MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 9669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022579	AGG	2	6	183279	183284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022579	CCT	2	6	183645	183650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_022579	ATT	2	6	183658	183663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022579	TCAA	2	8	183718	183725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_022579	A	7	7	183903	183909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022579	CAT	2	6	183918	183923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022579	CAAA	2	8	183926	183933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_022579	CTC	2	6	184608	184613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_022579	TTA	2	6	184618	184623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022579	TCA	3	9	184673	184681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_022579	TA	3	6	187946	187951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022579	ATT	2	6	187975	187980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022579	GTAAA	2	10	188008	188017	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022579	TTA	2	6	192633	192638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022579	TA	3	6	192661	192666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022579	TAT	2	6	192738	192743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022579	TTAA	2	8	192768	192775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022579	AAAC	2	8	192804	192811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_022579	GGT	2	6	192831	192836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022579	GAT	2	6	192851	192856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022579	ATT	2	6	192874	192879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022579	CGG	2	6	197765	197770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022579	A	6	6	197797	197802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022579	T	6	6	197938	197943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022579	GCC	2	6	197970	197975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_022579	CCT	2	6	198848	198853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_022579	ATTA	2	8	198903	198910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022579	TCA	2	6	198915	198920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_022579	GGAA	2	8	198946	198953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022579	ATT	2	6	199022	199027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022579	AAG	2	6	200487	200492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022579	CTT	2	6	200517	200522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_022579	A	7	7	200549	200555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022579	AT	3	6	200589	200594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022579	T	6	6	200612	200617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022579	ATG	2	6	205835	205840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022579	ATTA	2	8	205870	205877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022579	CTTG	2	8	205893	205900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_022579	TCC	2	6	206781	206786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_022579	A	9	9	209915	209923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022579	TAA	2	6	209969	209974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022579	GCA	2	6	209985	209990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_022579	GAA	2	6	210028	210033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022579	ATG	2	6	210128	210133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022579	T	8	8	210186	210193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022579	GAG	2	6	210194	210199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022579	TTTA	2	8	212807	212814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022579	CTTTT	2	10	212852	212861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
549	NC_022579	GT	3	6	212900	212905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022579	T	7	7	215097	215103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022579	ATTG	2	8	215104	215111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022579	CTGT	2	8	215114	215121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_022579	A	6	6	216333	216338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022579	TTA	2	6	219271	219276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022579	ATT	2	6	219305	219310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022579	AGC	2	6	219365	219370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_022579	TAAA	2	8	219403	219410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022579	ATT	2	6	219420	219425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022579	AAC	2	6	219440	219445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_022579	A	7	7	219468	219474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022579	GT	3	6	219478	219483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022579	TCT	2	6	219530	219535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022579	AAC	2	6	219550	219555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022579	A	7	7	219629	219635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022579	TAC	2	6	219639	219644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022579	TA	3	6	219668	219673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022579	ATG	2	6	219823	219828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022579	A	7	7	219839	219845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022579	TTA	2	6	219862	219867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022579	T	6	6	219910	219915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022579	GAT	2	6	219942	219947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022579	T	9	9	220019	220027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022579	TAA	2	6	220606	220611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022579	ACT	2	6	220629	220634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022579	A	8	8	220688	220695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022579	CAC	2	6	220717	220722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_022579	GCA	2	6	220783	220788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_022579	CAC	2	6	221031	221036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_022579	CAT	2	6	221126	221131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_022579	CAA	2	6	221179	221184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_022579	A	6	6	221192	221197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022579	GGA	2	6	221212	221217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022579	AT	3	6	221532	221537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022579	CTT	2	6	221741	221746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022579	ATT	2	6	221771	221776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022579	AAT	2	6	221813	221818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022579	AGG	2	6	223963	223968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022579	AGC	2	6	225943	225948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_022579	A	6	6	227209	227214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022579	GCC	2	6	227867	227872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_022579	GTT	2	6	227923	227928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022579	TGG	2	6	228508	228513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022579	CAA	2	6	228514	228519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_022579	ACTAC	2	10	229842	229851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
595	NC_022579	AT	3	6	229886	229891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022579	TCA	2	6	229911	229916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022579	TA	3	6	229953	229958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022579	GGTAA	2	10	229999	230008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022579	TGC	2	6	230220	230225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_022579	TGA	2	6	230259	230264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_022579	T	6	6	230597	230602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022579	CAGT	2	8	230612	230619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_022579	A	8	8	243438	243445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022579	GTT	2	6	243492	243497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022579	TGA	2	6	243536	243541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022579	ACT	2	6	243669	243674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_022579	AAT	2	6	243682	243687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022579	TAT	2	6	243701	243706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022579	GACA	2	8	243713	243720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_022579	AAAAT	2	10	243750	243759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022579	TTGT	2	8	244078	244085	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022579	TCAT	2	8	244184	244191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_022579	TC	3	6	244253	244258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_022579	GTA	2	6	244278	244283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022579	CGG	2	6	244321	244326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022579	AAT	2	6	244331	244336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022579	A	7	7	244934	244940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022579	AT	3	6	244944	244949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022579	ATTA	2	8	245004	245011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022579	ACA	2	6	245041	245046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022579	TAA	2	6	247278	247283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022579	ACC	2	6	247284	247289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_022579	CAA	2	6	247507	247512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_022579	GAA	2	6	247570	247575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022579	TA	3	6	248483	248488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022579	GCT	2	6	248516	248521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_022579	ACG	2	6	248612	248617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_022579	G	7	7	248635	248641	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022579	ACG	2	6	249172	249177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_022579	TTACT	2	10	249179	249188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_022579	T	7	7	249213	249219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022579	GGAC	2	8	249292	249299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_022579	CT	3	6	249303	249308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_022579	ACGC	2	8	249410	249417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
636	NC_022579	TGTC	2	8	249456	249463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_022579	A	7	7	249520	249526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022579	TG	3	6	249567	249572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022579	TAT	2	6	249601	249606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022579	TG	3	6	249675	249680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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