MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi BTF08

Total Repeats: 2838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020387	AGG	2	6	27	32	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020387	AG	3	6	61	66	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020387	CTTG	2	8	118	125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020387	GGGA	2	8	248	255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020387	GTT	3	9	1632	1640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020387	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020387	T	6	6	1682	1687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020387	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020387	TTA	4	12	1823	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020387	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020387	ATTTC	2	10	5814	5823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020387	AT	3	6	5839	5844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020387	A	7	7	5886	5892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020387	TGGC	2	8	5999	6006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020387	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020387	TAA	2	6	8225	8230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020387	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020387	TA	4	8	11373	11380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020387	CCT	2	6	11385	11390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020387	CTTT	2	8	12332	12339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020387	AGAT	2	8	12342	12349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020387	CCG	2	6	12356	12361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020387	GAA	2	6	12403	12408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020387	AGGG	2	8	12426	12433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020387	TAAA	2	8	12459	12466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020387	AGC	3	9	13884	13892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020387	GGT	2	6	14821	14826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020387	GGA	2	6	14851	14856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020387	AATC	2	8	15572	15579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020387	AGG	2	6	15587	15592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020387	CAG	2	6	16418	16423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020387	CCT	2	6	18238	18243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020387	A	6	6	18307	18312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020387	CAA	2	6	18392	18397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020387	TC	4	8	18459	18466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020387	TAAAA	2	10	18502	18511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020387	TAG	2	6	18995	19000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020387	AAT	2	6	19015	19020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020387	AT	4	8	19496	19503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020387	T	6	6	19503	19508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020387	AT	3	6	19520	19525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020387	TAATT	2	10	19585	19594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020387	ATC	2	6	19600	19605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020387	T	6	6	19617	19622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020387	TATATC	2	12	19744	19755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020387	A	6	6	19765	19770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020387	TTG	2	6	19815	19820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020387	AGT	2	6	19825	19830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020387	GCTT	2	8	20640	20647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020387	AT	3	6	20652	20657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020387	A	6	6	20689	20694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020387	ATA	2	6	20740	20745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020387	GTT	2	6	20792	20797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020387	TGG	2	6	20804	20809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020387	TAT	2	6	20904	20909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020387	TTA	2	6	20933	20938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020387	TTA	2	6	20971	20976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020387	TTA	2	6	20998	21003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020387	TAG	3	9	21019	21027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020387	AGA	2	6	21103	21108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020387	A	7	7	21166	21172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020387	ATA	2	6	21616	21621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020387	CGG	2	6	21847	21852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020387	TCC	2	6	24751	24756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020387	AT	4	8	24817	24824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020387	GA	3	6	24859	24864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020387	TAAA	2	8	24865	24872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020387	AT	3	6	29488	29493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020387	GT	3	6	29528	29533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020387	GCT	2	6	29567	29572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020387	AAT	2	6	29577	29582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020387	ATG	2	6	29597	29602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020387	GTT	2	6	29603	29608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020387	TATC	2	8	29642	29649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020387	AAAT	2	8	29654	29661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020387	AT	3	6	29660	29665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020387	AT	4	8	29743	29750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020387	GAAA	2	8	29757	29764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020387	AAAT	2	8	29765	29772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020387	AGG	2	6	29789	29794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020387	AT	3	6	32356	32361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020387	CAG	2	6	32493	32498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020387	CTTT	2	8	34975	34982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020387	CGA	2	6	35041	35046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020387	CCT	2	6	35613	35618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020387	ATT	2	6	35648	35653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020387	ATA	2	6	36505	36510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020387	TAT	2	6	36520	36525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020387	TTA	2	6	37034	37039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020387	TAT	2	6	37054	37059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020387	GAA	2	6	37083	37088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020387	AG	3	6	37154	37159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020387	AAC	2	6	37169	37174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020387	TAA	2	6	37179	37184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020387	A	7	7	37187	37193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020387	TTA	2	6	37249	37254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020387	TAA	2	6	37266	37271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020387	AT	4	8	37286	37293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020387	TCC	2	6	39132	39137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_020387	TA	5	10	41938	41947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020387	AGA	2	6	41952	41957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020387	ATT	2	6	41968	41973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020387	TGA	2	6	41987	41992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020387	TATCT	2	10	42013	42022	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020387	GGC	2	6	46333	46338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020387	TCT	2	6	46387	46392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020387	ATG	2	6	46396	46401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020387	A	6	6	47576	47581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020387	ATA	2	6	47643	47648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020387	AG	3	6	47670	47675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020387	TAC	2	6	47785	47790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020387	TGG	2	6	47835	47840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020387	ATT	2	6	48037	48042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020387	TAG	2	6	48047	48052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020387	GCGA	2	8	48055	48062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020387	AAG	2	6	48126	48131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020387	TTCT	2	8	48249	48256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020387	CCG	2	6	48292	48297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020387	TGA	2	6	48325	48330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020387	GAA	2	6	48453	48458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020387	CGA	2	6	48464	48469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020387	AAGCGA	2	12	48512	48523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020387	GTGAA	2	10	48589	48598	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020387	GTT	2	6	48640	48645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020387	GA	3	6	48771	48776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020387	AGC	2	6	48954	48959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020387	GTG	2	6	48996	49001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020387	AAC	2	6	49107	49112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020387	CAG	2	6	49263	49268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020387	TTA	2	6	49270	49275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020387	CAC	2	6	49282	49287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_020387	G	6	6	49303	49308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020387	AGG	2	6	49313	49318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020387	TGG	2	6	49409	49414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020387	GA	3	6	49423	49428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020387	GAG	2	6	49725	49730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020387	CGG	2	6	49769	49774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020387	AAC	2	6	49844	49849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020387	TGG	2	6	50019	50024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020387	TGG	2	6	50094	50099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020387	CCT	2	6	50121	50126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_020387	TGGA	2	8	50163	50170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020387	TCG	2	6	50372	50377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020387	CGT	2	6	50452	50457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020387	GGTC	2	8	50464	50471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020387	CGT	2	6	50478	50483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020387	GT	3	6	50548	50553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020387	GTT	2	6	50556	50561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020387	GT	3	6	50706	50711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020387	TGG	2	6	50867	50872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020387	ACC	2	6	50888	50893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_020387	TCCCG	2	10	50897	50906	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_020387	AGG	2	6	50944	50949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020387	TTAA	2	8	51036	51043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_020387	CTTT	2	8	51106	51113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_020387	TAA	2	6	51126	51131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_020387	TAAAA	2	10	53699	53708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020387	A	6	6	53779	53784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020387	TGC	2	6	53861	53866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_020387	ATT	2	6	53930	53935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020387	TCT	2	6	54018	54023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_020387	TATC	2	8	58039	58046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_020387	CCA	2	6	58124	58129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_020387	GA	3	6	58294	58299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020387	GTT	2	6	58300	58305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_020387	TA	3	6	58363	58368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020387	AGT	2	6	58454	58459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020387	CA	3	6	58477	58482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_020387	GAA	2	6	58981	58986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_020387	TGG	2	6	106677	106682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_020387	TAT	2	6	106710	106715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020387	CTTT	2	8	106733	106740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
285	NC_020387	TTA	2	6	106825	106830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_020387	ATT	2	6	106847	106852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020387	ATA	2	6	106853	106858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020387	AAT	2	6	106860	106865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020387	ATA	2	6	110382	110387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020387	GGA	2	6	110400	110405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_020387	GTA	2	6	111021	111026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_020387	ATT	2	6	171194	171199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_020387	AT	3	6	173555	173560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_020387	ATA	2	6	173563	173568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_020387	AT	3	6	173585	173590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_020387	TCC	2	6	177869	177874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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467	NC_020387	TAAATA	2	12	184394	184405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_020387	TC	3	6	186801	186806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_020387	AACT	2	8	187406	187413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_020387	TAT	2	6	187425	187430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_020387	TAA	2	6	187440	187445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_020387	GTT	2	6	189653	189658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
490	NC_020387	T	6	6	189668	189673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_020387	AC	3	6	189687	189692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_020387	TATC	2	8	189716	189723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
493	NC_020387	AT	3	6	189729	189734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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