MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 1347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	ACTT	2	8	9097	9104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020055	TGTT	2	8	9203	9210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020055	AATA	2	8	11308	11315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020055	TCCC	2	8	11501	11508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_020055	ATTT	2	8	17495	17502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020055	TTTA	2	8	17695	17702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020055	ATTT	2	8	19990	19997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020055	TAAT	2	8	20876	20883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020055	ATTT	2	8	20964	20971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020055	TTCG	2	8	21011	21018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020055	AATA	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020055	ATTA	2	8	28415	28422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020055	AATA	2	8	36516	36523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020055	ATTA	2	8	40089	40096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020055	TAAT	2	8	40179	40186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020055	TTAA	2	8	40902	40909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020055	GGGA	2	8	43030	43037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020055	TAAA	2	8	43196	43203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020055	GGGA	2	8	43423	43430	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020055	GCAA	2	8	43641	43648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020055	GAAT	2	8	49958	49965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020055	TTAA	2	8	49976	49983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020055	TGCT	2	8	56971	56978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020055	AGGG	2	8	61305	61312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020055	TTTA	2	8	64945	64952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020055	GTAT	2	8	69759	69766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020055	TGTT	2	8	69827	69834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020055	GATT	2	8	70421	70428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020055	TATT	2	8	75470	75477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020055	TCAA	2	8	75530	75537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020055	GCTG	2	8	77567	77574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020055	GGAT	2	8	77619	77626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020055	TTAT	2	8	77728	77735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020055	AAGA	2	8	77765	77772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020055	ATTC	2	8	77864	77871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020055	TTTG	2	8	81267	81274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020055	ATCA	2	8	85925	85932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020055	GGGT	2	8	86155	86162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020055	AAGT	2	8	94099	94106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020055	GTAT	2	8	98527	98534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020055	TGTT	2	8	105324	105331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020055	GGGC	2	8	106739	106746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020055	AATA	2	8	118979	118986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020055	AAAT	2	8	119692	119699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020055	TGGC	2	8	119969	119976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020055	ATAG	2	8	120022	120029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020055	TAAA	2	8	120064	120071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020055	TTGC	2	8	128563	128570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020055	ATTA	2	8	128575	128582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020055	TAAA	2	8	128648	128655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020055	CCCT	2	8	128657	128664	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_020055	TTTA	2	8	128681	128688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020055	TCAG	2	8	133572	133579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020055	GATT	2	8	149403	149410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020055	CTGA	2	8	149422	149429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020055	TGTT	2	8	151232	151239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020055	TAAA	2	8	151403	151410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020055	AATT	2	8	156301	156308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020055	TAAA	2	8	164405	164412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020055	ACTG	2	8	164414	164421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020055	AGGA	2	8	165150	165157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020055	AACG	2	8	166925	166932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020055	CAAA	2	8	168817	168824	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020055	GACA	2	8	169960	169967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020055	ATTG	2	8	170743	170750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020055	ATTT	2	8	177621	177628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020055	ATTT	2	8	179731	179738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020055	TAAA	2	8	183164	183171	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020055	TCAA	2	8	183718	183725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020055	CAAA	2	8	183926	183933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020055	TTAA	2	8	192768	192775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020055	AAAC	2	8	192804	192811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020055	ATTA	2	8	198903	198910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020055	GGAA	2	8	198946	198953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020055	ATTA	2	8	205870	205877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020055	CTTG	2	8	205893	205900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020055	TTTA	2	8	212807	212814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020055	ATTG	2	8	215104	215111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020055	CTGT	2	8	215114	215121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020055	TAAA	2	8	219403	219410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020055	CAGT	2	8	230612	230619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020055	GACA	2	8	243713	243720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020055	TTGT	2	8	244078	244085	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020055	TCAT	2	8	244184	244191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020055	ATTA	2	8	245004	245011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020055	GGAC	2	8	249292	249299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020055	ACGC	2	8	249410	249417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020055	TGTC	2	8	249456	249463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020055	GTTC	2	8	255685	255692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020055	TATG	2	8	268447	268454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020055	GTAA	2	8	274527	274534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020055	TTTG	2	8	277080	277087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020055	GGCT	2	8	277101	277108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020055	CTTT	2	8	277245	277252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020055	TAAT	2	8	277405	277412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020055	ATAA	2	8	279450	279457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020055	AAAT	2	8	279493	279500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020055	TGAT	2	8	279598	279605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020055	GGGA	2	8	283183	283190	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020055	ACAA	2	8	284095	284102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020055	TCGG	2	8	284451	284458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020055	GGGA	2	8	284590	284597	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020055	GGGA	2	8	284944	284951	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020055	AAGC	2	8	285433	285440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020055	GGTA	2	8	285477	285484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020055	ATGG	2	8	285516	285523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020055	TCCC	2	8	285574	285581	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_020055	GACA	2	8	285690	285697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020055	CAGA	2	8	285989	285996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020055	AAAG	2	8	313431	313438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020055	GCTC	2	8	323509	323516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020055	TCAT	2	8	323532	323539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020055	AAGG	2	8	324113	324120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020055	AATA	2	8	328991	328998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020055	ATTT	2	8	335892	335899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020055	AGGT	2	8	336083	336090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020055	TTAC	2	8	341159	341166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020055	AAGG	2	8	342130	342137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020055	AATA	2	8	344325	344332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020055	ATTG	2	8	346599	346606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020055	AGTA	2	8	347077	347084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020055	CATC	2	8	349494	349501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020055	AAAT	2	8	349706	349713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020055	CATA	2	8	358591	358598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020055	ATTT	2	8	360505	360512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020055	TTTC	2	8	363188	363195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020055	CAAA	2	8	365246	365253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020055	GCAG	2	8	366631	366638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020055	CGTC	2	8	366694	366701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020055	TTTA	2	8	372611	372618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020055	TTCT	2	8	372882	372889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020055	TTTA	2	8	373646	373653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020055	TCCC	2	8	378111	378118	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_020055	TAGC	2	8	383332	383339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020055	ATCC	2	8	388137	388144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020055	TAGA	2	8	388179	388186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020055	TTTA	2	8	389985	389992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020055	GCAA	2	8	401128	401135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020055	ATAA	2	8	401177	401184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020055	ATGC	2	8	404631	404638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020055	AAAT	2	8	404662	404669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020055	TAAA	2	8	405516	405523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020055	TACC	2	8	410867	410874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020055	GGCG	2	8	416202	416209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020055	CCCT	2	8	419557	419564	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_020055	TACC	2	8	420080	420087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020055	ATTA	2	8	420355	420362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020055	ACAG	2	8	420702	420709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020055	GACG	2	8	424071	424078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020055	TTAT	2	8	424144	424151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020055	CTTT	2	8	426348	426355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020055	ATTA	2	8	445143	445150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_020055	ACAG	2	8	1461812	1461819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_020055	CTGC	2	8	1506652	1506659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_020055	GAAT	2	8	1516646	1516653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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