MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus orientis DSM 765 chromosome

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016584	AATTAA	2	12	16269	16280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016584	AAGCGA	2	12	96785	96796	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016584	CGCAGG	2	12	98756	98767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016584	AAGCGA	2	12	112265	112276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016584	CGCAGG	2	12	114236	114247	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016584	TTGTTT	2	12	115451	115462	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016584	AAGCGA	2	12	150853	150864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016584	CGCAGG	2	12	152824	152835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016584	GGTTCA	2	12	153130	153141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016584	TTATAA	2	12	269176	269187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016584	CTATAA	2	12	275691	275702	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016584	TCTCTT	2	12	304836	304847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016584	CTTCAA	2	12	320548	320559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016584	AAGATA	2	12	349384	349395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016584	GTTTGT	2	12	376692	376703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016584	AGAAGG	2	12	455823	455834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016584	TCAAGG	2	12	466896	466907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016584	CGCCTG	2	12	489431	489442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016584	TTGACA	2	12	497824	497835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016584	TATGAA	2	12	502494	502505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016584	AAATAA	2	12	510244	510255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016584	TGCCGC	2	12	539433	539444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016584	AAGCGA	2	12	602875	602886	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016584	CGCAGG	2	12	604846	604857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016584	AGAAGG	2	12	609598	609609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016584	GTGTAT	3	18	617381	617398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016584	GAGGAA	2	12	644512	644523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016584	TTTTAA	2	12	665628	665639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016584	ATGATC	2	12	670694	670705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016584	GGCTTT	2	12	755520	755531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016584	CTACAA	2	12	759538	759549	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016584	ATTAAT	2	12	768945	768956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016584	AGTTGC	2	12	770358	770369	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016584	AATTGG	2	12	801368	801379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016584	TATTTT	2	12	812244	812255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016584	AAAATA	2	12	817459	817470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016584	GGGAGT	2	12	818111	818122	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016584	AAGCGA	2	12	922959	922970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016584	CGCAGG	2	12	924930	924941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016584	GGTTCA	2	12	925236	925247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016584	TCCAAA	2	12	954166	954177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016584	TGTGAG	2	12	967110	967121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016584	CTAAAA	2	12	975296	975307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016584	CGCCTG	2	12	996361	996372	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016584	ATGAAG	2	12	1033115	1033126	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016584	AATTTT	2	12	1055582	1055593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016584	CGATTA	2	12	1140390	1140401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016584	GGGTTA	2	12	1140441	1140452	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016584	TGAAGC	2	12	1151670	1151681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016584	AGCATA	2	12	1153515	1153526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016584	TAATTG	2	12	1192595	1192606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016584	ATTCCT	2	12	1193754	1193765	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016584	GGATAG	2	12	1194455	1194466	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016584	ATAATT	2	12	1195350	1195361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016584	TAAAAA	2	12	1202442	1202453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016584	TTTAAA	2	12	1211753	1211764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016584	TTTAAA	2	12	1216800	1216811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016584	ATTTTA	2	12	1260383	1260394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016584	CTAAAT	2	12	1271995	1272006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016584	TCGTTG	2	12	1272219	1272230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016584	CAGGCG	2	12	1300349	1300360	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016584	AAAAGT	2	12	1313616	1313627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016584	TTAAAT	2	12	1329501	1329512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016584	CATAAG	2	12	1380065	1380076	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016584	AATATC	2	12	1386908	1386919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016584	GAAATT	2	12	1387051	1387062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016584	GACATA	2	12	1397379	1397390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016584	AGTTTA	2	12	1435067	1435078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016584	AAATTT	2	12	1443437	1443448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016584	AAATTT	2	12	1451930	1451941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016584	ACTGCT	2	12	1466269	1466280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016584	AATGAT	2	12	1515528	1515539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016584	ATCTAA	2	12	1544889	1544900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016584	AGCATA	2	12	1557148	1557159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016584	ATTTAG	2	12	1576813	1576824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016584	AAGCGA	2	12	1591491	1591502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016584	CGCAGG	2	12	1593464	1593475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016584	GGAGCT	2	12	1594095	1594106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016584	CTTTGT	2	12	1694241	1694252	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016584	CATGAT	2	12	1697873	1697884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016584	GAAAAA	2	12	1704147	1704158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016584	GAAGCT	2	12	1713676	1713687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016584	CGAGAG	2	12	1718519	1718530	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016584	ACCAAT	2	12	1759499	1759510	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016584	CTCAAT	2	12	1760052	1760063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016584	TAAAAT	2	12	1776416	1776427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016584	TTATCT	2	12	1780743	1780754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016584	TTTTAA	2	12	1784141	1784152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016584	CAAAAA	2	12	1797812	1797823	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016584	CCATGG	2	12	1819305	1819316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016584	GTAATG	2	12	1846539	1846550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016584	AGAGAT	2	12	1879433	1879444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016584	CGAAAC	2	12	1882023	1882034	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016584	AGATTT	2	12	1911998	1912009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016584	TGTCGT	2	12	1931519	1931530	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016584	GATATA	2	12	1936870	1936881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016584	GATTAA	2	12	1960479	1960490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016584	CTGGTA	2	12	1978725	1978736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016584	TACAAG	2	12	1984580	1984591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016584	AAGCGA	2	12	2012182	2012193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016584	CGCAGG	2	12	2014153	2014164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016584	GGTTCA	2	12	2014459	2014470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016584	TAAATA	2	12	2014963	2014974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016584	ATTTTG	2	12	2015610	2015621	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016584	TAAAAG	2	12	2016273	2016284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016584	AATTGG	2	12	2016285	2016296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016584	AAATAT	2	12	2039215	2039226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016584	AGGAAA	2	12	2047444	2047455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016584	GAAAAA	2	12	2058123	2058134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016584	TGCAGG	2	12	2062849	2062860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016584	AAAGCT	2	12	2069954	2069965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016584	ATAAAG	2	12	2089411	2089422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016584	TAATCA	2	12	2121749	2121760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016584	AATTAG	2	12	2160099	2160110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016584	TTTAAA	2	12	2161641	2161652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016584	TAATGT	2	12	2208095	2208106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016584	AAAGTG	2	12	2217804	2217815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016584	CTTGGC	2	12	2226767	2226778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016584	GATTGT	2	12	2226935	2226946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016584	CAAAGA	2	12	2227956	2227967	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016584	GATGTG	2	12	2269290	2269301	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016584	TTGTTC	2	12	2277628	2277639	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016584	CTAATT	2	12	2282489	2282500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016584	ATATTG	2	12	2295995	2296006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016584	CTGAAT	2	12	2320672	2320683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016584	GAAATA	2	12	2334291	2334302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016584	CAATTT	2	12	2345746	2345757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016584	TTTCGG	2	12	2346916	2346927	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016584	GATATA	2	12	2353624	2353635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016584	ATTAGT	2	12	2357076	2357087	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016584	ATCTTC	2	12	2361055	2361066	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016584	ACAATA	2	12	2365937	2365948	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_016584	AAACAT	2	12	2398396	2398407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_016584	TCTTTT	2	12	2420162	2420173	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_016584	AAAATT	2	12	2420311	2420322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016584	GAGATA	2	12	2433021	2433032	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_016584	TTCTTA	2	12	2495077	2495088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_016584	TAATTA	2	12	2560630	2560641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_016584	TTCGAA	2	12	4894211	4894222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_016584	CAAGGC	2	12	4899953	4899964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_016584	TATTAG	2	12	4902650	4902661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_016584	TGCCGC	2	12	4915436	4915447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
255	NC_016584	CCTTTA	2	12	4931946	4931957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_016584	TCCTTC	2	12	4993548	4993559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
257	NC_016584	ATATTC	2	12	5013498	5013509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_016584	CAGGCG	2	12	5139002	5139013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_016584	ACATGA	2	12	5160740	5160751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_016584	ATTGGC	2	12	5164983	5164994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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264	NC_016584	CATTAT	2	12	5253707	5253718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_016584	CAAAAA	2	12	5263503	5263514	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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285	NC_016584	ATTATA	2	12	5820343	5820354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.