MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P1

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017805	GTGCC	2	10	10	19	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017805	TCCCC	2	10	2041	2050	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017805	GCCTC	2	10	3627	3636	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_017805	GCAGC	2	10	5553	5562	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017805	GATCT	2	10	7284	7293	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017805	GGCGC	2	10	28333	28342	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017805	GCCCA	2	10	32053	32062	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017805	CCGTG	2	10	32156	32165	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017805	TGCAC	2	10	32234	32243	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017805	GGGCG	2	10	37404	37413	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017805	AGGGG	2	10	37423	37432	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017805	GCCCG	2	10	37495	37504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017805	CCCGC	2	10	39297	39306	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14	NC_017805	CGCGC	2	10	39512	39521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017805	GCCGG	2	10	48122	48131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017805	GGCCC	2	10	51645	51654	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017805	CACGT	2	10	51732	51741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017805	GCCGG	2	10	51975	51984	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017805	GCCGG	2	10	53322	53331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017805	GCGAG	2	10	53639	53648	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017805	GCCCC	2	10	54154	54163	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_017805	GCCGA	2	10	54175	54184	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017805	GCCGG	2	10	67727	67736	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017805	GGCCG	2	10	67823	67832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017805	TGCCG	2	10	75817	75826	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017805	GCCCC	2	10	76044	76053	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_017805	GCGCC	2	10	84770	84779	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017805	GGCGG	2	10	97087	97096	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017805	CGGAT	2	10	99952	99961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017805	GCCGC	2	10	100583	100592	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017805	GCCGC	2	10	101593	101602	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017805	CCGGC	2	10	103695	103704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_017805	CCGGC	2	10	104982	104991	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_017805	CGCGG	2	10	108778	108787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017805	CAGGG	2	10	110540	110549	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017805	ACAGG	2	10	112390	112399	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017805	GCACC	2	10	126790	126799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017805	GGAGG	2	10	127589	127598	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017805	ATCCT	2	10	129057	129066	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017805	TGCTC	2	10	129577	129586	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017805	GACGT	2	10	138413	138422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017805	GCCGG	2	10	164940	164949	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017805	CGGCG	2	10	168595	168604	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017805	GCCCC	2	10	170164	170173	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_017805	CGGCA	2	10	191371	191380	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017805	GCCGC	2	10	199454	199463	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_017805	GCGCC	2	10	199924	199933	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017805	GCGTG	2	10	201071	201080	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017805	TCAGG	2	10	204085	204094	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017805	GCCGC	2	10	205339	205348	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_017805	CTTCT	2	10	205400	205409	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017805	CTGCC	2	10	205410	205419	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017805	GCCCC	2	10	205428	205437	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54	NC_017805	GCCGG	2	10	206403	206412	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017805	TGCGC	2	10	216523	216532	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017805	GCGAG	2	10	216589	216598	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017805	GCGCG	2	10	226367	226376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017805	GCGCG	2	10	231709	231718	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017805	AGGAA	2	10	232370	232379	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017805	GGGGC	2	10	232465	232474	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017805	CGGGG	2	10	251736	251745	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017805	GCCGC	2	10	255876	255885	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_017805	GGCGC	2	10	266530	266539	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017805	GCCCG	2	10	267750	267759	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017805	CGGGC	2	10	267772	267781	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017805	CGCCC	2	10	273633	273642	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_017805	CAGGG	2	10	275774	275783	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017805	TAACG	2	10	315334	315343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017805	AGCGG	2	10	318300	318309	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017805	CGCCC	2	10	322613	322622	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_017805	CTCCC	2	10	328852	328861	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_017805	CGGGC	2	10	333425	333434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017805	GGCCT	2	10	339226	339235	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017805	TCCTG	2	10	341564	341573	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017805	GCCGC	2	10	344202	344211	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017805	CGCCC	2	10	347672	347681	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
77	NC_017805	GCCGG	3	15	353203	353217	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017805	CCCGG	2	10	358708	358717	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_017805	TTCTC	2	10	362490	362499	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017805	GCCGG	2	10	364593	364602	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017805	GAAGA	2	10	371573	371582	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017805	TGAGG	2	10	371628	371637	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017805	GGCGC	2	10	373189	373198	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017805	CGCGG	2	10	373313	373322	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017805	GCCGC	2	10	400348	400357	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_017805	AAGTC	2	10	420128	420137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.