MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfitobacterium dehalogenans ATCC 51507 chromosome

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018017	GTAATT	2	12	15525	15536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018017	TACTGA	2	12	34662	34673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018017	TCCCTT	2	12	65507	65518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018017	TGCCAC	2	12	97282	97293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018017	CACTTG	2	12	99595	99606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018017	GGGGTT	2	12	137000	137011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018017	AAGCGA	2	12	137377	137388	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018017	CGCAGG	2	12	139491	139502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018017	TTGTTT	2	12	166138	166149	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018017	TAAGGT	2	12	189041	189052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018017	ATGATT	2	12	189180	189191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018017	GGGGTT	2	12	222398	222409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018017	AAGCGA	2	12	222775	222786	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018017	CGCAGG	2	12	224889	224900	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018017	TTCAGG	2	12	226036	226047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018017	TTGAGC	2	12	226834	226845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018017	CAAGTG	2	12	242230	242241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018017	GGGGTT	2	12	249263	249274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018017	AAGCGA	2	12	249640	249651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018017	CGCAGG	2	12	251754	251765	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018017	TGTGAA	2	12	266884	266895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018017	AGCGAA	2	12	318849	318860	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018017	TTTGGG	2	12	349734	349745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018017	GATATA	2	12	384368	384379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018017	CTTTTT	2	12	415689	415700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018017	CAAAAA	2	12	424649	424660	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018017	CTTGCC	2	12	484174	484185	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018017	ATTTTA	2	12	484401	484412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018017	TACAAG	2	12	491779	491790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018017	TTAATT	2	12	514353	514364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018017	ATAGCT	2	12	544814	544825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018017	CATTCT	2	12	548187	548198	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018017	ATAGCT	2	12	550024	550035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018017	TCCCCC	2	12	573791	573802	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
35	NC_018017	ATCGAA	2	12	577143	577154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018017	TATAAT	2	12	583961	583972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018017	ATTTTT	2	12	610620	610631	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018017	ATGGTC	2	12	678151	678162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018017	CCTTTT	2	12	706448	706459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018017	GAGAAA	2	12	723867	723878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018017	AATAAA	2	12	735731	735742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018017	ATCTTT	2	12	777762	777773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018017	TATAAG	2	12	826648	826659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018017	GAGAAG	2	12	829929	829940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018017	TTTGGC	2	12	868920	868931	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018017	ATTTGG	2	12	895947	895958	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018017	AAGGCT	2	12	919045	919056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018017	AATGAA	2	12	920666	920677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018017	ATAAGT	2	12	930733	930744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018017	CATGTT	2	12	986616	986627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018017	GAAATT	2	12	1034821	1034832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018017	TGGAGA	2	12	1039915	1039926	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018017	GACCGG	2	12	1118308	1118319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018017	GGGGTT	2	12	1121688	1121699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018017	GAAAAA	2	12	1127683	1127694	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018017	TAAAAA	2	12	1140366	1140377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018017	ATAGTA	2	12	1157270	1157281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018017	ATCAAA	2	12	1183441	1183452	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018017	TGAGTA	2	12	1310550	1310561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018017	TAAAAT	2	12	1388365	1388376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018017	AAATAT	2	12	1393658	1393669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018017	AATGAG	2	12	1393706	1393717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018017	GACGAT	2	12	1421096	1421107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018017	GATGAG	2	12	1438682	1438693	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018017	GGCAGG	2	12	1444393	1444404	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018017	GATCCT	2	12	1444537	1444548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018017	AACATA	2	12	1494766	1494777	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018017	GGTTAC	2	12	1510345	1510356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018017	AGAAAA	6	36	1520249	1520284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018017	AGGATA	2	12	1538462	1538473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018017	AGAAAG	2	12	1564931	1564942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018017	CTGTGG	2	12	1628110	1628121	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018017	TAAGTT	2	12	1635543	1635554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018017	TCAATG	2	12	1688784	1688795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018017	TCTATT	2	12	1727139	1727150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018017	TTTTTA	2	12	1737347	1737358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018017	TTATAT	2	12	1750041	1750052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018017	AGTTTT	2	12	1757339	1757350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018017	ACTTTA	2	12	1787747	1787758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018017	TTAAAA	2	12	1791820	1791831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018017	GGTGAT	2	12	1829698	1829709	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018017	ATTATA	2	12	1846602	1846613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018017	CTTTTT	2	12	1869214	1869225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018017	ATAAGT	2	12	1871663	1871674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018017	TAAGCA	2	12	1878752	1878763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018017	TTATAG	2	12	1891860	1891871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018017	ATACTA	2	12	1938312	1938323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018017	TATCGA	2	12	2099933	2099944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018017	ATTTTA	2	12	2106733	2106744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018017	ATTTTA	2	12	2108395	2108406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018017	TTTGGA	2	12	2114509	2114520	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018017	GGGGTT	2	12	2120580	2120591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018017	AAGCGA	2	12	2120957	2120968	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018017	CGCAGG	2	12	2123070	2123081	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018017	CCTGAA	2	12	2124027	2124038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018017	TAGGGG	2	12	2178194	2178205	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018017	TTGTAA	2	12	2184983	2184994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018017	TCTATT	2	12	2199152	2199163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018017	ATCAAA	2	12	2293275	2293286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018017	TTGCCT	2	12	2343832	2343843	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018017	TAAAAA	2	12	2455723	2455734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018017	ATTTTT	2	12	2507614	2507625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018017	AAATTT	2	12	2519366	2519377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018017	TATTCA	2	12	2524367	2524378	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018017	CAAAAT	2	12	2524467	2524478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018017	TATAAA	2	12	2574929	2574940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018017	AAAGCA	2	12	2584164	2584175	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018017	GTATAA	2	12	2584309	2584320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018017	TGTTCC	2	12	2628967	2628978	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018017	CCTGCG	2	12	2633250	2633261	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018017	TCGCTT	2	12	2635364	2635375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018017	CAACCC	2	12	2635740	2635751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018017	CATCAA	2	12	2653842	2653853	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018017	ACCGGA	2	12	2656552	2656563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018017	TTACAG	2	12	2661690	2661701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018017	ATACTG	2	12	2685830	2685841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018017	AATATT	2	12	2689070	2689081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018017	TCTAAG	2	12	2690950	2690961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018017	TTATCA	2	12	2701350	2701361	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018017	TTTTGA	2	12	2775226	2775237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018017	TTTATA	2	12	2800027	2800038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018017	AATACA	2	12	2806915	2806926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018017	TGTAGA	2	12	2807098	2807109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018017	GTGCAA	2	12	2823534	2823545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018017	AGTATA	2	12	2838533	2838544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018017	AATTTT	2	12	2865610	2865621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018017	TTCTCC	2	12	2868129	2868140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018017	TCCATA	2	12	2883244	2883255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018017	GATTTA	2	12	2922531	2922542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018017	AAACAT	2	12	2934992	2935003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018017	AACAGC	2	12	2942358	2942369	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018017	CAAGTT	2	12	2942475	2942486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018017	GGATAA	2	12	2993424	2993435	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018017	TAATTT	2	12	3049604	3049615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018017	TTTTTA	2	12	3049777	3049788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018017	CCTTTT	2	12	3053248	3053259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018017	CCTGCG	2	12	3058139	3058150	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018017	TCGCTT	2	12	3060253	3060264	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018017	CAACCC	2	12	3060629	3060640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018017	ATTATC	2	12	3063377	3063388	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_018017	CCATAT	2	12	3068982	3068993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018017	CCAATG	2	12	3163584	3163595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018017	CAAGAT	2	12	3250930	3250941	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_018017	ACATAT	2	12	3261201	3261212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018017	ATACTT	2	12	3340224	3340235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_018017	GCCATA	2	12	3396441	3396452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018017	ATACTT	2	12	3415566	3415577	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_018017	TAAAAA	2	12	3441866	3441877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018017	TAGTGT	2	12	3444381	3444392	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018017	ACTTTT	2	12	3475713	3475724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_018017	AATCTT	2	12	3521351	3521362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_018017	GCCTTG	2	12	3559399	3559410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018017	AGATAA	2	12	3607722	3607733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018017	CTAATC	2	12	3679880	3679891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018017	TGAAAT	2	12	3715177	3715188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018017	TGCGGT	2	12	3730006	3730017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_018017	TTAATA	2	12	3746460	3746471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018017	AAATGA	2	12	3774902	3774913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018017	AGCTAT	2	12	3813940	3813951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_018017	AGCTAT	2	12	3835442	3835453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_018017	ATCCAA	2	12	3846011	3846022	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_018017	ATTTAG	2	12	3909268	3909279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018017	ATCTAA	2	12	3909302	3909313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_018017	CTATGT	2	12	3911722	3911733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_018017	CCGCTA	2	12	3933314	3933325	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
166	NC_018017	CTTTTT	2	12	3960736	3960747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_018017	AATACA	2	12	3981080	3981091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_018017	TCTGGC	2	12	4063644	4063655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_018017	TAAAAA	2	12	4114798	4114809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018017	TATGTT	2	12	4149313	4149324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018017	TAACTA	2	12	4167291	4167302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_018017	TTATAA	2	12	4250943	4250954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018017	GAAGGC	2	12	4266238	4266249	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_018017	ACGAAT	2	12	4295931	4295942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
175	NC_018017	TATGTT	2	12	4311746	4311757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.