	NC_002127	TCA	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
29	NC_002127	TCA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
30	NC_002127	AAG	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955265
31	NC_002127	GTT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002127	CAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002127	ACC	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_002127	GGT	2	6	2518	2523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002127	GGA	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002127	CTC	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002127	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002127	CTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002127	CGC	2	6	3138	3143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_002127	TGT	2	6	3222	3227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.