MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi BTF08

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020387	CTTG	2	8	118	125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020387	GGGA	2	8	248	255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020387	TGGC	2	8	5999	6006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020387	CTTT	2	8	12332	12339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020387	AGAT	2	8	12342	12349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020387	AGGG	2	8	12426	12433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020387	TAAA	2	8	12459	12466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020387	AATC	2	8	15572	15579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020387	GCTT	2	8	20640	20647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020387	TAAA	2	8	24865	24872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020387	TATC	2	8	29642	29649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020387	AAAT	2	8	29654	29661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020387	GAAA	2	8	29757	29764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020387	AAAT	2	8	29765	29772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020387	CTTT	2	8	34975	34982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020387	GCGA	2	8	48055	48062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020387	TTCT	2	8	48249	48256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020387	TGGA	2	8	50163	50170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020387	GGTC	2	8	50464	50471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020387	TTCA	2	8	50995	51002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020387	TTAA	2	8	51036	51043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020387	CTTT	2	8	51106	51113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020387	TATC	2	8	58039	58046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020387	AATG	2	8	58158	58165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020387	TTGG	2	8	58930	58937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020387	GATA	2	8	66287	66294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020387	ATAA	2	8	66417	66424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020387	TAAA	2	8	66661	66668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020387	CCCT	2	8	68166	68173	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_020387	GGCT	2	8	69269	69276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020387	TGCG	2	8	75899	75906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020387	GCAG	2	8	77196	77203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020387	AATA	2	8	81136	81143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020387	AAAT	2	8	81768	81775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020387	ATTT	2	8	85601	85608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020387	CTGT	2	8	96260	96267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020387	GGAA	2	8	96269	96276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020387	GCCA	2	8	101357	101364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020387	CTTT	2	8	106733	106740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020387	GTAA	2	8	110934	110941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020387	GGCA	2	8	111124	111131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020387	TATG	2	8	112414	112421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020387	GGAT	2	8	114137	114144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020387	TTTA	2	8	116724	116731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020387	GTCA	2	8	117505	117512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020387	CTTT	2	8	125808	125815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020387	CCTG	2	8	125846	125853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020387	CCCT	2	8	128035	128042	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_020387	TATC	2	8	131402	131409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020387	AATT	2	8	132515	132522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020387	TAAA	2	8	132885	132892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020387	ATTT	2	8	133519	133526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020387	ATAA	2	8	143697	143704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020387	TTTC	2	8	145067	145074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020387	TATT	2	8	145791	145798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020387	AGGA	2	8	146137	146144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020387	TTTG	2	8	148399	148406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020387	TTTC	2	8	149816	149823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020387	TTTC	2	8	152573	152580	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020387	CAAG	2	8	153529	153536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020387	GCCG	2	8	154845	154852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020387	CATC	2	8	166288	166295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020387	CATT	2	8	171513	171520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020387	TAAT	2	8	172139	172146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020387	TTCT	2	8	172189	172196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020387	TATC	2	8	173454	173461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020387	CTCC	2	8	184182	184189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_020387	TCCC	2	8	187385	187392	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_020387	AACT	2	8	187406	187413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020387	TATC	2	8	189716	189723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020387	CCTT	2	8	215325	215332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020387	CCGT	2	8	224671	224678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020387	TTAT	2	8	226880	226887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020387	ATTG	2	8	229190	229197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020387	ATTG	2	8	229216	229223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020387	ATTT	2	8	229317	229324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020387	TGTA	2	8	231229	231236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020387	AAAG	2	8	241663	241670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020387	GCTT	2	8	244689	244696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020387	ATGC	2	8	285977	285984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020387	CCAG	2	8	286094	286101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020387	CAAG	2	8	291350	291357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020387	GGAG	2	8	304060	304067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020387	ATCT	2	8	306572	306579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020387	TGGC	2	8	309835	309842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020387	TAGA	2	8	318273	318280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020387	ATTT	2	8	318343	318350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020387	TGGT	2	8	319075	319082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020387	TAGT	2	8	334434	334441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020387	CATT	2	8	339858	339865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020387	TTTG	2	8	342007	342014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020387	TGGG	2	8	342080	342087	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020387	CGGG	2	8	345997	346004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020387	CAAA	2	8	346035	346042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020387	TAAA	2	8	352817	352824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020387	TCTG	2	8	362631	362638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020387	ATTT	2	8	367074	367081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020387	AGCT	2	8	367140	367147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020387	TGGT	2	8	371163	371170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020387	GCAG	2	8	371301	371308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020387	AAAT	2	8	371347	371354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020387	ATAA	2	8	388922	388929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020387	CAAA	2	8	398797	398804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020387	TAAA	2	8	408420	408427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020387	TCGG	2	8	417599	417606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020387	ATTG	2	8	417799	417806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020387	AATT	2	8	437888	437895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020387	CAGA	2	8	440707	440714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020387	GCCA	2	8	440753	440760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020387	GGGC	2	8	456328	456335	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020387	GGAT	2	8	475016	475023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020387	TAAA	2	8	502768	502775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020387	AGGC	2	8	507764	507771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020387	CAAA	2	8	550822	550829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020387	GGGA	2	8	564854	564861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020387	TCCC	2	8	567548	567555	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_020387	TGGA	2	8	567764	567771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020387	CTTG	2	8	569490	569497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020387	ATTG	2	8	574868	574875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020387	AGGG	2	8	575887	575894	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020387	GTTC	2	8	576071	576078	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020387	TTAT	2	8	582315	582322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020387	CAGG	2	8	584839	584846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020387	CAGA	2	8	598666	598673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020387	GCAA	2	8	612215	612222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020387	CCTG	2	8	619537	619544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020387	TCAG	2	8	619640	619647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020387	CTGC	2	8	621027	621034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020387	GCGG	2	8	623301	623308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020387	TTTA	2	8	623398	623405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020387	GCAA	2	8	625860	625867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020387	TTAA	3	12	625905	625916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020387	TGTT	2	8	625947	625954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020387	CCTT	2	8	632686	632693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020387	GTAG	2	8	635779	635786	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020387	CCCT	2	8	637747	637754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_020387	TAAA	2	8	640343	640350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020387	CACC	2	8	640358	640365	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_020387	CAAG	2	8	644629	644636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020387	TCAC	2	8	644647	644654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020387	TAAT	2	8	647695	647702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020387	CTTT	2	8	648546	648553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020387	TAAA	2	8	649705	649712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020387	TTTA	2	8	649728	649735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020387	TAAC	2	8	650091	650098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020387	GTAA	2	8	652323	652330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020387	AAAT	2	8	659813	659820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020387	GATA	2	8	676852	676859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020387	AATC	2	8	677571	677578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020387	CAAA	2	8	680752	680759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020387	ACCG	2	8	682410	682417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020387	TAAA	2	8	682490	682497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.