MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 10582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017310	GCA	2	6	3344293	3344298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_017310	TGC	2	6	3344302	3344307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_017310	CGG	2	6	3344336	3344341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_017310	GCA	2	6	3344389	3344394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017310	CCA	2	6	3344500	3344505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_017310	TGT	2	6	3344513	3344518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_017310	GGGC	2	8	3344654	3344661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_017310	CG	3	6	3346800	3346805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_017310	CGTGA	2	10	3346833	3346842	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10010	NC_017310	A	6	6	3346954	3346959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_017310	CCG	2	6	3346981	3346986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_017310	CGG	2	6	3347019	3347024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017310	ACC	2	6	3347042	3347047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_017310	CGC	3	9	3347641	3347649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_017310	CGG	2	6	3347673	3347678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_017310	TTC	2	6	3347682	3347687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_017310	G	6	6	3347693	3347698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017310	TCA	2	6	3347699	3347704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_017310	C	6	6	3347727	3347732	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10020	NC_017310	GC	3	6	3347734	3347739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_017310	AC	3	6	3347741	3347746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_017310	CTT	2	6	3349029	3349034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_017310	CGC	2	6	3349121	3349126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_017310	CGG	2	6	3349179	3349184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_017310	TC	3	6	3349983	3349988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_017310	CAG	2	6	3349989	3349994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_017310	CTG	2	6	3349996	3350001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_017310	G	7	7	3350143	3350149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017310	CGT	2	6	3350159	3350164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_017310	AGG	2	6	3350174	3350179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017310	GCA	2	6	3350506	3350511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017310	CTG	2	6	3350517	3350522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_017310	CTT	2	6	3350527	3350532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_017310	TCT	2	6	3350605	3350610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_017310	GC	3	6	3352733	3352738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_017310	GA	3	6	3352825	3352830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_017310	CGG	2	6	3354538	3354543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_017310	T	7	7	3354560	3354566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_017310	AGG	2	6	3354568	3354573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017310	CAGCA	2	10	3356998	3357007	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10041	NC_017310	ACA	2	6	3357074	3357079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_017310	GCC	2	6	3357126	3357131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10043	NC_017310	ACG	2	6	3357135	3357140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_017310	CCGGG	2	10	3358105	3358114	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10045	NC_017310	ACA	2	6	3358139	3358144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_017310	GAT	2	6	3358202	3358207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017310	CGTCCG	2	12	3358216	3358227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_017310	GTC	2	6	3358266	3358271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_017310	CCG	2	6	3358307	3358312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_017310	GGC	2	6	3359821	3359826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_017310	GCC	3	9	3359844	3359852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_017310	GAA	2	6	3359863	3359868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017310	CG	3	6	3362482	3362487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_017310	ACGGG	2	10	3362496	3362505	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10055	NC_017310	GCC	2	6	3362586	3362591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_017310	GCG	2	6	3362647	3362652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_017310	AGAC	2	8	3363638	3363645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_017310	ACG	2	6	3363685	3363690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_017310	CG	3	6	3363689	3363694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_017310	GGGGC	2	10	3363730	3363739	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10061	NC_017310	AAG	2	6	3363762	3363767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_017310	CGC	2	6	3366585	3366590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_017310	GGC	2	6	3366591	3366596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_017310	TGC	2	6	3366656	3366661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_017310	CTGC	2	8	3366684	3366691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_017310	GCGG	2	8	3366759	3366766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_017310	GCGG	2	8	3366770	3366777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_017310	ACG	2	6	3366790	3366795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_017310	GGC	3	9	3366796	3366804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_017310	CGC	3	9	3366814	3366822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_017310	GCC	2	6	3366831	3366836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_017310	GCG	2	6	3366873	3366878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_017310	CAAGGC	2	12	3368025	3368036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_017310	GCC	2	6	3368085	3368090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10075	NC_017310	CCG	2	6	3368108	3368113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10076	NC_017310	TCT	2	6	3368163	3368168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_017310	ACG	3	9	3369118	3369126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_017310	CAT	2	6	3369146	3369151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_017310	CCG	2	6	3369202	3369207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_017310	GAC	2	6	3369247	3369252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_017310	GAC	2	6	3369343	3369348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_017310	CAGGA	2	10	3369391	3369400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10083	NC_017310	CAT	2	6	3371724	3371729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_017310	CGG	2	6	3371801	3371806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_017310	CCG	2	6	3371811	3371816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_017310	GGC	2	6	3371843	3371848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10089	NC_017310	CG	3	6	3373686	3373691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_017310	CGT	2	6	3373713	3373718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_017310	GCGCG	2	10	3373752	3373761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10092	NC_017310	GTC	2	6	3373785	3373790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_017310	CCG	2	6	3373794	3373799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_017310	CGG	2	6	3373839	3373844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_017310	CAG	2	6	3373863	3373868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_017310	AGG	2	6	3377294	3377299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_017310	GCA	2	6	3378292	3378297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_017310	C	6	6	3378329	3378334	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10099	NC_017310	TGCG	2	8	3378335	3378342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_017310	CGCC	2	8	3378364	3378371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10101	NC_017310	CA	3	6	3379878	3379883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_017310	GCT	2	6	3379914	3379919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_017310	AC	3	6	3379943	3379948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_017310	GCA	2	6	3379967	3379972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_017310	A	7	7	3379974	3379980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017310	CTT	2	6	3379987	3379992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_017310	AAG	2	6	3380018	3380023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_017310	CAT	2	6	3380069	3380074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_017310	TGA	2	6	3380078	3380083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_017310	GAC	2	6	3380127	3380132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_017310	GCC	2	6	3380180	3380185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_017310	TGG	2	6	3380290	3380295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017310	TGG	2	6	3380355	3380360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017310	CGC	2	6	3380462	3380467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_017310	T	6	6	3380490	3380495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017310	CACGA	2	10	3380517	3380526	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10117	NC_017310	T	6	6	3380558	3380563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017310	ACG	2	6	3380622	3380627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_017310	GCCA	2	8	3380764	3380771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_017310	CGC	2	6	3380808	3380813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_017310	CGC	2	6	3380819	3380824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_017310	GGA	2	6	3380831	3380836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017310	ACG	2	6	3382562	3382567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_017310	CCT	2	6	3382629	3382634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_017310	GAC	3	9	3382691	3382699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_017310	CAGA	2	8	3382720	3382727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10127	NC_017310	CAT	2	6	3382800	3382805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_017310	GCC	2	6	3382811	3382816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10130	NC_017310	ACG	2	6	3383185	3383190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10132	NC_017310	TGGC	2	8	3383273	3383280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10142	NC_017310	CA	3	6	3388420	3388425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10143	NC_017310	GGCT	2	8	3388636	3388643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10145	NC_017310	GGAC	2	8	3388687	3388694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10150	NC_017310	TG	3	6	3389335	3389340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_017310	AGCAT	2	10	3389342	3389351	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10154	NC_017310	CA	3	6	3389510	3389515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10250	NC_017310	ATT	2	6	3428083	3428088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_017310	TTA	2	6	3428089	3428094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_017310	ATA	2	6	3428097	3428102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_017310	GCG	2	6	3431268	3431273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_017310	CAG	2	6	3431274	3431279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_017310	ACA	2	6	3431299	3431304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10257	NC_017310	G	7	7	3432506	3432512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_017310	ATG	2	6	3432561	3432566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_017310	GCA	2	6	3432614	3432619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10260	NC_017310	CAGC	2	8	3432624	3432631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10261	NC_017310	CGTC	2	8	3432672	3432679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10262	NC_017310	CATGG	2	10	3435624	3435633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10263	NC_017310	CGGG	2	8	3435665	3435672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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10374	NC_017310	CCCG	2	8	3465039	3465046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10375	NC_017310	GGC	2	6	3465055	3465060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10379	NC_017310	C	7	7	3466862	3466868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10380	NC_017310	ATG	2	6	3466887	3466892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10381	NC_017310	TC	3	6	3466914	3466919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10382	NC_017310	C	8	8	3466992	3466999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10383	NC_017310	GCT	2	6	3467096	3467101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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