MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 9600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022444	GAG	2	6	1083420	1083425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_022444	TCC	2	6	1084338	1084343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_022444	AAC	2	6	1085003	1085008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_022444	ATG	2	6	1087828	1087833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_022444	GAT	2	6	1087876	1087881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_022444	CCCA	2	8	1087903	1087910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3007	NC_022444	CGGC	2	8	1087935	1087942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_022444	TCC	2	6	1087979	1087984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_022444	CGCGC	2	10	1089131	1089140	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3010	NC_022444	GC	3	6	1089143	1089148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_022444	TGCCG	2	10	1089151	1089160	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3012	NC_022444	AG	3	6	1089168	1089173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_022444	CCT	2	6	1089180	1089185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_022444	A	8	8	1089247	1089254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_022444	GTG	2	6	1089293	1089298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_022444	CCA	2	6	1089368	1089373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_022444	GA	3	6	1089385	1089390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_022444	T	6	6	1089426	1089431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_022444	T	7	7	1089444	1089450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_022444	CAG	2	6	1089519	1089524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_022444	G	6	6	1089530	1089535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_022444	CCG	2	6	1089553	1089558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_022444	CCG	2	6	1091203	1091208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_022444	GCG	2	6	1091267	1091272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_022444	GC	3	6	1092318	1092323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_022444	GAG	2	6	1094172	1094177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_022444	GAA	2	6	1094187	1094192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_022444	GAA	2	6	1094232	1094237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_022444	TTC	2	6	1094241	1094246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_022444	ATGAG	2	10	1095186	1095195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_022444	AAC	2	6	1095197	1095202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_022444	AACGA	2	10	1095206	1095215	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3033	NC_022444	GAA	2	6	1095266	1095271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_022444	TTC	2	6	1095275	1095280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_022444	TTC	2	6	1096689	1096694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_022444	GCG	2	6	1096733	1096738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_022444	GCT	2	6	1096792	1096797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_022444	CAA	2	6	1096811	1096816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_022444	T	8	8	1098635	1098642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022444	GAA	2	6	1098733	1098738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_022444	CTTT	2	8	1098740	1098747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_022444	AAC	2	6	1098780	1098785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_022444	GCGCC	2	10	1098817	1098826	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3044	NC_022444	GCCC	2	8	1101930	1101937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3045	NC_022444	GGC	2	6	1101976	1101981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_022444	T	6	6	1102977	1102982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_022444	GCCC	2	8	1102997	1103004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3048	NC_022444	GC	3	6	1103006	1103011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_022444	CGCA	2	8	1103398	1103405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_022444	TTC	2	6	1103460	1103465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_022444	GCC	2	6	1103496	1103501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_022444	A	6	6	1104784	1104789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_022444	GAG	2	6	1104798	1104803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_022444	GAA	2	6	1104822	1104827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_022444	CGT	2	6	1106655	1106660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_022444	TCC	2	6	1107385	1107390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_022444	TGCA	2	8	1107402	1107409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_022444	AC	3	6	1107466	1107471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_022444	AGG	2	6	1107504	1107509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_022444	CGGC	2	8	1107548	1107555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_022444	GCT	2	6	1107562	1107567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_022444	CGG	2	6	1107593	1107598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_022444	CAT	2	6	1107611	1107616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_022444	CAG	2	6	1109218	1109223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_022444	TGA	2	6	1109320	1109325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022444	TCCA	2	8	1109336	1109343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_022444	ATC	2	6	1109348	1109353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_022444	GTG	2	6	1110223	1110228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_022444	CGCC	2	8	1110243	1110250	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3070	NC_022444	GAA	2	6	1110719	1110724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_022444	CGGG	3	12	1110755	1110766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_022444	CTGC	2	8	1110781	1110788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_022444	TCC	3	9	1110838	1110846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_022444	C	7	7	1114706	1114712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3075	NC_022444	C	7	7	1114714	1114720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3076	NC_022444	CCGG	2	8	1114724	1114731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_022444	CCGG	2	8	1114756	1114763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_022444	T	6	6	1114769	1114774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_022444	AC	3	6	1114851	1114856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_022444	CAC	3	9	1114854	1114862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_022444	CAA	2	6	1114880	1114885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_022444	ATTG	2	8	1114969	1114976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_022444	TC	3	6	1116300	1116305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_022444	C	6	6	1116336	1116341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3085	NC_022444	GAT	2	6	1116416	1116421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_022444	CAGC	2	8	1116458	1116465	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_022444	GCC	2	6	1116474	1116479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_022444	CTG	2	6	1116501	1116506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_022444	GCT	2	6	1116507	1116512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_022444	AAAC	2	8	1116518	1116525	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_022444	CG	3	6	1116549	1116554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_022444	GGT	2	6	1116603	1116608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_022444	GTC	2	6	1118121	1118126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_022444	GGA	2	6	1120597	1120602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_022444	TGG	2	6	1124113	1124118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_022444	CAC	2	6	1124132	1124137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_022444	TAC	2	6	1124202	1124207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_022444	TATG	2	8	1124221	1124228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_022444	AGG	2	6	1124354	1124359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_022444	GTCC	2	8	1126107	1126114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_022444	AC	3	6	1126120	1126125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_022444	T	6	6	1126164	1126169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_022444	TGC	2	6	1126184	1126189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_022444	ATTCC	2	10	1126847	1126856	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3105	NC_022444	GCAC	2	8	1126862	1126869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_022444	GCC	2	6	1126874	1126879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_022444	GAT	2	6	1126902	1126907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_022444	GGAG	2	8	1130711	1130718	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_022444	GGGAA	2	10	1130719	1130728	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_022444	GAG	2	6	1131191	1131196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_022444	GTGC	2	8	1131202	1131209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_022444	AGC	3	9	1131247	1131255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_022444	TTC	2	6	1131379	1131384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_022444	TCG	2	6	1134630	1134635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_022444	TTGGA	2	10	1134649	1134658	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_022444	TAT	2	6	1134667	1134672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022444	ACG	2	6	1134698	1134703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_022444	CCG	2	6	1134729	1134734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_022444	C	6	6	1134762	1134767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3120	NC_022444	CTG	2	6	1134773	1134778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_022444	CCCTGG	2	12	1134786	1134797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_022444	CCA	2	6	1134855	1134860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_022444	GAG	2	6	1134887	1134892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022444	GGC	2	6	1134900	1134905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_022444	ATG	2	6	1135068	1135073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_022444	CCA	2	6	1135077	1135082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_022444	GCT	2	6	1135102	1135107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_022444	TGG	2	6	1135137	1135142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_022444	AGG	2	6	1135188	1135193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_022444	GC	3	6	1135200	1135205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_022444	GA	3	6	1135240	1135245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_022444	GAA	2	6	1135296	1135301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_022444	TTC	2	6	1135305	1135310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_022444	AAC	2	6	1135343	1135348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_022444	AGCG	2	8	1135356	1135363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_022444	T	6	6	1136653	1136658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_022444	TGT	2	6	1136722	1136727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_022444	TTG	2	6	1141863	1141868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3145	NC_022444	C	7	7	1142393	1142399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3149	NC_022444	C	9	9	1142499	1142507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3151	NC_022444	C	8	8	1142529	1142536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3152	NC_022444	GGCA	2	8	1142541	1142548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3154	NC_022444	CTGT	2	8	1144827	1144834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3266	NC_022444	GGC	3	9	1189594	1189602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3267	NC_022444	CTG	2	6	1189622	1189627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3268	NC_022444	C	6	6	1189633	1189638	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3270	NC_022444	GGC	2	6	1189696	1189701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_022444	CTG	2	6	1189703	1189708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3278	NC_022444	TGA	2	6	1191314	1191319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3280	NC_022444	G	6	6	1192202	1192207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_022444	GCG	2	6	1192217	1192222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3282	NC_022444	T	6	6	1192245	1192250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3283	NC_022444	CCGC	2	8	1192257	1192264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3284	NC_022444	T	7	7	1193236	1193242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3285	NC_022444	GTT	2	6	1193254	1193259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3291	NC_022444	GT	3	6	1197576	1197581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_022444	GCA	2	6	1197588	1197593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3314	NC_022444	A	8	8	1213359	1213366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3326	NC_022444	G	7	7	1217115	1217121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3327	NC_022444	TGG	2	6	1217122	1217127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3333	NC_022444	A	6	6	1220545	1220550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3342	NC_022444	G	6	6	1222239	1222244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3382	NC_022444	CGG	2	6	1235896	1235901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3388	NC_022444	GCC	2	6	1238611	1238616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3389	NC_022444	GCG	3	9	1238670	1238678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3390	NC_022444	TGT	2	6	1238689	1238694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_022444	CTC	2	6	1238714	1238719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3392	NC_022444	TGCA	2	8	1238767	1238774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3393	NC_022444	CA	3	6	1238773	1238778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3394	NC_022444	GTC	2	6	1239087	1239092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3395	NC_022444	GCA	2	6	1239110	1239115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3396	NC_022444	GC	3	6	1239181	1239186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3397	NC_022444	A	6	6	1239207	1239212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3398	NC_022444	A	7	7	1239246	1239252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_022444	G	6	6	1240790	1240795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3400	NC_022444	T	7	7	1240822	1240828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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