MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P3

Total Repeats: 478

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017771	CAT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017771	CGC	2	6	65	70	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017771	CGC	2	6	178	183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017771	CAG	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017771	GGA	2	6	569	574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017771	GCT	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017771	CAC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017771	CCG	2	6	671	676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017771	CGT	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017771	GCC	2	6	2161	2166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017771	CGG	2	6	2181	2186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017771	GTC	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017771	GCT	2	6	9692	9697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017771	GAA	2	6	9737	9742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017771	TCG	2	6	9808	9813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017771	CAC	2	6	9889	9894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017771	ACG	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017771	AGG	2	6	15209	15214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017771	AGC	2	6	15217	15222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017771	CCG	2	6	15226	15231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017771	GCA	2	6	15251	15256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017771	GTC	2	6	16191	16196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017771	CCT	2	6	16236	16241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017771	TCC	2	6	18136	18141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017771	CCT	2	6	18147	18152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017771	CTC	2	6	18954	18959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017771	CAC	2	6	21208	21213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017771	GGC	2	6	21238	21243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017771	CTG	2	6	21254	21259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017771	TCT	2	6	21260	21265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017771	CAC	2	6	21320	21325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017771	AGG	2	6	22598	22603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017771	GGC	2	6	23434	23439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017771	CGC	2	6	23631	23636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017771	TCC	2	6	23657	23662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017771	AGG	2	6	23696	23701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017771	CTG	2	6	24746	24751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017771	TTC	2	6	24783	24788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017771	AGC	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017771	CAG	2	6	27140	27145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017771	ATC	2	6	27267	27272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017771	AGT	2	6	27291	27296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017771	TTG	3	9	27526	27534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017771	AAC	2	6	27571	27576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017771	AGG	2	6	27581	27586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017771	CGT	2	6	27593	27598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017771	CCA	2	6	27603	27608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017771	CAC	2	6	27649	27654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017771	CGT	2	6	27700	27705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017771	TGA	2	6	27775	27780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017771	GAA	2	6	29116	29121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017771	GCT	2	6	31691	31696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017771	CGA	2	6	31697	31702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017771	GGA	2	6	31757	31762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017771	CTG	2	6	31770	31775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017771	CAT	2	6	32207	32212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017771	CCA	2	6	32254	32259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017771	TGG	2	6	34598	34603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017771	GCA	2	6	34730	34735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017771	GCC	2	6	34754	34759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017771	TGG	2	6	34778	34783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017771	ATA	2	6	34944	34949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017771	CAA	2	6	35012	35017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017771	TCA	2	6	35021	35026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017771	TAG	2	6	35032	35037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017771	AGA	2	6	35097	35102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017771	GAA	3	9	35107	35115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017771	TAC	2	6	35171	35176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017771	CAT	2	6	35185	35190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017771	CAA	2	6	38354	38359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017771	TAA	2	6	38506	38511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017771	GCT	2	6	38577	38582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017771	AGG	2	6	38593	38598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017771	ATT	2	6	39229	39234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017771	GCC	2	6	44647	44652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017771	GCC	2	6	44714	44719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017771	CGT	2	6	44739	44744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017771	TCT	2	6	45639	45644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017771	AAG	2	6	46185	46190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017771	ATG	2	6	46238	46243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017771	CCT	2	6	46247	46252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017771	GTC	2	6	46311	46316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017771	TGT	3	9	46359	46367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017771	TCC	2	6	46516	46521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017771	GCC	2	6	48116	48121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017771	TGG	2	6	48224	48229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017771	AGG	2	6	48326	48331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017771	TGG	2	6	48533	48538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017771	AGG	2	6	48841	48846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017771	CTT	2	6	48879	48884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017771	CCA	2	6	49888	49893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017771	GGC	2	6	53041	53046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017771	GCC	2	6	53057	53062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017771	CAG	2	6	53296	53301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017771	CGC	2	6	53609	53614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017771	GCC	2	6	54297	54302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017771	CGC	2	6	55655	55660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017771	AAT	2	6	55759	55764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017771	GCC	2	6	55825	55830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017771	ATT	2	6	55937	55942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017771	AGG	2	6	56008	56013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017771	CCT	2	6	56109	56114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017771	TGG	2	6	56345	56350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017771	GCC	2	6	56358	56363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017771	AGC	2	6	57217	57222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017771	GAG	2	6	57223	57228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017771	TAT	2	6	57270	57275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017771	ATA	2	6	57297	57302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017771	TCA	2	6	57331	57336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017771	AAT	2	6	57346	57351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017771	AAG	2	6	58328	58333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017771	CTC	2	6	58373	58378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017771	CGG	2	6	58425	58430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017771	CGA	2	6	59209	59214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017771	AAT	2	6	59242	59247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017771	GGC	2	6	59323	59328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017771	TCC	2	6	60819	60824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017771	CAA	2	6	61022	61027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017771	GTG	2	6	62533	62538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017771	CTT	2	6	63446	63451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017771	GGA	2	6	63555	63560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017771	TTG	2	6	64124	64129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017771	AGG	2	6	65770	65775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017771	CTG	3	9	65777	65785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017771	TGG	2	6	66075	66080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017771	GTT	2	6	66109	66114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017771	GGC	2	6	66124	66129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017771	CTC	2	6	66183	66188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017771	TCC	2	6	66240	66245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017771	TCT	2	6	66397	66402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017771	GGC	3	9	66414	66422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017771	ACC	2	6	67814	67819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017771	GTT	2	6	68997	69002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017771	CGG	2	6	69476	69481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017771	TTC	2	6	69500	69505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017771	CCT	2	6	71115	71120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017771	GGC	2	6	77686	77691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017771	CAG	2	6	77699	77704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017771	ATG	2	6	83554	83559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017771	ATA	2	6	83616	83621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017771	TTA	2	6	83718	83723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.