MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017791	CACG	2	8	20	27	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017791	ACCT	2	8	293	300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017791	CCCG	2	8	5079	5086	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_017791	TGCC	2	8	13970	13977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017791	CCTC	2	8	15576	15583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017791	CCAT	2	8	17629	17636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017791	TCGT	2	8	19556	19563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017791	GAAA	2	8	20498	20505	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017791	TTGT	2	8	23279	23286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017791	CTGA	2	8	28518	28525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017791	CATC	2	8	36521	36528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017791	GAGG	2	8	36757	36764	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017791	CGAC	2	8	37162	37169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017791	TGGG	2	8	39754	39761	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017791	CCTA	2	8	40855	40862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017791	GTAC	2	8	47035	47042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017791	CGAC	2	8	47058	47065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017791	GCCC	2	8	50694	50701	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017791	AACC	2	8	50938	50945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017791	GCCC	2	8	51066	51073	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017791	CGAG	2	8	51968	51975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017791	AGCG	2	8	54573	54580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017791	GCTG	2	8	54753	54760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017791	GATG	2	8	55432	55439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017791	ACGA	2	8	55460	55467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017791	GGCC	2	8	59173	59180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017791	CGTC	2	8	68724	68731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017791	GCAG	2	8	69040	69047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017791	CCTT	2	8	69374	69381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017791	GCAT	2	8	71566	71573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017791	GCCC	2	8	73798	73805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017791	CCGG	2	8	73885	73892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017791	CCAC	2	8	74005	74012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_017791	GCCA	2	8	74124	74131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017791	GCGG	2	8	77557	77564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017791	TTCC	2	8	80596	80603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017791	GGCA	2	8	85968	85975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017791	AGGA	2	8	87073	87080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017791	GAGT	2	8	88859	88866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017791	GAGG	2	8	89024	89031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017791	AAGC	2	8	89169	89176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017791	CTGC	2	8	89178	89185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017791	CCGC	2	8	89488	89495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017791	CGCC	2	8	89935	89942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017791	CTTC	2	8	92903	92910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017791	TGGT	2	8	92989	92996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017791	AGCG	2	8	94816	94823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017791	CGCC	2	8	100278	100285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_017791	GTGG	2	8	107132	107139	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017791	ACGC	2	8	109994	110001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017791	ACGC	2	8	113833	113840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017791	CCAG	2	8	119348	119355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017791	CTGC	2	8	119849	119856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017791	GCTC	2	8	122640	122647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017791	AGCC	2	8	123366	123373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017791	GACG	2	8	124584	124591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017791	CAAG	2	8	126128	126135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017791	TCCT	2	8	129136	129143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017791	AAAT	2	8	142537	142544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017791	TTAT	2	8	142571	142578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017791	TGCG	2	8	143388	143395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017791	GCGG	2	8	144316	144323	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017791	CGGC	2	8	144435	144442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017791	CGCC	2	8	144462	144469	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017791	GGTC	2	8	147442	147449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017791	AGAA	2	8	153587	153594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017791	CCCT	2	8	153612	153619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_017791	CCGG	2	8	158818	158825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017791	CCCA	2	8	159041	159048	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_017791	AGGC	2	8	159050	159057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017791	AGGC	2	8	159340	159347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017791	AGGC	2	8	159411	159418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017791	AGGC	2	8	159483	159490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017791	TCCG	2	8	160892	160899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017791	GCGG	2	8	161875	161882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017791	CTGC	2	8	164836	164843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017791	CGAC	2	8	165972	165979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017791	TCCA	2	8	166259	166266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017791	CGAA	2	8	166480	166487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017791	GCTT	2	8	166623	166630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017791	CGGA	2	8	166644	166651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017791	GTCT	2	8	166807	166814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017791	ACGG	2	8	166879	166886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017791	GCTG	2	8	167059	167066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017791	GACG	2	8	167158	167165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017791	AGCG	2	8	168139	168146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017791	GCTG	2	8	168552	168559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017791	AGGG	2	8	168672	168679	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017791	CCGT	2	8	168747	168754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017791	CGGT	2	8	168889	168896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017791	GTTC	2	8	169231	169238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017791	CACT	2	8	171323	171330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017791	GCTG	2	8	174636	174643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017791	TCTT	2	8	185170	185177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017791	CGCC	2	8	185186	185193	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_017791	CAGC	2	8	189232	189239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017791	CCTG	2	8	206150	206157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017791	CGAC	2	8	207351	207358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017791	GCCC	2	8	211319	211326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_017791	GTGG	2	8	213639	213646	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017791	ATGG	2	8	226185	226192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017791	GCCC	2	8	226239	226246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_017791	CGCC	2	8	231084	231091	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_017791	ACCT	2	8	233090	233097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017791	TGCT	2	8	239477	239484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017791	CCAT	2	8	239542	239549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017791	GATG	2	8	239915	239922	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017791	CGAA	2	8	239944	239951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017791	AGCC	2	8	242220	242227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017791	ATCA	2	8	243017	243024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017791	GGGA	2	8	243285	243292	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017791	CCGA	2	8	245719	245726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017791	ACGG	2	8	247287	247294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017791	GCGG	2	8	247445	247452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017791	CACG	2	8	247525	247532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017791	CTGC	2	8	250049	250056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017791	TCCA	2	8	254745	254752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017791	TCTG	2	8	261229	261236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017791	CGTT	2	8	261463	261470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017791	TTCC	2	8	262792	262799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017791	GCCT	2	8	267373	267380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017791	AAGG	2	8	271311	271318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017791	CAGG	2	8	271369	271376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017791	CAGC	2	8	271562	271569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017791	CTAC	2	8	271596	271603	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017791	TGGC	2	8	271618	271625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017791	TCAG	2	8	272462	272469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017791	GGTG	2	8	277457	277464	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017791	ACCA	2	8	278105	278112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017791	CTCA	2	8	278252	278259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017791	TTGC	2	8	278381	278388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017791	ACCG	2	8	278393	278400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017791	ACGG	2	8	278644	278651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017791	GTCA	2	8	278702	278709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017791	CTCA	2	8	279977	279984	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017791	ACAG	2	8	279988	279995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017791	TTTC	2	8	280033	280040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017791	CACC	2	8	280243	280250	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_017791	CCTG	2	8	281882	281889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017791	CAGC	2	8	281926	281933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017791	GTCA	2	8	282736	282743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017791	CTCG	2	8	284979	284986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017791	GGCA	2	8	285036	285043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017791	TCCC	2	8	285059	285066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_017791	CCGG	2	8	286263	286270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017791	CAGG	2	8	286703	286710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017791	CGTT	2	8	287796	287803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017791	ATTT	2	8	291016	291023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017791	CCTG	2	8	293646	293653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017791	GGGC	2	8	293676	293683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017791	TGGA	2	8	297075	297082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017791	CGCC	2	8	299076	299083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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179	NC_017791	CAGG	2	8	387819	387826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_017791	CCGG	2	8	388041	388048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
181	NC_017791	ATAA	2	8	402816	402823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017791	TGGC	2	8	405141	405148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_017791	ACCG	2	8	405383	405390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
184	NC_017791	TGCC	2	8	407186	407193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_017791	CCCA	2	8	410349	410356	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
186	NC_017791	TGCG	2	8	414207	414214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NC_017791	TGTC	2	8	420660	420667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
188	NC_017791	GGGC	2	8	423954	423961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
189	NC_017791	CGGA	2	8	424426	424433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.