MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	CAACAC	2	12	13703	13714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019793	GCTGAA	2	12	67543	67554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019793	GCACAC	2	12	75597	75608	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019793	CCGTGT	2	12	75640	75651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019793	CCGGAG	2	12	136074	136085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019793	CCCTTG	2	12	148577	148588	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019793	CCCAGC	2	12	177151	177162	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019793	GGCAGG	2	12	363742	363753	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019793	ATTTTA	2	12	449243	449254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019793	GATTAA	2	12	461076	461087	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019793	GTGTTG	2	12	593291	593302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019793	CGTCCG	2	12	610072	610083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019793	GTTAAA	2	12	626201	626212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019793	AGGTGA	2	12	629718	629729	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019793	GGTCGA	2	12	649831	649842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019793	ATAGCC	2	12	650292	650303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019793	CGGGAG	2	12	688607	688618	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019793	TCACCC	2	12	696104	696115	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_019793	GTCGCG	2	12	715641	715652	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019793	GTCGAG	2	12	764219	764230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019793	GACCGG	2	12	792328	792339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019793	CAAGTT	2	12	799152	799163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019793	TCCCTT	2	12	880643	880654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019793	ACGTGT	2	12	881865	881876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019793	GTCGAT	2	12	908554	908565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019793	ATCAAA	2	12	954229	954240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019793	CCCCCT	2	12	1068849	1068860	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
28	NC_019793	AGGGGG	2	12	1068872	1068883	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019793	GCCACC	2	12	1072057	1072068	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019793	CTTCCT	2	12	1161943	1161954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019793	GCACCT	2	12	1179014	1179025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019793	CGGCTC	2	12	1189381	1189392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019793	TTGAAT	2	12	1197797	1197808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019793	TTTATT	2	12	1216226	1216237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019793	GGTGCA	2	12	1245796	1245807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019793	TCCCCC	2	12	1247122	1247133	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
37	NC_019793	CACCCT	2	12	1251703	1251714	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019793	CGACTT	2	12	1253328	1253339	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019793	AATGTT	2	12	1312166	1312177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019793	GGAAGC	2	12	1345939	1345950	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019793	TCACCG	2	12	1391227	1391238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019793	CCCTGC	2	12	1404868	1404879	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019793	GCCCTC	2	12	1413313	1413324	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019793	TCATTT	2	12	1422847	1422858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019793	CTTGCT	2	12	1448409	1448420	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019793	CTGGTG	2	12	1487922	1487933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019793	GCACCG	2	12	1494894	1494905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019793	CTGGTG	2	12	1566157	1566168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019793	GCAGAG	2	12	1587015	1587026	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019793	CTCGCC	2	12	1708733	1708744	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019793	AGGCCG	2	12	1708906	1708917	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019793	TCGGGT	2	12	1718835	1718846	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019793	GTTCGT	2	12	1724635	1724646	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019793	ATTCGA	2	12	1726060	1726071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019793	ATTGCC	2	12	1728625	1728636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019793	TGAGGA	2	12	1785350	1785361	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019793	CACCCG	2	12	1808949	1808960	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019793	GGAAGG	2	12	1820412	1820423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019793	CCTGCA	2	12	1869823	1869834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019793	TCCATG	2	12	1886485	1886496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019793	CAGCAC	2	12	1898710	1898721	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019793	CGACCG	2	12	1902489	1902500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019793	GCTGAA	2	12	1902930	1902941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019793	GAGGTG	2	12	1903708	1903719	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019793	CGCTGG	2	12	1903920	1903931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019793	TCATGC	2	12	1971988	1971999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019793	CTGGCG	3	18	1988567	1988584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019793	TTCATG	2	12	2021631	2021642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019793	GAAAAG	2	12	2037402	2037413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019793	TCCGCG	2	12	2038512	2038523	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019793	GGAATA	2	12	2042693	2042704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019793	ACCCGC	2	12	2075448	2075459	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019793	CATCCT	2	12	2133828	2133839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019793	GCGCCT	2	12	2137947	2137958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019793	GGATCA	2	12	2140951	2140962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019793	CGACCC	2	12	2142991	2143002	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019793	GCCCAG	2	12	2154703	2154714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019793	GCTGCC	2	12	2221578	2221589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019793	GCCGGC	2	12	2283842	2283853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019793	CGCCGA	2	12	2379644	2379655	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019793	GTGTGG	2	12	2395001	2395012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019793	GAGAAA	2	12	2399100	2399111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019793	TGTGCG	2	12	2450552	2450563	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019793	TTGCGG	2	12	2525973	2525984	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019793	GCACCT	2	12	2639036	2639047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019793	TGAGAA	2	12	2651765	2651776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019793	CTCCCC	2	12	2698226	2698237	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_019793	TGTCCG	2	12	2748860	2748871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019793	CTTCAA	2	12	2780666	2780677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019793	ACACCC	2	12	2871224	2871235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019793	TGGGTC	2	12	2915366	2915377	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019793	CAAAGC	2	12	2923854	2923865	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019793	GGCCCG	2	12	2929935	2929946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019793	GGTCTG	2	12	2961552	2961563	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019793	CCAGCA	2	12	2994298	2994309	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019793	CGCCTA	2	12	3045517	3045528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019793	TGCCCT	2	12	3073498	3073509	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019793	GACGAG	2	12	3099410	3099421	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019793	CTCGTC	2	12	3099428	3099439	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019793	TCGAAC	2	12	3166789	3166800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019793	GTTACT	2	12	3170722	3170733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019793	GAATGC	2	12	3176837	3176848	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019793	GGTGGA	2	12	3311073	3311084	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019793	GCATTG	2	12	3343164	3343175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019793	CTCATC	2	12	3417253	3417264	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019793	GCGCAG	2	12	3430079	3430090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019793	GTCCCG	2	12	3518860	3518871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019793	GCTGAG	2	12	3526660	3526671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019793	GGAACC	2	12	3548344	3548355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019793	CCCAGG	2	12	3621560	3621571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019793	GGGGCA	2	12	3728126	3728137	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019793	GCCCCT	2	12	3728146	3728157	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019793	CGGGCG	2	12	3732905	3732916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019793	TTCCAT	2	12	3780066	3780077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019793	ACCGGC	2	12	3792530	3792541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019793	GTTGAG	2	12	3829112	3829123	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019793	CCGGTG	2	12	3841434	3841445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019793	CAACGC	2	12	3855083	3855094	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019793	CCCCGA	2	12	3877003	3877014	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.