MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Dechlorosoma suillum PS chromosome

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016616	TA	3	6	9222	9227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016616	GA	3	6	12406	12411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016616	GA	3	6	16550	16555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016616	AC	3	6	20352	20357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016616	GC	3	6	27017	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016616	GA	3	6	39155	39160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016616	CA	3	6	39473	39478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016616	GC	3	6	49107	49112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016616	TC	3	6	62647	62652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016616	AT	3	6	62935	62940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016616	CT	3	6	76735	76740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016616	CA	3	6	76895	76900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016616	GC	3	6	93232	93237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016616	CG	3	6	104520	104525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016616	TC	3	6	105521	105526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016616	CA	3	6	105615	105620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016616	AT	3	6	114548	114553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016616	AT	3	6	124935	124940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016616	GA	3	6	125045	125050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016616	AT	3	6	130783	130788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016616	GT	3	6	130988	130993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016616	AG	4	8	141361	141368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016616	GA	3	6	141516	141521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016616	GC	3	6	145165	145170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016616	CG	3	6	145313	145318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016616	TA	3	6	145353	145358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016616	TG	3	6	148076	148081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016616	CA	3	6	154470	154475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016616	CT	3	6	156100	156105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016616	CT	3	6	165460	165465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016616	GC	4	8	167443	167450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016616	CT	3	6	171743	171748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016616	GT	3	6	183043	183048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016616	GA	3	6	189824	189829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016616	CA	3	6	220629	220634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016616	TA	3	6	222662	222667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016616	TC	3	6	224389	224394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016616	GA	3	6	227184	227189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016616	CT	3	6	234211	234216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016616	CA	3	6	234217	234222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016616	CT	3	6	247374	247379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016616	GA	4	8	253189	253196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016616	GC	3	6	254077	254082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016616	GA	3	6	254847	254852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016616	GC	3	6	266438	266443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016616	TA	3	6	286635	286640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016616	TG	3	6	286664	286669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016616	GC	3	6	298673	298678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016616	GC	3	6	318412	318417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016616	TC	4	8	331071	331078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016616	CT	3	6	342091	342096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016616	TA	3	6	355453	355458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016616	GC	3	6	375798	375803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016616	CA	3	6	391408	391413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016616	CT	3	6	394256	394261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016616	TC	3	6	424126	424131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016616	GC	3	6	434557	434562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016616	CG	3	6	442885	442890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016616	GC	3	6	499394	499399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016616	CA	3	6	499478	499483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016616	AT	3	6	532888	532893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016616	GC	3	6	533693	533698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016616	CG	3	6	547909	547914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016616	GA	3	6	550736	550741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016616	GC	3	6	550784	550789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016616	CA	3	6	550894	550899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016616	AG	3	6	557068	557073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016616	AT	3	6	567422	567427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016616	CG	3	6	571400	571405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016616	TA	3	6	581054	581059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016616	CA	3	6	583521	583526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016616	GC	3	6	598917	598922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016616	GC	3	6	612701	612706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016616	AG	3	6	627425	627430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016616	CG	3	6	632620	632625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016616	GA	3	6	632699	632704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016616	CT	3	6	658461	658466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016616	TC	3	6	658891	658896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016616	GC	3	6	705363	705368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016616	CT	3	6	755151	755156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016616	GC	3	6	768309	768314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016616	CA	3	6	770663	770668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016616	AT	4	8	771779	771786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016616	TA	3	6	772673	772678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016616	GA	3	6	781567	781572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016616	CG	3	6	797789	797794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016616	GC	3	6	797838	797843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016616	AT	3	6	798073	798078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016616	GA	3	6	798968	798973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016616	CG	3	6	799297	799302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016616	AG	3	6	799350	799355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016616	TC	3	6	812317	812322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016616	CG	3	6	832060	832065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016616	CT	3	6	837496	837501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016616	AC	3	6	837530	837535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016616	TG	3	6	840470	840475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016616	GT	3	6	842623	842628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016616	TG	3	6	867601	867606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016616	GT	3	6	874658	874663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016616	TC	3	6	876186	876191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016616	GC	3	6	885756	885761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016616	GC	3	6	917051	917056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016616	GC	3	6	964612	964617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016616	GC	3	6	980500	980505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016616	CT	3	6	981687	981692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016616	AG	3	6	1000483	1000488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016616	GC	3	6	1010856	1010861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016616	CT	4	8	1022983	1022990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016616	AT	3	6	1044874	1044879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016616	AC	3	6	1050088	1050093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016616	TG	3	6	1096426	1096431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016616	GA	3	6	1096497	1096502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016616	TC	3	6	1115899	1115904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016616	AT	3	6	1116839	1116844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016616	GC	3	6	1118004	1118009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016616	TA	3	6	1119958	1119963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016616	TG	3	6	1120032	1120037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016616	CG	3	6	1128435	1128440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016616	GA	3	6	1128764	1128769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016616	TC	4	8	1152995	1153002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016616	GC	3	6	1161048	1161053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016616	GC	3	6	1161106	1161111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016616	TC	3	6	1193690	1193695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016616	AG	3	6	1205509	1205514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016616	AG	3	6	1209025	1209030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016616	AG	4	8	1216199	1216206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016616	AG	3	6	1230618	1230623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016616	GA	3	6	1230665	1230670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016616	TC	3	6	1232253	1232258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016616	GC	3	6	1233344	1233349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016616	TA	4	8	1240320	1240327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016616	GA	3	6	1270387	1270392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016616	GA	3	6	1281401	1281406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016616	GT	3	6	1292151	1292156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016616	GA	3	6	1343322	1343327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016616	AT	3	6	1351512	1351517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016616	CG	3	6	1366747	1366752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016616	AG	3	6	1367780	1367785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016616	GA	3	6	1367795	1367800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016616	TC	3	6	1371659	1371664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016616	TA	3	6	1371715	1371720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016616	CT	3	6	1383014	1383019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016616	GT	3	6	1391191	1391196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016616	CT	3	6	1393196	1393201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016616	AT	3	6	1393503	1393508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016616	AC	3	6	1394927	1394932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016616	GC	3	6	1395158	1395163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016616	TC	3	6	1396412	1396417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016616	GA	3	6	1397244	1397249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016616	CT	4	8	1411385	1411392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016616	GT	3	6	1426986	1426991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_016616	AG	3	6	1461882	1461887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_016616	TC	4	8	3784140	3784147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.