MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfobacca acetoxidans DSM 11109 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015388	GTAATT	2	12	1716	1727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015388	TGAAAA	2	12	2052	2063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015388	AGGGTT	2	12	34518	34529	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015388	GTATCT	2	12	34588	34599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015388	AGATAT	2	12	50168	50179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015388	GACAGC	2	12	63701	63712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015388	ACAGAC	2	12	81561	81572	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015388	TGCTCG	2	12	88003	88014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015388	CGGCCT	2	12	88093	88104	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015388	CTACCT	2	12	93770	93781	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015388	CCGGCT	2	12	107779	107790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015388	AGGTTT	2	12	176170	176181	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015388	TAAATA	2	12	184425	184436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015388	AGAAAA	2	12	189567	189578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015388	GCGTTG	2	12	232325	232336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015388	CGCGGC	2	12	241991	242002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015388	GATTGA	2	12	272759	272770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015388	CGGCAA	2	12	283890	283901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015388	AGGGAC	2	12	287106	287117	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015388	AAATAT	2	12	294134	294145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015388	TGCCGG	2	12	374834	374845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015388	AAGGAG	2	12	417525	417536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015388	TCTTTT	2	12	453410	453421	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015388	TTCCGG	2	12	521113	521124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015388	ACCTCC	2	12	550117	550128	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015388	GAGCCG	2	12	570596	570607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015388	TTGCTG	2	12	570736	570747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015388	CTTTCC	2	12	583716	583727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015388	TAATAT	2	12	583795	583806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015388	ATTTCC	2	12	588650	588661	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015388	TTTGAG	2	12	752511	752522	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015388	TAAAAA	2	12	763174	763185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015388	ATTCCC	2	12	763223	763234	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015388	TGGCCG	2	12	862593	862604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015388	GGCCAC	2	12	862610	862621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015388	TCCGGC	2	12	866673	866684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015388	GAGAAA	2	12	867133	867144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015388	CGAGGC	2	12	895746	895757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015388	TATTGA	2	12	928353	928364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015388	AACTAA	2	12	940590	940601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015388	AGATTG	2	12	943401	943412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015388	GGAAGA	2	12	1005302	1005313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015388	GAAAAA	2	12	1005362	1005373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015388	GCCAAC	2	12	1054006	1054017	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015388	TCAGCC	2	12	1054338	1054349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015388	TATCAA	2	12	1058748	1058759	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015388	GGTAAT	2	12	1064797	1064808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015388	TCGGTG	2	12	1090167	1090178	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015388	GGTGTG	2	12	1107537	1107548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015388	TCAATA	2	12	1135831	1135842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015388	TGGGGA	2	12	1160125	1160136	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015388	TAATCA	2	12	1201718	1201729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015388	ATCCCC	2	12	1240110	1240121	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015388	TTTATC	2	12	1245805	1245816	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015388	GGGCGG	2	12	1248340	1248351	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015388	CAGAGC	2	12	1252944	1252955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015388	GCCTGT	2	12	1272144	1272155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015388	CAGTGG	2	12	1294092	1294103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015388	ATTACT	2	12	1317588	1317599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015388	TATTGA	2	12	1329397	1329408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015388	CAGCCG	2	12	1367876	1367887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015388	ATTGCC	2	12	1445592	1445603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015388	AAATTA	2	12	1511739	1511750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015388	ATAATG	2	12	1512817	1512828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015388	CCCGGC	2	12	1570039	1570050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015388	CCTTTT	2	12	1605031	1605042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015388	CAGGAG	2	12	1684493	1684504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015388	GTTCGG	2	12	1684565	1684576	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015388	ATAAAT	2	12	1780409	1780420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015388	CTGGGA	2	12	1845552	1845563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015388	TGGCCT	2	12	1847884	1847895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015388	CCTCAC	2	12	1848358	1848369	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015388	TGCCCT	2	12	1850473	1850484	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015388	GAGGGC	2	12	1852686	1852697	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015388	AGCACC	2	12	1865030	1865041	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015388	GTTCTA	2	12	1883211	1883222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015388	GCTGTT	2	12	1912643	1912654	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015388	GTAATT	2	12	1937057	1937068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015388	CCGAAG	2	12	1939589	1939600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015388	TAGGGT	2	12	1984298	1984309	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015388	TTGCAG	2	12	2030039	2030050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015388	GTTTTT	2	12	2058595	2058606	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015388	TTTAAA	2	12	2098043	2098054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015388	ACAATA	2	12	2123987	2123998	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015388	TCACCT	2	12	2135781	2135792	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015388	TATTTA	2	12	2136037	2136048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015388	AAAGGG	2	12	2145618	2145629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015388	TTTTTA	2	12	2150943	2150954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015388	CAACCG	2	12	2217744	2217755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015388	CATATA	2	12	2260255	2260266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015388	AAGATA	2	12	2285260	2285271	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015388	TTGAAG	2	12	2333539	2333550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015388	CTCAAG	2	12	2361983	2361994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015388	ATTAAA	2	12	2433106	2433117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015388	TCTCCC	2	12	2439552	2439563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015388	ACTATA	2	12	2447760	2447771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015388	GATTTT	2	12	2457031	2457042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015388	TTAAAT	2	12	2508936	2508947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015388	ATGTTT	2	12	2511511	2511522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015388	GGGGAA	2	12	2513199	2513210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015388	CTGGTT	2	12	2565147	2565158	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015388	GGGCAG	2	12	2569321	2569332	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015388	CGAAAC	2	12	2596058	2596069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015388	GCCTGG	2	12	2634630	2634641	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015388	GGCAAT	2	12	2681357	2681368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015388	GGTAAA	2	12	2722630	2722641	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015388	CCAAGA	2	12	2777205	2777216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015388	TTCCTG	2	12	2864151	2864162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015388	ATTGCC	2	12	2884736	2884747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015388	TAAAAT	2	12	2933106	2933117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015388	TTGAAA	2	12	2958312	2958323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015388	GTAAAC	2	12	2966951	2966962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015388	TTAAAT	2	12	3042520	3042531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015388	AGAGGA	2	12	3048184	3048195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015388	TATAGA	2	12	3067351	3067362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015388	CCAAAA	2	12	3067386	3067397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015388	ATAGAT	2	12	3087116	3087127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015388	CCAAAA	2	12	3087150	3087161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015388	CCTTCG	2	12	3100972	3100983	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015388	AGAAAT	2	12	3119794	3119805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015388	ACTGGA	2	12	3127514	3127525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015388	AGGCAT	2	12	3133866	3133877	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015388	TTAAAT	2	12	3135102	3135113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015388	GTATAT	2	12	3147857	3147868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015388	TATAAA	2	12	3175459	3175470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015388	GGCAAT	2	12	3195670	3195681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015388	AATCCA	2	12	3195975	3195986	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015388	TGTTCC	2	12	3224842	3224853	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015388	CACCGC	2	12	3272595	3272606	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015388	GGGCCA	2	12	3274484	3274495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015388	GTTGGT	2	12	3274518	3274529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.