MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	AAAAT	2	10	9226	9235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018068	AGATA	2	10	15162	15171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018068	AAATT	2	10	19208	19217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018068	CATTC	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018068	AAATT	2	10	33386	33395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018068	TTAAT	2	10	52694	52703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018068	TAAAC	2	10	55718	55727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018068	ATATA	2	10	69073	69082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018068	TCAAG	2	10	82803	82812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018068	CAATA	2	10	86131	86140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018068	TTTAT	2	10	91420	91429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018068	TCGTG	2	10	92978	92987	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018068	GAAGC	2	10	93164	93173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018068	AGAGG	2	10	95913	95922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018068	TTGAA	2	10	95942	95951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018068	GACAG	2	10	96109	96118	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018068	TCGGA	2	10	96791	96800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018068	CAAGA	2	10	99831	99840	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018068	TACAT	2	10	105297	105306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018068	TCGTG	2	10	106556	106565	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018068	GAAGC	2	10	106742	106751	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018068	AGAGG	2	10	109493	109502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018068	TTGAA	2	10	109522	109531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018068	GACAG	2	10	109689	109698	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018068	TCGGA	2	10	110371	110380	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018068	TATCG	2	10	111426	111435	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018068	CAGTT	2	10	113960	113969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018068	TGCTT	2	10	116960	116969	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018068	TGGAT	2	10	121111	121120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018068	TCCTC	2	10	121794	121803	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_018068	ATGCC	2	10	124096	124105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018068	ATGCT	2	10	141895	141904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018068	TCTAA	2	10	149037	149046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018068	CAAAA	2	10	156326	156335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018068	TCGTG	2	10	157586	157595	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018068	GAAGC	2	10	157772	157781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018068	AGAGG	2	10	160334	160343	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018068	TTGAA	2	10	160363	160372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018068	GACAG	2	10	160530	160539	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018068	TCGGA	2	10	161212	161221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018068	ATCTT	2	10	161988	161997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018068	TATCG	2	10	164013	164022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018068	AAGAA	2	10	164220	164229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018068	AGTTA	2	10	176512	176521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018068	TTTTC	2	10	179991	180000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018068	GAAAT	2	10	199265	199274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018068	ATTGT	2	10	201471	201480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018068	AGAAA	2	10	203115	203124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018068	GAGAA	2	10	203301	203310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018068	ACTTA	2	10	203987	203996	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018068	AAAGG	2	10	212877	212886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018068	CAAAT	2	10	213165	213174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018068	TTTAT	2	10	224023	224032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018068	TAGGT	2	10	233177	233186	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018068	GACCT	2	10	233568	233577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018068	TTTTG	2	10	233726	233735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018068	TTTTA	2	10	238708	238717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018068	CTTGC	2	10	243888	243897	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018068	ATTAT	2	10	243926	243935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018068	AAATT	2	10	243959	243968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018068	TTGAA	2	10	245753	245762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018068	TAATA	2	10	247747	247756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018068	ACGTA	2	10	249464	249473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018068	AGTGT	2	10	253628	253637	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018068	GTGCT	2	10	266835	266844	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018068	TTAAC	2	10	270873	270882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018068	TAAAT	2	10	276978	276987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018068	TTTTA	2	10	281903	281912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018068	AGGTA	2	10	295851	295860	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018068	CTGCC	2	10	297649	297658	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_018068	AGATT	2	10	299963	299972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018068	TTAAA	2	10	315188	315197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018068	GAAAG	2	10	315414	315423	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018068	ACTAA	2	10	322572	322581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018068	AATAG	2	10	341413	341422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018068	TCATA	2	10	346350	346359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018068	ATTTA	2	10	357213	357222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018068	AAGTA	2	10	371052	371061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018068	TATAT	2	10	373465	373474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018068	TATAA	2	10	373803	373812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018068	ATTAT	2	10	382374	382383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018068	CTTAA	2	10	399562	399571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018068	TAACT	2	10	401163	401172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018068	CGTTA	2	10	404807	404816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018068	TAAGA	2	10	405160	405169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018068	ATGCC	2	10	410908	410917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018068	TAGGA	2	10	428166	428175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018068	GGCAT	2	10	436672	436681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018068	AGGAT	2	10	448061	448070	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018068	AAATT	2	10	452142	452151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018068	ACAAG	2	10	454341	454350	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018068	AATTT	2	10	454646	454655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018068	AATTG	2	10	454832	454841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018068	ATCTT	2	10	460578	460587	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018068	ATTTT	2	10	463248	463257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018068	TAAAT	2	10	463430	463439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018068	GATTG	2	10	472334	472343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018068	ATGGC	2	10	473523	473532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018068	ATGGA	2	10	474669	474678	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018068	GGAAA	2	10	478917	478926	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018068	AATAT	2	10	486645	486654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018068	TTGAT	2	10	495377	495386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018068	AGGGG	2	10	511982	511991	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018068	AAAAT	2	10	518523	518532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018068	CTTTT	2	10	533638	533647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018068	AAATT	2	10	546233	546242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018068	TATCA	2	10	546250	546259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018068	TACAA	2	10	549621	549630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018068	TATTC	2	10	559486	559495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018068	TTATT	2	10	562558	562567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018068	ATTAA	2	10	565590	565599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018068	TTAGT	2	10	567142	567151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018068	TATGG	2	10	567187	567196	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018068	TCCTA	2	10	569346	569355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018068	TCGGT	2	10	569466	569475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018068	TTAAT	2	10	570085	570094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018068	AGGAG	2	10	573268	573277	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018068	GAATA	2	10	577222	577231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018068	TTTAT	2	10	577677	577686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018068	AGGAT	2	10	591314	591323	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018068	GTATT	2	10	607255	607264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018068	ATTTA	2	10	620877	620886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018068	CCATA	2	10	628489	628498	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018068	AATTG	2	10	642787	642796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018068	ACAAG	2	10	642953	642962	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018068	CAGAA	2	10	643088	643097	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018068	TAGAA	2	10	645474	645483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018068	GTTAA	2	10	653317	653326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018068	GTCTT	2	10	665578	665587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018068	AAATA	2	10	667434	667443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018068	TTAAT	2	10	667548	667557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018068	AAGAA	2	10	684294	684303	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018068	AAGAA	2	10	684349	684358	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018068	TAAAT	2	10	691807	691816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018068	AACAA	2	10	695250	695259	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018068	TTTAG	2	10	697933	697942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018068	GTAAT	2	10	710386	710395	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018068	CTCTT	2	10	711623	711632	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_018068	TTTTA	2	10	711804	711813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018068	TTAAA	2	10	724357	724366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018068	AGTTT	2	10	726664	726673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018068	GCCCT	2	10	758222	758231	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_018068	TATTT	2	10	759086	759095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018068	TTTAA	2	10	769183	769192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018068	ATTTT	2	10	778346	778355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018068	CTTGG	2	10	789084	789093	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018068	TTTGA	2	10	789402	789411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018068	GTTGA	2	10	831520	831529	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_018068	AAAAC	2	10	2080141	2080150	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_018068	TATAT	2	10	2080742	2080751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_018068	AAAAC	2	10	2080828	2080837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_018068	TTTGT	2	10	2090823	2090832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_018068	AATAT	2	10	2148775	2148784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_018068	TTAAT	2	10	2161070	2161079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_018068	AAAAG	2	10	2169851	2169860	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
447	NC_018068	TAAAT	2	10	2171359	2171368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_018068	GAGGG	2	10	2174913	2174922	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
449	NC_018068	GTTTA	2	10	2175033	2175042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
450	NC_018068	AAAAG	2	10	2176373	2176382	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_018068	ATCCT	2	10	2201788	2201797	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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460	NC_018068	AATTT	2	10	2208451	2208460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_018068	AAGGG	2	10	2223225	2223234	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
462	NC_018068	TCTCT	2	10	2237343	2237352	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
463	NC_018068	GGAAT	2	10	2245481	2245490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
464	NC_018068	CCTAT	2	10	2247739	2247748	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
465	NC_018068	CTGCA	2	10	2247943	2247952	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
466	NC_018068	GGGGA	2	10	2253970	2253979	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_018068	TCGAA	2	10	2293151	2293160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
471	NC_018068	AATAG	2	10	2302672	2302681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NC_018068	TGAAT	2	10	2311355	2311364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
473	NC_018068	AGAAA	2	10	2317365	2317374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
474	NC_018068	TTTAC	2	10	2327709	2327718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
475	NC_018068	TCGTG	2	10	2328718	2328727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_018068	GACAG	2	10	2331623	2331632	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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482	NC_018068	TATAA	2	10	2341102	2341111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018068	TCCGG	2	10	2393843	2393852	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_018068	TTAAT	2	10	2408218	2408227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_018068	TTGAT	2	10	2408489	2408498	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_018068	TCCTC	2	10	2410383	2410392	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
491	NC_018068	TTTAG	2	10	2410549	2410558	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
492	NC_018068	CTTAA	2	10	2410653	2410662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
493	NC_018068	GTTTT	2	10	2412233	2412242	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_018068	CTGTT	2	10	2505581	2505590	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

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