MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	AAGTG	2	10	1857	1866	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016629	CACGG	2	10	17236	17245	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016629	GCCCG	2	10	25681	25690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016629	GACGC	2	10	25949	25958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016629	GGGCG	2	10	34179	34188	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016629	CCAGA	2	10	53004	53013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016629	TCCCG	2	10	62588	62597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016629	CAGGC	2	10	77560	77569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016629	CTTTT	2	10	79674	79683	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016629	GCGTG	2	10	81238	81247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016629	ATCAG	2	10	81583	81592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016629	CCAGC	2	10	92538	92547	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016629	CTGGG	2	10	130716	130725	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016629	CTGGT	2	10	143873	143882	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016629	TGAAA	2	10	145487	145496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016629	CGGTG	2	10	158579	158588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016629	CACCC	2	10	166769	166778	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_016629	TTCTC	2	10	166992	167001	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016629	GCCTT	2	10	170670	170679	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016629	TCGTC	2	10	176522	176531	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016629	GTCAG	2	10	184547	184556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016629	AGAAA	2	10	184615	184624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016629	CAGGA	2	10	185978	185987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016629	CGATG	2	10	186041	186050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016629	AGTAT	2	10	200418	200427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016629	TCATT	2	10	230470	230479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016629	GGCGT	2	10	277100	277109	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016629	GCTCG	2	10	277113	277122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016629	ATGGC	2	10	280912	280921	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016629	CGAGG	2	10	289650	289659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016629	CCCTA	2	10	291223	291232	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016629	AAGGC	2	10	296971	296980	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016629	AAATT	2	10	297054	297063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016629	TCACG	2	10	303152	303161	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016629	GACAG	2	10	336784	336793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016629	CCTGC	2	10	337265	337274	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_016629	CTTTT	2	10	338762	338771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016629	CATCG	2	10	342072	342081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016629	CTGTG	2	10	346121	346130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016629	ACGGA	2	10	346239	346248	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016629	GCAAG	2	10	387324	387333	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016629	AGCCA	2	10	387411	387420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016629	TCCTC	2	10	388125	388134	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_016629	TGCCT	2	10	389707	389716	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016629	TGCCC	2	10	390284	390293	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016629	AGCTT	2	10	392666	392675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016629	GAGCA	2	10	402341	402350	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016629	TCTCC	2	10	412001	412010	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_016629	TAACC	2	10	412041	412050	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016629	AAGCC	2	10	423180	423189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016629	CACTC	2	10	423392	423401	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_016629	CCTCG	2	10	435320	435329	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016629	CCTGG	2	10	435380	435389	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016629	TGGAT	2	10	437921	437930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016629	ATACA	2	10	438184	438193	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016629	CCGCT	2	10	461231	461240	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_016629	GTTAC	2	10	467115	467124	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016629	GCGCT	2	10	471314	471323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016629	GCATG	2	10	484635	484644	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016629	TTTTC	2	10	484661	484670	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016629	GATTG	2	10	485384	485393	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016629	TCCTC	2	10	489259	489268	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_016629	CATGC	2	10	497661	497670	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016629	TGATT	2	10	503779	503788	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016629	GTTTG	2	10	534216	534225	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016629	CGTCG	2	10	541539	541548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016629	AAAGC	2	10	547139	547148	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016629	TGCGA	2	10	558772	558781	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016629	GGGAT	2	10	567825	567834	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016629	GCGAG	2	10	574167	574176	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016629	TCCGG	2	10	578677	578686	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016629	CCTCT	2	10	583777	583786	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_016629	ACAAA	2	10	598742	598751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016629	GCCGC	2	10	608714	608723	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016629	TCAGA	2	10	608833	608842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016629	AGCCA	2	10	622499	622508	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016629	GCCCT	2	10	631562	631571	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_016629	CACCC	2	10	638297	638306	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NC_016629	AAGAG	2	10	644028	644037	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016629	GTCAA	2	10	655122	655131	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016629	ATGAC	2	10	658197	658206	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016629	CAGAC	2	10	662232	662241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016629	TGATT	2	10	670761	670770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016629	CTCGA	2	10	674620	674629	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016629	CGCGG	2	10	676158	676167	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016629	ATCGG	2	10	686362	686371	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016629	GCTTT	2	10	686454	686463	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016629	CGGCT	2	10	700542	700551	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016629	CCCCT	2	10	713972	713981	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_016629	TGCCC	2	10	715177	715186	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_016629	CAAGC	2	10	719894	719903	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016629	AACAG	2	10	719910	719919	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016629	CATCT	2	10	724222	724231	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016629	GGGGC	2	10	753004	753013	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016629	TTCTC	2	10	753116	753125	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016629	CTGGG	2	10	753170	753179	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016629	GTTGG	2	10	753211	753220	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016629	CTTAA	2	10	768401	768410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016629	GACAG	2	10	773674	773683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016629	GCATG	2	10	779709	779718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016629	GACAG	2	10	779808	779817	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016629	AGAGG	2	10	781614	781623	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016629	TTGCG	2	10	794426	794435	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016629	ACTTA	2	10	812593	812602	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016629	CCAGG	2	10	826760	826769	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016629	CTTGT	2	10	835208	835217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016629	GTTTC	2	10	844986	844995	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016629	GGAGT	2	10	846523	846532	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016629	CGCGA	2	10	847316	847325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016629	CAATT	2	10	856169	856178	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016629	GGCAT	2	10	856346	856355	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016629	GCTGC	2	10	864974	864983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016629	CTCGC	2	10	865097	865106	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_016629	GATGC	2	10	868970	868979	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016629	GGGGA	2	10	873943	873952	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016629	GGGGA	2	10	888667	888676	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016629	TCCCC	2	10	888696	888705	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
118	NC_016629	ACCCC	2	10	888708	888717	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_016629	CCGGC	2	10	896532	896541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_016629	CTTTT	2	10	917500	917509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016629	CGGGC	2	10	924830	924839	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016629	GGCTT	2	10	926518	926527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016629	CTGAC	2	10	941867	941876	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016629	CGCAC	2	10	952457	952466	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_016629	GGCTT	2	10	953312	953321	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016629	TCATT	2	10	979177	979186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016629	AAATG	2	10	991242	991251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016629	GGGCC	2	10	992765	992774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016629	CTTTT	2	10	998320	998329	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016629	CATGC	2	10	1000089	1000098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016629	TGGCA	2	10	1005990	1005999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016629	TCGGA	2	10	1013622	1013631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016629	ACAGG	2	10	1013635	1013644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016629	ATACA	2	10	1014066	1014075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016629	TTCTC	2	10	1018636	1018645	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016629	TGGTC	2	10	1026138	1026147	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016629	AAGGC	2	10	1037666	1037675	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016629	GGCAA	2	10	1042971	1042980	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016629	GGAGT	2	10	1043074	1043083	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016629	CCCTG	2	10	1045270	1045279	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_016629	TTGCG	2	10	1052450	1052459	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016629	ACGCG	2	10	1057735	1057744	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_016629	GACGT	2	10	1063335	1063344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016629	AAGAT	2	10	1064094	1064103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016629	ATACC	2	10	1068815	1068824	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_016629	GCAAG	2	10	1072689	1072698	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_016629	CAAGC	2	10	2066340	2066349	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_016629	GCATG	2	10	2109082	2109091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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424	NC_016629	CATAT	2	10	2986462	2986471	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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452	NC_016629	CGGGG	2	10	3183148	3183157	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
453	NC_016629	AGCGT	2	10	3188674	3188683	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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456	NC_016629	CGCAA	2	10	3217650	3217659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
457	NC_016629	CGCAA	3	15	3217836	3217850	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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460	NC_016629	GATGG	2	10	3237649	3237658	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_016629	TGCCG	2	10	3247207	3247216	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
463	NC_016629	GCTCG	2	10	3248338	3248347	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
464	NC_016629	GAGCA	2	10	3261453	3261462	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
465	NC_016629	TGAAG	2	10	3262358	3262367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016629	TTAGA	2	10	3274857	3274866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016629	ATTTC	2	10	3287845	3287854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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477	NC_016629	ATAGA	2	10	3335012	3335021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_016629	CTCTC	2	10	3419872	3419881	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
483	NC_016629	TCCTC	2	10	3427536	3427545	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
484	NC_016629	ATTAA	2	10	3427721	3427730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_016629	CTTGC	2	10	3473781	3473790	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
486	NC_016629	GCCGG	2	10	3473802	3473811	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
487	NC_016629	CGGCA	2	10	3483562	3483571	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
488	NC_016629	TGTAA	2	10	3490099	3490108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_016629	TCCGG	2	10	3594063	3594072	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
499	NC_016629	CGGAC	2	10	3595569	3595578	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
500	NC_016629	TGCTT	2	10	3599448	3599457	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

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