MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P3

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017771	GGGGC	2	10	15234	15243	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017771	CCAGT	2	10	27057	27066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017771	GCTGT	2	10	46068	46077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017771	CAGAA	2	10	48808	48817	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017771	CAATT	2	10	48988	48997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017771	AAGGC	2	10	55902	55911	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017771	ACACC	2	10	59051	59060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017771	CCCTG	2	10	77496	77505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017771	GAGTC	2	10	77513	77522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017771	ATTCG	2	10	84530	84539	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017771	CCCTA	2	10	85437	85446	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017771	TGGTC	2	10	91655	91664	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017771	CTCAT	2	10	91691	91700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017771	GCACC	2	10	91965	91974	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017771	CCCCG	2	10	103046	103055	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_017771	CCTGA	2	10	111644	111653	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017771	CCACC	2	10	112920	112929	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_017771	GCCAA	2	10	115522	115531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017771	TCCCC	2	10	125888	125897	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_017771	CAGCT	2	10	154462	154471	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017771	GGGGC	2	10	156422	156431	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017771	GACGT	2	10	157573	157582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017771	CCCCT	2	10	158213	158222	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_017771	TCGCC	2	10	158379	158388	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017771	TTGCC	2	10	158775	158784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017771	GCGTT	2	10	159731	159740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017771	GCTCA	2	10	167137	167146	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017771	CCAAT	2	10	175892	175901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017771	CCTGC	2	10	182107	182116	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017771	AATGA	2	10	183489	183498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017771	GCAGG	2	10	184287	184296	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017771	CCCCG	2	10	191400	191409	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_017771	AAATC	2	10	197730	197739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017771	GCAGC	2	10	212218	212227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017771	GCTCG	2	10	213531	213540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017771	TTCTG	2	10	217316	217325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.