MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 11308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	CCT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018068	AAC	2	6	239	244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018068	AAT	2	6	369	374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018068	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018068	CTA	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018068	TAT	2	6	468	473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018068	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018068	CTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018068	TAC	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018068	ACT	2	6	2123	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018068	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018068	TTA	3	9	2139	2147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018068	AGG	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018068	ATT	2	6	4664	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018068	AAT	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018068	TAT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018068	GGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018068	AGG	2	6	9323	9328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018068	TTG	2	6	12128	12133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018068	TGT	2	6	12163	12168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018068	TTC	2	6	12296	12301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018068	CTC	2	6	12598	12603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018068	GGA	2	6	13184	13189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018068	CCT	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018068	TGT	2	6	13323	13328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018068	TAA	2	6	13433	13438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018068	ATT	2	6	13931	13936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018068	TTA	2	6	14085	14090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018068	ATT	2	6	15117	15122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018068	TTG	2	6	15194	15199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018068	AGC	2	6	15548	15553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018068	GGT	3	9	15623	15631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018068	TAT	2	6	15651	15656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018068	GGT	2	6	15666	15671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018068	AAG	2	6	15826	15831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018068	TAT	2	6	15916	15921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018068	ATT	2	6	15931	15936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018068	ATA	2	6	17664	17669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018068	TTC	2	6	18667	18672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018068	TAT	2	6	19002	19007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018068	CTT	2	6	19010	19015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018068	CAA	2	6	19024	19029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018068	AGT	2	6	19082	19087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018068	TTC	2	6	19129	19134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018068	GAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018068	AGG	2	6	19230	19235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018068	TAT	2	6	22980	22985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018068	AGG	2	6	24181	24186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018068	GGA	2	6	28105	28110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018068	AAG	2	6	28431	28436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018068	GAT	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018068	TCA	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018068	CAA	2	6	32898	32903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018068	AAG	2	6	32928	32933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018068	CCT	2	6	32945	32950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018068	TAC	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018068	GAG	2	6	33485	33490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018068	TGG	2	6	37351	37356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018068	GAA	2	6	38578	38583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018068	TAA	2	6	38703	38708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018068	GCA	2	6	40326	40331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018068	GAT	2	6	41526	41531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018068	TTG	2	6	41624	41629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018068	TCG	2	6	41728	41733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018068	CAG	2	6	41770	41775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018068	GCA	2	6	41870	41875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018068	GCC	2	6	42047	42052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018068	GCC	2	6	42151	42156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018068	GTT	2	6	43021	43026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018068	TGC	2	6	44404	44409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018068	TAA	2	6	44450	44455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018068	GGA	2	6	44501	44506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018068	TCA	2	6	45893	45898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018068	GGA	2	6	46018	46023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018068	CTC	2	6	47569	47574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018068	AGG	2	6	47642	47647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018068	TTG	2	6	48527	48532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018068	CCT	2	6	48958	48963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018068	GTA	2	6	49914	49919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018068	AAC	3	9	49941	49949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018068	TTC	2	6	52648	52653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018068	CTT	2	6	52655	52660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018068	TAA	2	6	52743	52748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018068	ATT	2	6	55207	55212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018068	GTG	2	6	55296	55301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018068	ATT	2	6	55564	55569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018068	TCT	2	6	55597	55602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018068	GTT	2	6	55646	55651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018068	ATT	2	6	58839	58844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018068	GCC	2	6	59841	59846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018068	AAG	2	6	64408	64413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018068	ATT	2	6	64418	64423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018068	CTT	2	6	64428	64433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018068	TTG	2	6	64434	64439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018068	AAT	2	6	64457	64462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018068	AGG	2	6	64539	64544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018068	AAT	2	6	65145	65150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018068	AGG	2	6	65218	65223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018068	AGG	2	6	66760	66765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018068	TAA	2	6	67102	67107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018068	AGA	2	6	67129	67134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018068	TTA	2	6	67453	67458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018068	AAG	2	6	67503	67508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018068	ATG	2	6	68391	68396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018068	TCA	3	9	69099	69107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018068	AGG	2	6	69110	69115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018068	CCG	2	6	69525	69530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018068	GTT	2	6	69768	69773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018068	GAA	2	6	72253	72258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018068	TAA	2	6	72266	72271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018068	AAT	2	6	72279	72284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018068	CAA	2	6	74052	74057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018068	TAA	3	9	74240	74248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018068	ATT	2	6	77697	77702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018068	AAG	2	6	79743	79748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018068	AAT	2	6	79787	79792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018068	CTA	2	6	79867	79872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018068	GAG	2	6	79974	79979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018068	GCA	2	6	80489	80494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018068	CGC	2	6	82535	82540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018068	CGA	2	6	82546	82551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018068	CGC	2	6	82705	82710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018068	TTA	2	6	82763	82768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018068	AGG	2	6	82853	82858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018068	ATT	2	6	83756	83761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018068	ATC	2	6	83763	83768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018068	AAG	2	6	86142	86147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018068	TAG	2	6	87527	87532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018068	TAA	2	6	88644	88649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018068	ATT	2	6	88669	88674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018068	AAG	2	6	88695	88700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018068	CTA	2	6	88729	88734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018068	ATG	2	6	89314	89319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018068	ATT	2	6	89346	89351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018068	TGC	2	6	89362	89367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018068	GGC	2	6	91069	91074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018068	TTC	2	6	91094	91099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018068	AAG	2	6	91133	91138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018068	AAT	2	6	91340	91345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_018068	GCC	2	6	91632	91637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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