MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 15517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019780	TTAAT	2	10	1183491	1183500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019780	A	6	6	1184204	1184209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019780	CAA	3	9	1185985	1185993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_019780	CAA	4	12	1186130	1186141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019780	TGT	2	6	1186154	1186159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019780	GA	3	6	1186181	1186186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_019780	GTA	2	6	1187311	1187316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_019780	GCGCT	2	10	1187436	1187445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5009	NC_019780	CTT	2	6	1187495	1187500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_019780	A	6	6	1187541	1187546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_019780	A	7	7	1187586	1187592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019780	ATC	2	6	1187614	1187619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_019780	G	6	6	1187620	1187625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_019780	GAAACT	2	12	1187636	1187647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5015	NC_019780	TTAG	2	8	1187670	1187677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019780	ATA	2	6	1187692	1187697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019780	AAAG	2	8	1187740	1187747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019780	AAG	2	6	1187828	1187833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_019780	T	6	6	1189879	1189884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_019780	TTC	2	6	1191022	1191027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_019780	ATC	2	6	1191029	1191034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_019780	TAAT	2	8	1191045	1191052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019780	TCT	2	6	1191087	1191092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_019780	TTAA	2	8	1191123	1191130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019780	AATA	2	8	1193539	1193546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019780	TCAA	2	8	1193571	1193578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_019780	ATC	2	6	1193669	1193674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5029	NC_019780	TTA	2	6	1193790	1193795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019780	A	7	7	1193828	1193834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019780	A	6	6	1193839	1193844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_019780	TAAT	2	8	1193861	1193868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019780	TAA	3	9	1193878	1193886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_019780	AATTA	2	10	1193898	1193907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_019780	TAA	2	6	1193950	1193955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_019780	CAAAG	2	10	1193966	1193975	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5037	NC_019780	TAG	2	6	1194870	1194875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_019780	A	6	6	1194998	1195003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_019780	TAA	2	6	1195004	1195009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_019780	TTGT	2	8	1196435	1196442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019780	AACT	2	8	1196600	1196607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_019780	C	6	6	1197867	1197872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5043	NC_019780	G	6	6	1197880	1197885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019780	G	6	6	1197889	1197894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_019780	G	6	6	1197914	1197919	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5048	NC_019780	G	6	6	1197957	1197962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_019780	G	6	6	1197982	1197987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_019780	G	6	6	1197991	1197996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019780	G	6	6	1198016	1198021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_019780	ATTG	2	8	1198113	1198120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_019780	AGCA	2	8	1198191	1198198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_019780	GAA	2	6	1198201	1198206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_019780	AGTG	2	8	1199155	1199162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019780	ATTA	2	8	1199214	1199221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019780	ATTG	2	8	1199298	1199305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019780	ATCA	2	8	1199336	1199343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_019780	ACCA	2	8	1199390	1199397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_019780	ATT	2	6	1199421	1199426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_019780	T	6	6	1199425	1199430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019780	GAAA	2	8	1201005	1201012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_019780	TGA	2	6	1202296	1202301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019780	ATGA	2	8	1202324	1202331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_019780	TTG	2	6	1202386	1202391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019780	GAG	2	6	1202450	1202455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_019780	C	6	6	1205097	1205102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5068	NC_019780	C	7	7	1205133	1205139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5069	NC_019780	G	6	6	1205147	1205152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_019780	C	6	6	1205212	1205217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5072	NC_019780	CGTG	2	8	1205225	1205232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_019780	CAAG	2	8	1205254	1205261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_019780	GTTA	2	8	1205298	1205305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_019780	GGT	2	6	1205692	1205697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_019780	CCG	2	6	1205705	1205710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_019780	CTT	2	6	1205780	1205785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_019780	ACT	2	6	1205806	1205811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_019780	TAT	2	6	1206121	1206126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019780	GTTTC	2	10	1206199	1206208	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5090	NC_019780	GTTTC	2	10	1206241	1206250	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5091	NC_019780	GTTTC	2	10	1206283	1206292	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5092	NC_019780	C	6	6	1208616	1208621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5096	NC_019780	CG	3	6	1209432	1209437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_019780	CT	3	6	1209442	1209447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_019780	TCAT	3	12	1209473	1209484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_019780	ATGA	2	8	1209498	1209505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_019780	TTC	2	6	1211501	1211506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_019780	TCCT	2	8	1211534	1211541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_019780	CTT	2	6	1211559	1211564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_019780	ACT	2	6	1211622	1211627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_019780	TTGA	2	8	1211684	1211691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_019780	AAAC	2	8	1211745	1211752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_019780	AGT	2	6	1211886	1211891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_019780	TC	3	6	1211953	1211958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_019780	GA	4	8	1211966	1211973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_019780	GTT	2	6	1212004	1212009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019780	TAA	2	6	1212043	1212048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_019780	CAT	2	6	1212064	1212069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019780	C	6	6	1212129	1212134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5115	NC_019780	ACG	2	6	1212171	1212176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_019780	AGT	2	6	1212206	1212211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_019780	TA	3	6	1212274	1212279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019780	TGA	2	6	1212405	1212410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_019780	C	6	6	1212417	1212422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5120	NC_019780	ATCG	2	8	1212498	1212505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_019780	TCGA	2	8	1212527	1212534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_019780	A	6	6	1212568	1212573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019780	G	9	9	1212672	1212680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019780	G	6	6	1212684	1212689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019780	TA	3	6	1212717	1212722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_019780	TTGC	2	8	1212738	1212745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_019780	AAAG	2	8	1212755	1212762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_019780	AAT	2	6	1212768	1212773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_019780	TAA	2	6	1213286	1213291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_019780	TAC	2	6	1214796	1214801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_019780	TAA	2	6	1216662	1216667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_019780	GAA	2	6	1216733	1216738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_019780	A	6	6	1216816	1216821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_019780	ATAAC	2	10	1216916	1216925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5135	NC_019780	TCA	2	6	1216929	1216934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_019780	A	6	6	1216969	1216974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_019780	A	7	7	1220012	1220018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_019780	TCGA	2	8	1220049	1220056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5139	NC_019780	TAC	2	6	1220084	1220089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_019780	GGCAA	2	10	1220103	1220112	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5141	NC_019780	ACT	2	6	1220122	1220127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_019780	TCAGGT	2	12	1220151	1220162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5143	NC_019780	TACA	2	8	1222253	1222260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5144	NC_019780	TCTT	2	8	1222282	1222289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5145	NC_019780	G	6	6	1222321	1222326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_019780	TC	3	6	1222332	1222337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5147	NC_019780	TAC	2	6	1222341	1222346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5149	NC_019780	ACG	2	6	1222900	1222905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_019780	GATTT	2	10	1222941	1222950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_019780	TCGA	2	8	1223005	1223012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5152	NC_019780	AAC	2	6	1223030	1223035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_019780	TCA	2	6	1223059	1223064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_019780	TAGTT	2	10	1223772	1223781	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_019780	AAT	2	6	1223807	1223812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_019780	CAA	2	6	1224832	1224837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5161	NC_019780	C	6	6	1225971	1225976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5162	NC_019780	TTA	2	6	1225977	1225982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5164	NC_019780	AGA	2	6	1225993	1225998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_019780	A	7	7	1228049	1228055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_019780	AGTTT	2	10	1228072	1228081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_019780	GATT	2	8	1228126	1228133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5170	NC_019780	TA	3	6	1228919	1228924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5171	NC_019780	C	6	6	1230266	1230271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5172	NC_019780	C	6	6	1230308	1230313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5257	NC_019780	T	8	8	1258692	1258699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_019780	ACGTT	2	10	1258731	1258740	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5260	NC_019780	AAAAT	2	10	1264289	1264298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_019780	TTCT	2	8	1264459	1264466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5265	NC_019780	TAAAC	2	10	1264492	1264501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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