MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020386	AAGCGA	2	12	48597	48608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020386	CCGGTG	2	12	89811	89822	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020386	AAAAAG	2	12	174375	174386	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020386	AAGGCA	2	12	242124	242135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020386	TTTAAA	2	12	247733	247744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020386	GTTTCA	2	12	269277	269288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020386	TATGAG	2	12	269571	269582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020386	ATTAGT	2	12	281571	281582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020386	CCTTAC	2	12	284681	284692	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020386	CAACGT	2	12	295918	295929	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020386	GGGCGG	2	12	376989	377000	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020386	CTTAGC	2	12	440215	440226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020386	ACTATA	2	12	712942	712953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020386	TATGAT	2	12	827334	827345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020386	TAACAC	2	12	915668	915679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020386	TCAGTG	2	12	916545	916556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020386	AAATAT	2	12	983954	983965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020386	ACATAC	2	12	1122568	1122579	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020386	ATTTTT	2	12	1128624	1128635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020386	GGAGGG	2	12	1178137	1178148	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020386	AAAACC	2	12	1182503	1182514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020386	ACCCCC	2	12	1233706	1233717	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_020386	AAAAAC	2	12	1248928	1248939	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020386	AATCAA	2	12	1278283	1278294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020386	TAGTGG	2	12	1298688	1298699	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020386	TTTGCC	2	12	1299106	1299117	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020386	TAGCTA	2	12	1299197	1299208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020386	CTCTAT	2	12	1309383	1309394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020386	AACCCT	2	12	1320290	1320301	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020386	GTGAGC	2	12	1352918	1352929	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020386	GATTAA	2	12	1360072	1360083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020386	AATTTC	2	12	1361069	1361080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020386	ATCTAT	2	12	1402168	1402179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.