MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	CAGGA	2	10	12	21	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019793	AAGCG	2	10	3537	3546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019793	CTCCC	2	10	16059	16068	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_019793	GCGCA	2	10	26729	26738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019793	CGGGC	2	10	29350	29359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019793	GAGCG	2	10	29706	29715	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019793	CTCAT	2	10	56379	56388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019793	CGGCC	2	10	68419	68428	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_019793	GGAAA	2	10	69918	69927	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019793	CATCC	2	10	75987	75996	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_019793	CACTC	2	10	76057	76066	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019793	AGGCC	2	10	86443	86452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019793	TCACA	2	10	87039	87048	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019793	CGCCC	2	10	88417	88426	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_019793	CAGAA	2	10	88553	88562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019793	GCACT	2	10	89025	89034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019793	CTGAA	2	10	100606	100615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019793	CGGCC	2	10	110043	110052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_019793	GCTCT	2	10	122140	122149	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019793	TCAAA	2	10	129694	129703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019793	GAGCG	2	10	131406	131415	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019793	GCAAA	2	10	138595	138604	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019793	GTAAA	2	10	155998	156007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019793	GGAGC	2	10	158661	158670	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019793	ATCAG	2	10	160835	160844	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019793	CCCGG	2	10	164097	164106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_019793	AGGCC	2	10	164121	164130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019793	CTTTT	2	10	170971	170980	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019793	AAGCG	2	10	173539	173548	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019793	AACCA	2	10	174536	174545	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019793	TGACC	2	10	175647	175656	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019793	TTGCT	2	10	177751	177760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019793	GCAAA	2	10	177978	177987	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019793	ACGCT	2	10	193697	193706	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019793	TAGCG	2	10	196801	196810	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019793	GCGCG	2	10	197840	197849	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019793	AGGAA	2	10	222449	222458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019793	TTCAG	2	10	222488	222497	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019793	AGTGC	2	10	222511	222520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019793	ACCGC	2	10	223128	223137	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_019793	CCGCA	2	10	256110	256119	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_019793	CCCGG	2	10	263041	263050	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_019793	TGGCC	2	10	274252	274261	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_019793	CACTT	2	10	286706	286715	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019793	CGCGT	2	10	295122	295131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019793	CGCGC	2	10	300628	300637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_019793	CCTCG	2	10	309134	309143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_019793	CAGGG	2	10	309629	309638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019793	CGGTT	2	10	309716	309725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019793	CCTCA	2	10	310383	310392	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_019793	GTGCT	2	10	316515	316524	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019793	AGCCA	2	10	325326	325335	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019793	CCGAG	2	10	339055	339064	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019793	CGGGC	2	10	346073	346082	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019793	GCCGG	2	10	357240	357249	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019793	GCCCG	2	10	358379	358388	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_019793	CAAAC	2	10	374754	374763	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_019793	TGACC	2	10	379986	379995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019793	CGCGC	2	10	399070	399079	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_019793	CCCGG	2	10	423550	423559	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_019793	GTTCG	2	10	431405	431414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019793	CTGCC	2	10	438939	438948	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_019793	GGGCG	2	10	447010	447019	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019793	GCAAA	2	10	447118	447127	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019793	GCTCT	2	10	447153	447162	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019793	GCCGA	2	10	447308	447317	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_019793	AAAGC	2	10	453032	453041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019793	GCGTC	2	10	456138	456147	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019793	ACAAA	2	10	457173	457182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019793	CGCTT	2	10	459761	459770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019793	GCTCG	2	10	465525	465534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_019793	GTATA	2	10	476086	476095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019793	GAACG	2	10	478553	478562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019793	TCAAG	2	10	485506	485515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019793	CGGGG	2	10	514971	514980	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019793	CTCGT	2	10	520524	520533	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_019793	ACGCC	2	10	525534	525543	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_019793	AAGGA	2	10	538816	538825	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019793	CTGCC	2	10	564396	564405	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_019793	GTAAG	2	10	584656	584665	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019793	ACCCG	2	10	588829	588838	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_019793	CGGTG	2	10	591323	591332	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019793	CGGTC	2	10	591447	591456	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_019793	CGATC	2	10	599110	599119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_019793	GAGCA	2	10	599619	599628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019793	TGCCC	2	10	611565	611574	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_019793	AGGAA	2	10	611654	611663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019793	GCTTC	2	10	622229	622238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019793	GTTAG	2	10	626292	626301	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019793	CGGCG	2	10	629064	629073	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019793	GGTGC	2	10	632917	632926	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019793	CTTCA	2	10	639364	639373	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019793	GGCCG	2	10	648675	648684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_019793	CGCTG	2	10	650465	650474	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_019793	GGCGC	2	10	650727	650736	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019793	TGCGC	2	10	651073	651082	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019793	CACGC	2	10	657532	657541	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_019793	CTTCG	2	10	657702	657711	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019793	GCTGC	2	10	668730	668739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019793	CGCAC	2	10	674011	674020	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_019793	GTGCT	2	10	676352	676361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019793	GCAAA	2	10	681600	681609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019793	GTTGG	2	10	684082	684091	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019793	AGCAG	2	10	691071	691080	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019793	TAGGG	2	10	691517	691526	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019793	TGACC	2	10	693977	693986	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019793	GGACC	2	10	694458	694467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019793	CCTGG	2	10	694662	694671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019793	CCTGG	2	10	697936	697945	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019793	GACCT	2	10	701614	701623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019793	TCGCG	2	10	701632	701641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_019793	ACAAA	2	10	704384	704393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019793	ATTAC	2	10	704727	704736	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019793	TTGCT	2	10	711268	711277	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019793	ACGGT	2	10	714373	714382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019793	CCTGG	2	10	731447	731456	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_019793	AGATG	2	10	745791	745800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019793	ATGCT	2	10	756133	756142	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019793	GGCCG	2	10	776913	776922	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019793	GAACT	2	10	783020	783029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019793	TGGGC	2	10	788739	788748	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019793	TTGGC	2	10	794027	794036	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019793	TCGCT	2	10	827721	827730	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019793	GCCGG	2	10	835023	835032	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019793	TTTTC	2	10	841620	841629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019793	GCCGT	2	10	841655	841664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019793	AACCA	2	10	841688	841697	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_019793	CACAG	2	10	841744	841753	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_019793	AGGCC	2	10	860652	860661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019793	CACGA	2	10	861810	861819	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019793	CCCTG	2	10	871488	871497	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_019793	GGTCG	2	10	879179	879188	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019793	GTTCA	2	10	880493	880502	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019793	CATGC	2	10	880557	880566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_019793	TCTCC	2	10	882264	882273	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_019793	CCCAG	2	10	882866	882875	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_019793	CGCTC	2	10	886045	886054	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_019793	GTCAT	2	10	887158	887167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019793	GCTGG	2	10	910165	910174	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019793	CCTCG	2	10	910735	910744	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_019793	GCGTC	2	10	922339	922348	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019793	CCACA	2	10	935285	935294	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_019793	CATCA	2	10	956871	956880	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_019793	TCAGC	2	10	974201	974210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_019793	CTGCG	2	10	985056	985065	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019793	CGGGG	2	10	989487	989496	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019793	CTTTT	2	10	998758	998767	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_019793	CGCGC	2	10	2804908	2804917	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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491	NC_019793	CTTCA	2	10	3134305	3134314	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
492	NC_019793	TGCTT	2	10	3134372	3134381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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498	NC_019793	GAGCG	2	10	3170952	3170961	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
499	NC_019793	GGAAT	2	10	3170987	3170996	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
500	NC_019793	GACGT	2	10	3174069	3174078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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