MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfobacula toluolica Tol2

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018645	TCAAAT	2	12	30043	30054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018645	ATAAAA	2	12	38777	38788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018645	TTTAAA	2	12	38849	38860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018645	ATTTTT	2	12	44812	44823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018645	GCCATT	2	12	113326	113337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018645	ATACCA	2	12	122067	122078	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018645	GGAAAG	2	12	147127	147138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018645	TTAATT	2	12	216489	216500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018645	AATTTT	2	12	225601	225612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018645	TTGTTT	2	12	276184	276195	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018645	TTCAAT	2	12	278820	278831	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018645	TTCATT	2	12	297207	297218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018645	GTTAAG	2	12	302690	302701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018645	TGTTTT	2	12	333657	333668	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018645	ATATTT	2	12	416842	416853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018645	TATTTT	2	12	435384	435395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018645	TTTTAA	2	12	438467	438478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018645	TGAAAG	2	12	446582	446593	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018645	TGCAGG	2	12	482748	482759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018645	AATTGT	2	12	485176	485187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018645	ATTTTC	2	12	485241	485252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018645	ATAAAA	2	12	485314	485325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018645	AAAAGG	2	12	521852	521863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018645	TATTTT	2	12	585591	585602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018645	GATATT	2	12	616552	616563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018645	TTTTAT	2	12	662979	662990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018645	AAAATT	2	12	670769	670780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018645	CTTAAA	2	12	683410	683421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018645	CTTTAA	2	12	736131	736142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018645	TTCCAA	2	12	744049	744060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018645	TCCTTT	2	12	793257	793268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018645	GAAATT	2	12	800595	800606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018645	CCTTAC	4	24	803391	803414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018645	AAAGGA	2	12	803535	803546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018645	ATTAAT	2	12	831307	831318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018645	AAAATA	2	12	881337	881348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018645	ATAAAA	2	12	881994	882005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018645	TATCAA	2	12	901869	901880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018645	ATTTAA	2	12	904441	904452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018645	TAATTA	2	12	921666	921677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018645	AAAAAG	2	12	923675	923686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018645	CATTTA	2	12	924856	924867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018645	TTTTAA	2	12	956205	956216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018645	TTTCCT	2	12	971070	971081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018645	AACAGA	2	12	975053	975064	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018645	TAAAAA	2	12	1038502	1038513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018645	ATTTCA	2	12	1038566	1038577	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018645	TAAAAA	2	12	1101586	1101597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018645	TTTTGA	2	12	1119522	1119533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018645	TTTCAA	2	12	1132775	1132786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018645	GTCAGG	2	12	1141256	1141267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018645	ATTTTT	2	12	1150580	1150591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018645	TATAAA	2	12	1175461	1175472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018645	GCCTCA	2	12	1194139	1194150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018645	AAGAAA	2	12	1206758	1206769	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018645	ATCCAT	2	12	1209737	1209748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018645	ATTGTT	2	12	1227962	1227973	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018645	CTTTGG	2	12	1241801	1241812	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018645	AAAACA	2	12	1288638	1288649	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018645	GCTTGA	2	12	1292185	1292196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018645	ATTTAT	2	12	1361587	1361598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018645	TGTTAT	2	12	1370265	1370276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018645	GAAAAA	2	12	1384826	1384837	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018645	ATTTTT	2	12	1401459	1401470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018645	TATAAA	2	12	1409142	1409153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018645	TATGTT	2	12	1415750	1415761	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018645	AGTGAT	2	12	1415813	1415824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018645	TAAAAA	2	12	1489612	1489623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018645	TTTGCT	2	12	1496161	1496172	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018645	TGAGGT	2	12	1510059	1510070	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018645	ATAAAT	2	12	1584472	1584483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018645	GGTTTT	2	12	1672599	1672610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018645	ATTCTC	2	12	1672857	1672868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018645	AAAATT	2	12	1713061	1713072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018645	ATCAAA	2	12	1720671	1720682	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018645	GTTTTT	2	12	1722916	1722927	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018645	CAAAAT	2	12	1763750	1763761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018645	GAGAAT	2	12	1767622	1767633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018645	AAAACC	2	12	1767880	1767891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018645	TAAAAA	2	12	1777515	1777526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018645	TTTTAA	2	12	1779511	1779522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018645	CCGGGA	2	12	1791003	1791014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018645	AAATGA	2	12	1851278	1851289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018645	TTTTGA	2	12	1861221	1861232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018645	TTTAAA	2	12	1876225	1876236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018645	CATTGA	2	12	1876976	1876987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018645	TATAAA	2	12	1909700	1909711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018645	TTAAAA	2	12	1918365	1918376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018645	TAAAAA	2	12	1939004	1939015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018645	TGGATA	2	12	1985410	1985421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018645	TGAAAT	2	12	1986771	1986782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018645	TTAATT	2	12	2047660	2047671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018645	TTCCGG	2	12	2048244	2048255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018645	CTAATA	2	12	2058823	2058834	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018645	TTGCTG	2	12	2059021	2059032	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018645	TTATTC	2	12	2062461	2062472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018645	CCGTGT	2	12	2067436	2067447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018645	AAAGAA	2	12	2099973	2099984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018645	ATTTAT	2	12	2110076	2110087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018645	ATTAAA	2	12	2119179	2119190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018645	TAAAAT	2	12	2119281	2119292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018645	TAAATT	2	12	2126046	2126057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018645	TTAAAA	2	12	2137538	2137549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018645	TTTCTA	2	12	2160373	2160384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018645	GGTTTT	2	12	2167724	2167735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018645	ATTCTC	2	12	2167982	2167993	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018645	TTTATT	2	12	2176868	2176879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018645	TTTATT	2	12	2177120	2177131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018645	TTATAT	2	12	2202960	2202971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018645	TTGTCT	2	12	2224541	2224552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018645	AAATTA	2	12	2247362	2247373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018645	AAATAA	2	12	2267277	2267288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018645	AAATAA	2	12	2278860	2278871	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018645	ATTTAT	2	12	2318306	2318317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018645	TATAAA	2	12	2318359	2318370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018645	TATGAA	2	12	2368828	2368839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018645	TGGTTT	2	12	2381612	2381623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018645	TTTTAG	2	12	2389441	2389452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018645	TTGATC	2	12	2421901	2421912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018645	AAAGCA	2	12	2437882	2437893	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018645	TGATTC	2	12	2581969	2581980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018645	AATTTT	2	12	2622438	2622449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018645	AAAATT	2	12	2622519	2622530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018645	TATGGC	2	12	2629994	2630005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018645	TTTTAA	2	12	2671244	2671255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018645	GAAAAA	2	12	2725115	2725126	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018645	TTTTTC	2	12	2746895	2746906	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018645	TCAAAA	2	12	2749304	2749315	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.