MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 10445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018867	CCT	2	6	1311019	1311024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_018867	TAT	2	6	1311092	1311097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018867	TTA	2	6	1311127	1311132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_018867	GTT	2	6	1311271	1311276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_018867	TGA	2	6	1311295	1311300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_018867	CAT	2	6	1311310	1311315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_018867	TA	3	6	1311330	1311335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_018867	T	6	6	1311455	1311460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_018867	TATACA	2	12	1311573	1311584	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4510	NC_018867	TCA	2	6	1311637	1311642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_018867	TCATT	2	10	1311748	1311757	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4512	NC_018867	ATT	2	6	1311792	1311797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018867	AAT	2	6	1311923	1311928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_018867	TC	3	6	1313272	1313277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_018867	ATT	2	6	1313288	1313293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018867	ATC	2	6	1313300	1313305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_018867	TC	3	6	1313459	1313464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_018867	GCA	2	6	1313465	1313470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_018867	TAA	2	6	1313546	1313551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_018867	ATT	2	6	1313563	1313568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_018867	CG	3	6	1313621	1313626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_018867	TCG	2	6	1313649	1313654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_018867	TCTA	2	8	1313658	1313665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_018867	ATT	2	6	1314842	1314847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018867	TGT	2	6	1314907	1314912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_018867	CAT	2	6	1314916	1314921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_018867	A	6	6	1314952	1314957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_018867	ATC	2	6	1314967	1314972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_018867	ATC	2	6	1315007	1315012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_018867	CGT	2	6	1315036	1315041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_018867	TCC	2	6	1315054	1315059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_018867	TC	4	8	1315075	1315082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_018867	CAT	2	6	1315519	1315524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_018867	CT	3	6	1315538	1315543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_018867	CAA	2	6	1315552	1315557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_018867	CGA	2	6	1315593	1315598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_018867	ACCT	2	8	1315622	1315629	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_018867	GCCA	2	8	1315632	1315639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_018867	AGC	2	6	1315691	1315696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_018867	TC	3	6	1315730	1315735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_018867	ATA	2	6	1315736	1315741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_018867	TCT	2	6	1315808	1315813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_018867	CTC	2	6	1315880	1315885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_018867	AAAC	2	8	1315991	1315998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4545	NC_018867	TCAA	2	8	1316043	1316050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_018867	CT	3	6	1316067	1316072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_018867	A	7	7	1316073	1316079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_018867	T	6	6	1316307	1316312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_018867	TAA	2	6	1316467	1316472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_018867	CAT	2	6	1317522	1317527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_018867	TAC	2	6	1317608	1317613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_018867	AGG	2	6	1317661	1317666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_018867	TA	3	6	1317715	1317720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_018867	GCG	2	6	1317772	1317777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_018867	AT	3	6	1317792	1317797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_018867	TCT	2	6	1317855	1317860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_018867	GTT	2	6	1317909	1317914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_018867	TCT	2	6	1317953	1317958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_018867	ATA	2	6	1317969	1317974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_018867	CCTAA	2	10	1318065	1318074	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4561	NC_018867	TCA	2	6	1318097	1318102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_018867	CGG	2	6	1318423	1318428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_018867	TGT	2	6	1318513	1318518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018867	AAT	2	6	1318519	1318524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_018867	CCAA	2	8	1318562	1318569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_018867	CGA	2	6	1318626	1318631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_018867	AAT	2	6	1318657	1318662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_018867	TG	3	6	1318703	1318708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_018867	TAT	2	6	1318750	1318755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_018867	TA	3	6	1318774	1318779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_018867	CATT	2	8	1318860	1318867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_018867	A	6	6	1318901	1318906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_018867	GGAT	2	8	1319012	1319019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_018867	CAAAT	2	10	1319118	1319127	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4575	NC_018867	GCA	2	6	1319143	1319148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_018867	T	6	6	1319197	1319202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_018867	GATT	2	8	1319211	1319218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_018867	TAT	2	6	1319346	1319351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_018867	ATTA	2	8	1320095	1320102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_018867	TTA	2	6	1320124	1320129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_018867	TAG	2	6	1320155	1320160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_018867	CTA	2	6	1320161	1320166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_018867	T	6	6	1320177	1320182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_018867	AT	4	8	1320222	1320229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_018867	TACA	2	8	1320244	1320251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_018867	CTTC	2	8	1320320	1320327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_018867	CGA	2	6	1320418	1320423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_018867	TTG	2	6	1320437	1320442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_018867	TAA	2	6	1320452	1320457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_018867	TC	3	6	1320460	1320465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_018867	TCTA	2	8	1320500	1320507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_018867	ACT	2	6	1320527	1320532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_018867	TAA	2	6	1320569	1320574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_018867	TCA	2	6	1320612	1320617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_018867	GTTG	2	8	1320672	1320679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_018867	ATC	2	6	1320707	1320712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_018867	TAATA	2	10	1320736	1320745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_018867	AAT	2	6	1320750	1320755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_018867	AT	3	6	1320783	1320788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_018867	GAAA	2	8	1320871	1320878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_018867	AAACA	2	10	1320898	1320907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4602	NC_018867	ACT	2	6	1320918	1320923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_018867	AT	3	6	1320929	1320934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_018867	CCAA	2	8	1320939	1320946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_018867	AGA	2	6	1320951	1320956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_018867	TAAG	2	8	1321007	1321014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_018867	TGT	2	6	1321015	1321020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_018867	T	6	6	1321065	1321070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_018867	AAT	2	6	1321078	1321083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_018867	TC	3	6	1322149	1322154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_018867	TAA	2	6	1323029	1323034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_018867	GA	3	6	1323097	1323102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_018867	TAT	2	6	1323103	1323108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_018867	TTA	2	6	1323148	1323153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_018867	ACT	2	6	1323170	1323175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_018867	TTC	2	6	1323176	1323181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_018867	TACT	2	8	1323196	1323203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_018867	A	6	6	1323305	1323310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_018867	TTAT	2	8	1323366	1323373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_018867	ACCC	2	8	1323454	1323461	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4621	NC_018867	TGGG	2	8	1323526	1323533	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_018867	TAA	2	6	1323544	1323549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_018867	ACCC	2	8	1324822	1324829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4624	NC_018867	ATCA	2	8	1324835	1324842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_018867	GGGCG	2	10	1324895	1324904	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4626	NC_018867	TGT	2	6	1324918	1324923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_018867	AT	3	6	1325805	1325810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_018867	CCT	2	6	1327418	1327423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_018867	ATA	2	6	1327458	1327463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_018867	TCT	2	6	1327557	1327562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_018867	AT	3	6	1327605	1327610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_018867	AGG	2	6	1328250	1328255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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