MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020386	ATTTC	2	10	5816	5825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020386	TAAAA	2	10	18503	18512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020386	TATCT	2	10	42098	42107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020386	GTGAA	2	10	48674	48683	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020386	TCCCG	2	10	50982	50991	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_020386	GCTTT	2	10	51070	51079	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020386	TAAAA	2	10	53784	53793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020386	GAATT	2	10	75043	75052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020386	CTAAA	2	10	83286	83295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020386	CTTGT	2	10	97467	97476	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020386	AAAAC	2	10	105697	105706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020386	TAATT	2	10	112703	112712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020386	TAAAT	2	10	112821	112830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020386	TTTTG	2	10	127103	127112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020386	GTAAA	2	10	149392	149401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020386	AAATG	2	10	149586	149595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020386	TTTTA	2	10	193023	193032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020386	AGGTG	2	10	193073	193082	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020386	TAAGC	2	10	198287	198296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020386	CAAAT	2	10	251317	251326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020386	ATTTA	2	10	264172	264181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020386	ACCAG	2	10	292589	292598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020386	GTTTA	2	10	296573	296582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020386	GAAAA	2	10	296812	296821	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020386	ATTAG	2	10	368757	368766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020386	AGTCA	2	10	407257	407266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020386	TGTTT	2	10	422489	422498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020386	ATAAA	2	10	436918	436927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020386	TTGAC	2	10	454315	454324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020386	TTTTC	2	10	459190	459199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020386	GGGCA	2	10	461338	461347	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020386	TACAA	2	10	464343	464352	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020386	TTTTA	2	10	467755	467764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020386	ATAGC	2	10	482972	482981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020386	GGGTA	2	10	489401	489410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020386	ATTTA	2	10	580368	580377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020386	AAATA	2	10	596350	596359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020386	ATATT	2	10	639339	639348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020386	CCCGA	2	10	641046	641055	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_020386	TATCT	2	10	677525	677534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020386	GGCAG	2	10	677931	677940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020386	TTTAA	2	10	691728	691737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020386	ACTAA	2	10	701018	701027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020386	GCTAA	2	10	705890	705899	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020386	ATTGG	2	10	710304	710313	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020386	CTAAA	2	10	713111	713120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_020386	TATAG	2	10	715133	715142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020386	CTTTT	2	10	717704	717713	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020386	AGTAT	2	10	721819	721828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020386	TAAAT	2	10	747904	747913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020386	TTATA	2	10	791065	791074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020386	TTTTA	2	10	794707	794716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020386	TTGCC	2	10	799822	799831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020386	ATATT	2	10	823911	823920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020386	TATAA	2	10	827272	827281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020386	TTTCA	2	10	840045	840054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020386	CAAAC	2	10	861574	861583	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020386	CTTTA	2	10	862279	862288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020386	CCTGT	2	10	870258	870267	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_020386	ACAGA	2	10	907750	907759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020386	TAAAC	2	10	910302	910311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020386	TGACG	2	10	915901	915910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020386	ATATT	2	10	923740	923749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020386	GGGAC	2	10	933345	933354	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020386	GCCCC	2	10	933424	933433	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
66	NC_020386	AAACC	2	10	947956	947965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_020386	ACCCC	2	10	963005	963014	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_020386	AACTA	2	10	991795	991804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020386	TTTAA	2	10	996556	996565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020386	TTGGG	2	10	996911	996920	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020386	GCGGT	2	10	1000069	1000078	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020386	AACGC	2	10	1026435	1026444	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020386	ATAAA	2	10	1061628	1061637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020386	TATAA	2	10	1081675	1081684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020386	TCCGG	2	10	1086035	1086044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_020386	CTGCC	2	10	1086168	1086177	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_020386	TAGCA	2	10	1102618	1102627	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020386	AATAC	2	10	1108718	1108727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020386	AGAAT	2	10	1108799	1108808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020386	AAAAG	2	10	1108809	1108818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020386	TTATA	2	10	1111600	1111609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020386	TACTA	2	10	1119114	1119123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020386	CAGGT	2	10	1121713	1121722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020386	AGACT	2	10	1124714	1124723	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020386	GAATT	2	10	1128660	1128669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020386	ATAAA	2	10	1147478	1147487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020386	TGAAA	2	10	1191982	1191991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020386	AATCT	2	10	1240469	1240478	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020386	ATTAT	2	10	1262188	1262197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020386	ATATT	2	10	1262232	1262241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020386	ACAAG	2	10	1272775	1272784	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020386	AAATG	2	10	1280598	1280607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020386	TAATT	2	10	1280637	1280646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020386	TACTA	2	10	1288262	1288271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020386	TGACT	2	10	1296184	1296193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020386	AATCC	2	10	1296476	1296485	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020386	ATATT	2	10	1304477	1304486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020386	TAAAA	2	10	1316191	1316200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020386	AACTC	2	10	1331813	1331822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_020386	AACCC	2	10	1336586	1336595	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_020386	TAAGC	2	10	1337647	1337656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020386	AAAAT	2	10	1341807	1341816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020386	CTTTC	2	10	1357378	1357387	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020386	TAAAG	2	10	1357517	1357526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020386	AACTG	2	10	1370778	1370787	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020386	GCCAT	2	10	1386324	1386333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_020386	CTATA	2	10	1390746	1390755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020386	TATTT	2	10	1409375	1409384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.