MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TTA	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018066	GAT	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018066	TTA	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018066	TAG	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018066	AGG	2	6	4843	4848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018066	TTA	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018066	TTA	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018066	TAA	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018066	AGG	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018066	ACA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018066	GTT	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018066	CGC	2	6	5580	5585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018066	ACA	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018066	GAT	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018066	AAT	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018066	TAT	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018066	ATT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018066	AGC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018066	CAG	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018066	AAG	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018066	TTC	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018066	GTT	2	6	7782	7787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018066	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018066	GAT	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018066	GAA	2	6	9303	9308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018066	TTC	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018066	ACG	2	6	18872	18877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018066	ATA	2	6	18893	18898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018066	AGA	2	6	18912	18917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018066	CTT	2	6	18998	19003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018066	GTT	2	6	19111	19116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018066	GAG	2	6	23092	23097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018066	AAG	2	6	23385	23390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018066	TGA	2	6	23538	23543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018066	TCC	2	6	23637	23642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018066	CGA	2	6	23665	23670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018066	TGC	2	6	23732	23737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018066	TTG	2	6	23787	23792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018066	GAG	2	6	23802	23807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018066	AGG	2	6	23829	23834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018066	GTC	2	6	23932	23937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018066	GGA	3	9	23952	23960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018066	ACG	2	6	23975	23980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018066	TGA	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018066	TCA	2	6	24123	24128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018066	GTG	2	6	24149	24154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018066	AGG	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018066	TGC	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018066	TGT	2	6	24614	24619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018066	TAC	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018066	TTA	2	6	25928	25933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018066	CCT	2	6	27009	27014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018066	TAT	2	6	27082	27087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018066	GGA	2	6	27164	27169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018066	GAT	2	6	27170	27175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018066	AGG	2	6	27900	27905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018066	AAC	2	6	29362	29367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018066	CTA	2	6	30196	30201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018066	TAG	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018066	ATT	2	6	30318	30323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018066	AAC	2	6	30390	30395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018066	GTA	2	6	30404	30409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018066	ACA	2	6	30909	30914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018066	GAT	2	6	31005	31010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018066	CTT	2	6	31802	31807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018066	ATT	2	6	31908	31913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018066	TAT	2	6	31993	31998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018066	CCT	2	6	32761	32766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018066	ATT	2	6	32833	32838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018066	ACA	2	6	32902	32907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018066	TCT	2	6	32946	32951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018066	AAT	2	6	32970	32975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018066	TAA	2	6	33054	33059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018066	TAC	2	6	35014	35019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018066	TCT	2	6	35040	35045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018066	ATA	2	6	35049	35054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018066	TGG	2	6	35147	35152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018066	TAA	2	6	35193	35198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018066	CAA	2	6	35204	35209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018066	CCT	2	6	35338	35343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018066	ATT	2	6	37123	37128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018066	TCC	2	6	37403	37408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018066	TCC	2	6	38180	38185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018066	TGT	2	6	38223	38228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018066	TAT	2	6	38239	38244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018066	GTA	2	6	38273	38278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018066	GTA	2	6	38335	38340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018066	CGG	2	6	38664	38669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018066	CAG	2	6	38716	38721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018066	GAA	2	6	38865	38870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018066	AGG	2	6	38949	38954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018066	TTA	2	6	39031	39036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018066	GTT	2	6	39114	39119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018066	AAG	2	6	39244	39249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018066	GTA	2	6	39325	39330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018066	TGA	2	6	39341	39346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018066	AAC	2	6	39415	39420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018066	TGA	2	6	39453	39458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018066	CCT	2	6	39516	39521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018066	GGA	2	6	39523	39528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018066	TTG	2	6	39552	39557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018066	AAG	2	6	39568	39573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018066	AGG	2	6	39831	39836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018066	GAT	2	6	40757	40762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018066	AAT	2	6	40812	40817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018066	AGC	2	6	40896	40901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018066	GAA	2	6	40922	40927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018066	TCG	2	6	41017	41022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018066	AGG	2	6	41058	41063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018066	GTT	2	6	41503	41508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018066	AGT	2	6	42778	42783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018066	ATT	2	6	42788	42793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018066	ATT	2	6	43045	43050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018066	AAT	2	6	43080	43085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018066	AAT	3	9	43094	43102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018066	ATA	2	6	43172	43177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018066	ATT	2	6	43938	43943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018066	TCA	2	6	43952	43957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018066	TCT	2	6	43984	43989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018066	ACC	2	6	44589	44594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018066	GGT	2	6	44607	44612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018066	TAT	2	6	44618	44623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018066	TAA	2	6	44659	44664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018066	CTT	2	6	44665	44670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018066	GAT	2	6	44811	44816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018066	AGG	2	6	44821	44826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018066	ATT	2	6	44850	44855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018066	AGC	2	6	44954	44959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018066	ATA	2	6	45007	45012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018066	GGA	2	6	45112	45117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018066	GCT	2	6	45493	45498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018066	TTA	2	6	45968	45973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018066	GGT	2	6	46014	46019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018066	ATT	2	6	46027	46032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018066	CTT	2	6	46036	46041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018066	GTA	2	6	46042	46047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018066	AAG	2	6	46133	46138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018066	AGG	2	6	46579	46584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018066	CGC	2	6	56481	56486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018066	GCG	2	6	56549	56554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018066	TAA	2	6	56637	56642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.