MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655

Total Repeats: 2998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000913	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	16127996
2	NC_000913	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	16127997
3	NC_000913	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	16128002
4	NC_000913	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	16128003
5	NC_000913	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	16128005
6	NC_000913	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_000913	CCGAT	2	10	17841	17850	20 %	20 %	20 %	40 %	16128013
8	NC_000913	AGCGA	2	10	18229	18238	40 %	0 %	40 %	20 %	16128013
9	NC_000913	GATGC	2	10	25714	25723	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_000913	CAGTA	2	10	26673	26682	40 %	20 %	20 %	20 %	16128023
11	NC_000913	GCGCT	2	10	28474	28483	0 %	20 %	40 %	40 %	16128025
12	NC_000913	ATTTA	2	10	29230	29239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000913	CGATG	2	10	31527	31536	20 %	20 %	40 %	20 %	16128027
14	NC_000913	GCGAA	2	10	32468	32477	40 %	0 %	40 %	20 %	16128027
15	NC_000913	CCGTT	2	10	33362	33371	0 %	40 %	20 %	40 %	16128027
16	NC_000913	CACGG	2	10	33739	33748	20 %	0 %	40 %	40 %	16128027
17	NC_000913	CGAAT	2	10	36449	36458	40 %	20 %	20 %	20 %	221800780
18	NC_000913	CCATG	2	10	37987	37996	20 %	20 %	20 %	40 %	16128032
19	NC_000913	TTCAG	2	10	38169	38178	20 %	40 %	20 %	20 %	16128032
20	NC_000913	CCGTA	2	10	39633	39642	20 %	20 %	20 %	40 %	16128033
21	NC_000913	TTAAA	2	10	40371	40380	60 %	40 %	0 %	0 %	16128033
22	NC_000913	ACCCA	2	10	41114	41123	40 %	0 %	0 %	60 %	16128034
23	NC_000913	TGATC	2	10	42741	42750	20 %	40 %	20 %	20 %	90111081
24	NC_000913	CGGCG	2	10	42990	42999	0 %	0 %	60 %	40 %	90111081
25	NC_000913	AATCA	2	10	43272	43281	60 %	20 %	0 %	20 %	16128036
26	NC_000913	CGGTT	2	10	44227	44236	0 %	40 %	40 %	20 %	16128037
27	NC_000913	TGGCG	2	10	45917	45926	0 %	20 %	60 %	20 %	16128039
28	NC_000913	TGCAC	2	10	47679	47688	20 %	20 %	20 %	40 %	16128040
29	NC_000913	AGGGC	2	10	48764	48773	20 %	0 %	60 %	20 %	16128041
30	NC_000913	GGCGC	2	10	48798	48807	0 %	0 %	60 %	40 %	16128041
31	NC_000913	GAAAC	2	10	49611	49620	60 %	0 %	20 %	20 %	16128041
32	NC_000913	AACGT	2	10	51523	51532	40 %	20 %	20 %	20 %	16128044
33	NC_000913	GCGTC	2	10	54507	54516	0 %	20 %	40 %	40 %	16128047
34	NC_000913	ATGTT	2	10	55321	55330	20 %	60 %	20 %	0 %	16128048
35	NC_000913	CTTCG	2	10	55754	55763	0 %	40 %	20 %	40 %	16128048
36	NC_000913	TGCGT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	40 %	20 %	16128048
37	NC_000913	AAAGT	2	10	63165	63174	60 %	20 %	20 %	0 %	16128053
38	NC_000913	GGTGA	2	10	65413	65422	20 %	20 %	60 %	0 %	16128054
39	NC_000913	CAGCG	2	10	66866	66875	20 %	0 %	40 %	40 %	16128056
40	NC_000913	TCGCG	2	10	68136	68145	0 %	20 %	40 %	40 %	16128056
41	NC_000913	GCTGA	2	10	68515	68524	20 %	20 %	40 %	20 %	16128057
42	NC_000913	TAGTG	2	10	75614	75623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000913	GATGG	2	10	76502	76511	20 %	20 %	60 %	0 %	16128063
44	NC_000913	ATTTT	2	10	77330	77339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000913	CTGGA	2	10	78402	78411	20 %	20 %	40 %	20 %	49175994
46	NC_000913	CTGGT	2	10	81695	81704	0 %	40 %	40 %	20 %	90111082
47	NC_000913	GACCG	2	10	82243	82252	20 %	0 %	40 %	40 %	16128068
48	NC_000913	ATGTT	2	10	84792	84801	20 %	60 %	20 %	0 %	90111083
49	NC_000913	AAAAC	2	10	85207	85216	80 %	0 %	0 %	20 %	90111083
50	NC_000913	ATTCC	2	10	85904	85913	20 %	40 %	0 %	40 %	90111084
51	NC_000913	AGTTC	2	10	90997	91006	20 %	40 %	20 %	20 %	16128075
52	NC_000913	CGTGG	2	10	92370	92379	0 %	20 %	60 %	20 %	16128077
53	NC_000913	TATCG	2	10	92877	92886	20 %	40 %	20 %	20 %	16128077
54	NC_000913	GCCTG	2	10	97209	97218	0 %	20 %	40 %	40 %	16128081
55	NC_000913	ACCGT	2	10	99122	99131	20 %	20 %	20 %	40 %	16128082
56	NC_000913	ATCAG	2	10	100895	100904	40 %	20 %	20 %	20 %	16128084
57	NC_000913	AGCCG	2	10	102663	102672	20 %	0 %	40 %	40 %	16128085
58	NC_000913	GCGCA	2	10	104991	105000	20 %	0 %	40 %	40 %	16128087
59	NC_000913	TGGCG	2	10	105985	105994	0 %	20 %	60 %	20 %	16128088
60	NC_000913	CCGGC	2	10	108955	108964	0 %	0 %	40 %	60 %	16128091
61	NC_000913	CGCGG	2	10	112280	112289	0 %	0 %	60 %	40 %	16128095
62	NC_000913	ATCCC	2	10	114524	114533	20 %	20 %	0 %	60 %	16128099
63	NC_000913	CATCG	2	10	114537	114546	20 %	20 %	20 %	40 %	16128099
64	NC_000913	TAACG	2	10	115231	115240	40 %	20 %	20 %	20 %	16128099
65	NC_000913	ATGCC	2	10	115690	115699	20 %	20 %	20 %	40 %	16128099
66	NC_000913	AATGC	2	10	116973	116982	40 %	20 %	20 %	20 %	16128100
67	NC_000913	TCTGT	2	10	117919	117928	0 %	60 %	20 %	20 %	16128102
68	NC_000913	GCATG	2	10	119012	119021	20 %	20 %	40 %	20 %	16128103
69	NC_000913	AGCAG	2	10	120350	120359	40 %	0 %	40 %	20 %	16128105
70	NC_000913	TCAGC	2	10	121218	121227	20 %	20 %	20 %	40 %	16128105
71	NC_000913	CGAAG	2	10	122265	122274	40 %	0 %	40 %	20 %	16128106
72	NC_000913	ACACG	2	10	122398	122407	40 %	0 %	20 %	40 %	16128106
73	NC_000913	TCGCG	2	10	122659	122668	0 %	20 %	40 %	40 %	16128106
74	NC_000913	GCATC	2	10	122749	122758	20 %	20 %	20 %	40 %	16128106
75	NC_000913	GACTG	2	10	124067	124076	20 %	20 %	40 %	20 %	16128107
76	NC_000913	AGAGC	2	10	124477	124486	40 %	0 %	40 %	20 %	16128107
77	NC_000913	AGGCG	2	10	129749	129758	20 %	0 %	60 %	20 %	16128110
78	NC_000913	AGGCG	2	10	129845	129854	20 %	0 %	60 %	20 %	16128110
79	NC_000913	GGTTG	2	10	130502	130511	0 %	40 %	60 %	0 %	16128110
80	NC_000913	TCTGG	2	10	133148	133157	0 %	40 %	40 %	20 %	16128111
81	NC_000913	GGGCA	2	10	134560	134569	20 %	0 %	60 %	20 %	90111086
82	NC_000913	CAGCG	2	10	134839	134848	20 %	0 %	40 %	40 %	16128113
83	NC_000913	GCGCG	2	10	141033	141042	0 %	0 %	60 %	40 %	16128117
84	NC_000913	CCGTC	2	10	141824	141833	0 %	20 %	20 %	60 %	90111088
85	NC_000913	GTGAA	2	10	141834	141843	40 %	20 %	40 %	0 %	90111088
86	NC_000913	GGCAT	2	10	141996	142005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_000913	GTTCA	2	10	142221	142230	20 %	40 %	20 %	20 %	16128119
88	NC_000913	ATCCA	2	10	142547	142556	40 %	20 %	0 %	40 %	16128119
89	NC_000913	GTAAG	2	10	142760	142769	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000913	CTTTA	2	10	143810	143819	20 %	60 %	0 %	20 %	16128121
91	NC_000913	TGGCG	2	10	144037	144046	0 %	20 %	60 %	20 %	16128121
92	NC_000913	TCCTC	2	10	144480	144489	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_000913	TTTCA	2	10	146350	146359	20 %	60 %	0 %	20 %	16128124
94	NC_000913	GGGAG	2	10	147675	147684	20 %	0 %	80 %	0 %	16128125
95	NC_000913	GAAAA	2	10	150469	150478	80 %	0 %	20 %	0 %	16128128
96	NC_000913	CAGAC	2	10	150545	150554	40 %	0 %	20 %	40 %	16128128
97	NC_000913	TTTGC	2	10	156615	156624	0 %	60 %	20 %	20 %	16128134
98	NC_000913	AAATT	2	10	157056	157065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000913	GCGAG	2	10	158423	158432	20 %	0 %	60 %	20 %	162135892
100	NC_000913	GGCGT	2	10	158861	158870	0 %	20 %	60 %	20 %	162135892
101	NC_000913	ATCAG	2	10	159499	159508	40 %	20 %	20 %	20 %	226524698
102	NC_000913	ACCAC	2	10	161764	161773	40 %	0 %	0 %	60 %	90111091
103	NC_000913	GGCGT	2	10	163467	163476	0 %	20 %	60 %	20 %	162135893
104	NC_000913	CGACG	2	10	164506	164515	20 %	0 %	40 %	40 %	162135893
105	NC_000913	CTGCG	2	10	166642	166651	0 %	20 %	40 %	40 %	16128142
106	NC_000913	TTATC	2	10	167418	167427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_000913	AAAAC	2	10	168493	168502	80 %	0 %	0 %	20 %	16128143
108	NC_000913	TGGTT	2	10	168750	168759	0 %	60 %	40 %	0 %	16128143
109	NC_000913	AACCT	2	10	170831	170840	40 %	20 %	0 %	40 %	16128145
110	NC_000913	TGGTC	2	10	170873	170882	0 %	40 %	40 %	20 %	16128145
111	NC_000913	TGGCG	2	10	172118	172127	0 %	20 %	60 %	20 %	16128146
112	NC_000913	CGGCG	2	10	172748	172757	0 %	0 %	60 %	40 %	16128146
113	NC_000913	CGGCG	2	10	172829	172838	0 %	0 %	60 %	40 %	16128146
114	NC_000913	TTCCA	2	10	173359	173368	20 %	40 %	0 %	40 %	16128146
115	NC_000913	GGTCC	2	10	177805	177814	0 %	20 %	40 %	40 %	16128151
116	NC_000913	ACGGG	2	10	179722	179731	20 %	0 %	60 %	20 %	16128153
117	NC_000913	GTGAT	2	10	181881	181890	20 %	40 %	40 %	0 %	16128154
118	NC_000913	GTGAT	2	10	182172	182181	20 %	40 %	40 %	0 %	16128154
119	NC_000913	TACGT	2	10	182417	182426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_000913	TGGCC	2	10	184142	184151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_000913	CCACG	2	10	184319	184328	20 %	0 %	20 %	60 %	90111094
122	NC_000913	GCCAG	2	10	186604	186613	20 %	0 %	40 %	40 %	16128160
123	NC_000913	GTTCT	2	10	188045	188054	0 %	60 %	20 %	20 %	16128160
124	NC_000913	CTGAA	2	10	190037	190046	40 %	20 %	20 %	20 %	16128162
125	NC_000913	AAGCG	2	10	190101	190110	40 %	0 %	40 %	20 %	16128162
126	NC_000913	TGGTG	2	10	192007	192016	0 %	40 %	60 %	0 %	16128164
127	NC_000913	TGCAC	2	10	192133	192142	20 %	20 %	20 %	40 %	16128164
128	NC_000913	TGCGC	2	10	192526	192535	0 %	20 %	40 %	40 %	16128164
129	NC_000913	AAATA	2	10	192748	192757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000913	GTCTG	2	10	192833	192842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_000913	CATGG	2	10	194369	194378	20 %	20 %	40 %	20 %	16128166
132	NC_000913	CAGAT	2	10	195408	195417	40 %	20 %	20 %	20 %	16128167
133	NC_000913	ACTTT	2	10	195541	195550	20 %	60 %	0 %	20 %	16128167
134	NC_000913	GACGT	2	10	199461	199470	20 %	20 %	40 %	20 %	16128170
135	NC_000913	CGACG	2	10	201288	201297	20 %	0 %	40 %	40 %	16128172
136	NC_000913	ATGCC	2	10	203856	203865	20 %	20 %	20 %	40 %	16128175
137	NC_000913	GGATG	2	10	204118	204127	20 %	20 %	60 %	0 %	16128175
138	NC_000913	TGGCC	2	10	205182	205191	0 %	20 %	40 %	40 %	16128177
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144	NC_000913	CGGTT	2	10	223523	223532	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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150	NC_000913	AGGGA	2	10	249694	249703	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000913	CGATG	2	10	250509	250518	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_000913	CGAAT	2	10	292094	292103	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_000913	CTGAT	2	10	293070	293079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_000913	TTCAT	2	10	293602	293611	20 %	60 %	0 %	20 %	16128263
178	NC_000913	AACCC	2	10	296005	296014	40 %	0 %	0 %	60 %	16128266
179	NC_000913	AGCGA	2	10	296154	296163	40 %	0 %	40 %	20 %	16128266
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236	NC_000913	CTTCT	2	10	399356	399365	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
237	NC_000913	GATGG	2	10	401963	401972	20 %	20 %	60 %	0 %	49176017
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249	NC_000913	TGGCG	2	10	428369	428378	0 %	20 %	60 %	20 %	16128393
250	NC_000913	CTTGC	2	10	429013	429022	0 %	40 %	20 %	40 %	16128393
251	NC_000913	TGACC	2	10	430089	430098	20 %	20 %	20 %	40 %	16128394
252	NC_000913	AGTTC	2	10	431200	431209	20 %	40 %	20 %	20 %	16128396
253	NC_000913	GTTTC	2	10	432127	432136	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_000913	CACTT	2	10	432774	432783	20 %	40 %	0 %	40 %	90111129
255	NC_000913	CTCGT	2	10	433048	433057	0 %	40 %	20 %	40 %	16128398
256	NC_000913	CTTTT	2	10	435603	435612	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_000913	GCGCT	2	10	436393	436402	0 %	20 %	40 %	40 %	16128402
258	NC_000913	GGAGT	2	10	438300	438309	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
259	NC_000913	AAGGC	2	10	440446	440455	40 %	0 %	40 %	20 %	16128406
260	NC_000913	TGCCG	2	10	444085	444094	0 %	20 %	40 %	40 %	16128410
261	NC_000913	CGCCA	2	10	445611	445620	20 %	0 %	20 %	60 %	90111133
262	NC_000913	CACAA	2	10	445780	445789	60 %	0 %	0 %	40 %	90111133
263	NC_000913	GGGCA	2	10	445959	445968	20 %	0 %	60 %	20 %	90111133
264	NC_000913	GTGAT	2	10	447077	447086	20 %	40 %	40 %	0 %	16128413
265	NC_000913	CCAGC	2	10	453027	453036	20 %	0 %	20 %	60 %	16128418
266	NC_000913	GTTTT	2	10	454861	454870	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_000913	TCGAT	2	10	457272	457281	20 %	40 %	20 %	20 %	16128422
268	NC_000913	GAAGA	2	10	461441	461450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_000913	CGCAG	2	10	465878	465887	20 %	0 %	40 %	40 %	16128430
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