MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 3592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018001	CATA	2	8	1158028	1158035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_018001	AAT	2	6	1158054	1158059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_018001	CAGG	2	8	1158076	1158083	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_018001	TAAC	2	8	1160819	1160826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_018001	CT	3	6	1160829	1160834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_018001	ATT	2	6	1160916	1160921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_018001	GCA	2	6	1161346	1161351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_018001	CCT	2	6	1161438	1161443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_018001	ACCC	2	8	1161467	1161474	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3010	NC_018001	C	6	6	1161546	1161551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3011	NC_018001	ATA	2	6	1161601	1161606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_018001	AAG	2	6	1161612	1161617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_018001	ACC	2	6	1166886	1166891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_018001	AT	3	6	1166915	1166920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_018001	ACC	2	6	1167245	1167250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_018001	TA	3	6	1168932	1168937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_018001	CCA	2	6	1168946	1168951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_018001	GA	4	8	1168965	1168972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_018001	CTA	2	6	1169677	1169682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_018001	ATA	2	6	1169695	1169700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_018001	CAAC	2	8	1169728	1169735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_018001	GTG	2	6	1172331	1172336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_018001	AGA	2	6	1174341	1174346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_018001	AAT	2	6	1174379	1174384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_018001	ACCT	2	8	1174385	1174392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_018001	GCG	2	6	1174442	1174447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3029	NC_018001	AAT	2	6	1174521	1174526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_018001	AAT	2	6	1174565	1174570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_018001	CTCC	2	8	1174573	1174580	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3032	NC_018001	TTAA	2	8	1174581	1174588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_018001	T	6	6	1174703	1174708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3040	NC_018001	AG	3	6	1175440	1175445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3042	NC_018001	GTA	2	6	1177647	1177652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_018001	GAG	2	6	1177706	1177711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_018001	ATA	2	6	1179338	1179343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3056	NC_018001	GAG	2	6	1179734	1179739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_018001	TGG	2	6	1179755	1179760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_018001	TGCT	2	8	1179864	1179871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_018001	AGT	2	6	1179875	1179880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_018001	TA	3	6	1179887	1179892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_018001	TCG	2	6	1179915	1179920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_018001	ACT	2	6	1179985	1179990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3065	NC_018001	C	6	6	1180250	1180255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3066	NC_018001	TAC	2	6	1180330	1180335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3070	NC_018001	A	7	7	1181787	1181793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_018001	TTTA	2	8	1184709	1184716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_018001	GAGT	2	8	1189065	1189072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_018001	ATA	2	6	1190541	1190546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_018001	TAGCAT	2	12	1190630	1190641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3100	NC_018001	AAC	2	6	1192683	1192688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_018001	CCCA	2	8	1194829	1194836	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3102	NC_018001	GAG	2	6	1194916	1194921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3105	NC_018001	ATC	2	6	1195038	1195043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3107	NC_018001	TCA	2	6	1195110	1195115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_018001	CCT	2	6	1195150	1195155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_018001	GAG	2	6	1195228	1195233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_018001	TAA	2	6	1195335	1195340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_018001	CG	3	6	1195374	1195379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_018001	TCC	2	6	1196036	1196041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_018001	G	6	6	1196046	1196051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018001	CAC	2	6	1196088	1196093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_018001	CTT	2	6	1196100	1196105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_018001	TA	3	6	1196129	1196134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018001	CCA	2	6	1196150	1196155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_018001	TC	3	6	1196193	1196198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_018001	TAT	2	6	1196322	1196327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018001	CCT	2	6	1196328	1196333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_018001	TC	3	6	1196340	1196345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_018001	CTC	2	6	1196356	1196361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_018001	CT	3	6	1196412	1196417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_018001	TG	3	6	1196453	1196458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018001	ATGT	2	8	1196503	1196510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_018001	AT	3	6	1196574	1196579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_018001	CCT	2	6	1196580	1196585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_018001	GCG	2	6	1196618	1196623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_018001	TA	3	6	1196632	1196637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_018001	CT	3	6	1196676	1196681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_018001	GGT	2	6	1196899	1196904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_018001	TC	3	6	1196949	1196954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_018001	GTA	2	6	1196960	1196965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_018001	CATT	2	8	1197007	1197014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_018001	TAC	2	6	1197080	1197085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_018001	GA	3	6	1197099	1197104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_018001	ATTA	2	8	1197122	1197129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_018001	TAA	2	6	1198359	1198364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_018001	GTA	2	6	1200294	1200299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_018001	CTAGA	2	10	1200317	1200326	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3141	NC_018001	TTA	2	6	1200350	1200355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_018001	GTT	2	6	1200388	1200393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_018001	AAT	2	6	1212171	1212176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_018001	AGT	2	6	1212210	1212215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3151	NC_018001	ACCCT	2	10	1216179	1216188	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3155	NC_018001	TCCTT	2	10	1216217	1216226	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3163	NC_018001	ACAA	2	8	1221273	1221280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3164	NC_018001	TAA	2	6	1221286	1221291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_018001	GGAT	2	8	1221306	1221313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_018001	TCC	2	6	1221380	1221385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3168	NC_018001	ATC	2	6	1221472	1221477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3172	NC_018001	GA	3	6	1221936	1221941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_018001	ACC	2	6	1222327	1222332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3174	NC_018001	CCAG	2	8	1222338	1222345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3177	NC_018001	CTC	2	6	1222681	1222686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3189	NC_018001	TAGA	2	8	1228784	1228791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3193	NC_018001	TA	3	6	1230396	1230401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3194	NC_018001	TA	3	6	1230406	1230411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3211	NC_018001	CTT	2	6	1231279	1231284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3225	NC_018001	TAT	2	6	1232622	1232627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3229	NC_018001	GCT	2	6	1235781	1235786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3231	NC_018001	AAT	2	6	1235820	1235825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_018001	CTAGA	2	10	1235851	1235860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3235	NC_018001	CAA	2	6	1236270	1236275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3240	NC_018001	TTG	2	6	1236604	1236609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_018001	CATG	2	8	1236613	1236620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3242	NC_018001	GATGTT	2	12	1236652	1236663	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_018001	CT	3	6	1236705	1236710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3244	NC_018001	TTA	3	9	1236754	1236762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_018001	ATT	2	6	1236788	1236793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_018001	TAA	2	6	1238347	1238352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_018001	GAT	2	6	1242243	1242248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_018001	ATT	2	6	1243312	1243317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_018001	TA	3	6	1243362	1243367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_018001	ACC	2	6	1245450	1245455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_018001	TGA	2	6	1245507	1245512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_018001	GAT	2	6	1245534	1245539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_018001	CT	3	6	1245582	1245587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_018001	AAT	2	6	1245627	1245632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_018001	TCA	2	6	1249477	1249482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_018001	AT	4	8	1249522	1249529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_018001	TTC	2	6	1249638	1249643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_018001	TA	3	6	1249697	1249702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_018001	AT	3	6	1249711	1249716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_018001	TAA	2	6	1250718	1250723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_018001	TTA	2	6	1250731	1250736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_018001	GAT	2	6	1250739	1250744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_018001	GAA	2	6	1250768	1250773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_018001	CTATA	2	10	1250835	1250844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3265	NC_018001	TGA	2	6	1250849	1250854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3393	NC_018001	T	8	8	1290807	1290814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3394	NC_018001	TAA	2	6	1290836	1290841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3395	NC_018001	AGA	2	6	1291127	1291132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3396	NC_018001	GTTG	2	8	1291143	1291150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3397	NC_018001	GCT	2	6	1291174	1291179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3398	NC_018001	AGA	2	6	1292521	1292526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_018001	AAG	2	6	1293039	1293044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3402	NC_018001	TCT	2	6	1298428	1298433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3413	NC_018001	TA	3	6	1298905	1298910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3422	NC_018001	TAA	2	6	1302983	1302988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3425	NC_018001	CGG	2	6	1304954	1304959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3427	NC_018001	GTAT	2	8	1305017	1305024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3429	NC_018001	GCTT	2	8	1305070	1305077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3430	NC_018001	AGCCC	2	10	1305138	1305147	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3431	NC_018001	ACT	2	6	1305177	1305182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3435	NC_018001	ATA	2	6	1307106	1307111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_018001	TCA	2	6	1311711	1311716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3442	NC_018001	CCT	2	6	1312582	1312587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3443	NC_018001	TAGGA	2	10	1312590	1312599	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3448	NC_018001	TATT	2	8	1315033	1315040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3455	NC_018001	ATC	2	6	1316851	1316856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3456	NC_018001	ATT	2	6	1316857	1316862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3457	NC_018001	ATT	2	6	1316871	1316876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3493	NC_018001	TA	3	6	1325796	1325801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3495	NC_018001	ATT	2	6	1325914	1325919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_018001	ATTA	2	8	1325924	1325931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_018001	TCT	2	6	1325941	1325946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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