MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 10582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017310	GCT	2	6	148435	148440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017310	GGA	2	6	148560	148565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017310	GATG	2	8	148668	148675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017310	GAA	2	6	148821	148826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017310	AAGG	2	8	148864	148871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017310	TGC	2	6	148899	148904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017310	GTC	2	6	148911	148916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017310	GGA	2	6	149025	149030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017310	GAC	2	6	149038	149043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017310	TCA	2	6	149050	149055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017310	AC	3	6	149076	149081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_017310	TAC	2	6	149083	149088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017310	AC	3	6	149245	149250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_017310	CAC	2	6	149260	149265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_017310	GAT	2	6	149332	149337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017310	CCT	2	6	149388	149393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017310	GCT	2	6	149419	149424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017310	CAC	2	6	149540	149545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017310	CCA	2	6	149637	149642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017310	TGG	2	6	149645	149650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017310	ACG	2	6	149651	149656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017310	CGG	2	6	149734	149739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017310	GAA	2	6	149838	149843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017310	GAG	2	6	149873	149878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017310	GGA	2	6	150004	150009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017310	GCG	2	6	150038	150043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017310	ACT	2	6	150114	150119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017310	GGA	2	6	150240	150245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017310	ACG	2	6	150489	150494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017310	GGA	2	6	150556	150561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017310	AT	3	6	150652	150657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017310	CCA	2	6	150717	150722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017310	CGG	2	6	150779	150784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017310	CGT	2	6	150796	150801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017310	GGT	2	6	150861	150866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017310	GTT	2	6	150870	150875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017310	AGC	2	6	150901	150906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017310	AAAG	2	8	150915	150922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017310	CG	3	6	151239	151244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_017310	GGTG	2	8	151443	151450	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017310	GA	3	6	151473	151478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017310	GAA	2	6	151520	151525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017310	CT	3	6	151532	151537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017310	TGG	3	9	151583	151591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017310	GAC	2	6	151632	151637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017310	AGG	2	6	151677	151682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017310	CGG	2	6	151723	151728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017310	G	6	6	151973	151978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017310	ACC	2	6	151994	151999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017310	GGGA	2	8	152037	152044	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017310	TGG	2	6	152054	152059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017310	AGAC	2	8	152173	152180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017310	GGT	2	6	152217	152222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017310	TCA	2	6	152332	152337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017310	CGT	2	6	152412	152417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017310	TCT	2	6	152436	152441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017310	TGG	2	6	152505	152510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017310	TGT	2	6	152514	152519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017310	TG	3	6	152547	152552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017310	GCCT	2	8	152587	152594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_017310	GCG	2	6	152670	152675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017310	TTC	2	6	152718	152723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017310	GGC	2	6	152774	152779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017310	AGCC	2	8	152788	152795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017310	GGA	2	6	152835	152840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017310	GAT	2	6	152892	152897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017310	CTTTT	2	10	152938	152947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_017310	CGC	2	6	152979	152984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_017310	GCC	2	6	153012	153017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017310	CTC	2	6	153053	153058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017310	C	6	6	153063	153068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
572	NC_017310	CCT	2	6	153122	153127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_017310	CCTG	2	8	153144	153151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017310	CTG	2	6	153176	153181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017310	TTG	2	6	153200	153205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017310	GCTC	2	8	153211	153218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017310	TGA	2	6	153239	153244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017310	GCT	2	6	153245	153250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017310	GGA	2	6	153259	153264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017310	TACG	2	8	153303	153310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_017310	GCT	2	6	153345	153350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017310	TGTC	2	8	153365	153372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_017310	GTC	2	6	153380	153385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017310	GCC	2	6	153434	153439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017310	CAA	2	6	153441	153446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017310	ATC	2	6	153489	153494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017310	ATG	2	6	153495	153500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017310	CTGA	2	8	153589	153596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_017310	CCT	2	6	153628	153633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_017310	GA	3	6	153646	153651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017310	ACTC	2	8	153708	153715	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_017310	ACCG	2	8	153820	153827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
593	NC_017310	TCC	2	6	156694	156699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_017310	ATT	2	6	156757	156762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017310	GCG	2	6	156787	156792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017310	TTG	2	6	156793	156798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017310	CTG	2	6	156857	156862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017310	GCT	2	6	156867	156872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017310	GTC	2	6	156901	156906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017310	GAAT	2	8	157076	157083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017310	GGC	2	6	157116	157121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017310	CAT	2	6	157127	157132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017310	CCG	2	6	158251	158256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017310	GTG	2	6	159051	159056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017310	GCC	2	6	159064	159069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_017310	CCA	2	6	162441	162446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_017310	GGA	2	6	162507	162512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017310	ATG	2	6	162571	162576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017310	GGC	2	6	162611	162616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017310	CCT	3	9	165097	165105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_017310	CTG	2	6	165109	165114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017310	CCG	2	6	165149	165154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_017310	CGGTG	2	10	165160	165169	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
614	NC_017310	GCT	2	6	167507	167512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017310	TC	3	6	167541	167546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_017310	CGG	2	6	167555	167560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017310	CGG	2	6	171435	171440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017310	CCG	2	6	171448	171453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_017310	CGGTGC	2	12	171480	171491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017310	GGTG	2	8	171552	171559	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017310	ACG	2	6	171632	171637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017310	GCG	2	6	171654	171659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017310	GCG	2	6	171663	171668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017310	GGA	2	6	171686	171691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017310	TGT	2	6	171710	171715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017310	G	7	7	171755	171761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017310	GT	3	6	173157	173162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017310	TGAAC	2	10	173182	173191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
629	NC_017310	GCG	2	6	173270	173275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017310	GGC	2	6	175259	175264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017310	CGC	3	9	175268	175276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_017310	CGG	2	6	175310	175315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017310	G	6	6	175314	175319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017310	CGG	2	6	176890	176895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017310	GCTG	3	12	176930	176941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_017310	CGC	2	6	177018	177023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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655	NC_017310	CGG	2	6	182896	182901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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776	NC_017310	GCG	2	6	223617	223622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_017310	GGCC	2	8	223624	223631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
778	NC_017310	G	8	8	223652	223659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
779	NC_017310	TCC	2	6	225363	225368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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781	NC_017310	TCC	2	6	225681	225686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
782	NC_017310	CGCGT	2	10	225813	225822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
783	NC_017310	GAAG	2	8	225889	225896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
784	NC_017310	AAG	2	6	225902	225907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
785	NC_017310	ACA	2	6	225942	225947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_017310	G	7	7	225987	225993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
787	NC_017310	GTT	2	6	228907	228912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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790	NC_017310	CAGAG	2	10	231551	231560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
791	NC_017310	TGCG	2	8	231594	231601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
792	NC_017310	GTGCA	2	10	231837	231846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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794	NC_017310	GGCA	2	8	232377	232384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
795	NC_017310	GTC	2	6	232387	232392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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799	NC_017310	CGGC	2	8	232725	232732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
800	NC_017310	GTG	2	6	232759	232764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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804	NC_017310	GCG	2	6	240391	240396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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812	NC_017310	CTTT	2	8	245439	245446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
813	NC_017310	TTC	2	6	245447	245452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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819	NC_017310	G	7	7	247266	247272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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824	NC_017310	ATC	2	6	253059	253064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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902	NC_017310	CTG	3	9	271551	271559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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906	NC_017310	A	7	7	271785	271791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
907	NC_017310	GGA	2	6	271839	271844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
908	NC_017310	CGTGA	2	10	271860	271869	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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910	NC_017310	CCG	2	6	272815	272820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
911	NC_017310	CGG	2	6	272831	272836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
912	NC_017310	GCCC	2	8	272953	272960	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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948	NC_017310	GTA	2	6	277293	277298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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