MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfobacca acetoxidans DSM 11109 chromosome

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015388	TCAGG	2	10	70	79	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015388	ATGCT	2	10	5066	5075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015388	TTATG	2	10	10896	10905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015388	AAAGA	2	10	17002	17011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015388	TATAA	2	10	34612	34621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015388	CATAA	2	10	41804	41813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015388	ATACA	2	10	42106	42115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015388	TTAAC	2	10	44697	44706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015388	ACTTA	2	10	56524	56533	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015388	TTTGG	2	10	73005	73014	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015388	ATTTC	2	10	80795	80804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015388	ATCCC	2	10	81551	81560	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015388	AGTCC	2	10	88294	88303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015388	CATGG	2	10	89180	89189	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015388	CTTGC	2	10	89261	89270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015388	CATGG	2	10	90860	90869	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015388	AGTTA	2	10	94319	94328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015388	CAGGA	2	10	107659	107668	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015388	CGGGA	2	10	118814	118823	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015388	GTCTT	2	10	127313	127322	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015388	TCGTA	2	10	156637	156646	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015388	GGGCA	2	10	157145	157154	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015388	GCTAT	2	10	157175	157184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015388	ATTAA	2	10	166734	166743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015388	AAGCG	2	10	178748	178757	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015388	CCTTT	2	10	179958	179967	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015388	ATGCT	2	10	195214	195223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015388	TCTTA	2	10	195709	195718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015388	CCCTT	2	10	195761	195770	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015388	AATCC	2	10	233684	233693	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015388	TTAAA	2	10	238786	238795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015388	CAGAG	2	10	243369	243378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015388	TTCAA	2	10	248729	248738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015388	TTAAA	2	10	252438	252447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015388	TTTCA	2	10	252995	253004	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015388	GCCCC	2	10	261165	261174	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_015388	GGGGT	2	10	293075	293084	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015388	CCTTC	2	10	315522	315531	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015388	GTCCT	2	10	318077	318086	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015388	CCTTG	2	10	325018	325027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015388	TTCTC	2	10	335808	335817	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015388	TATTT	2	10	338648	338657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015388	TAAGG	2	10	377834	377843	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015388	TCGGC	2	10	386167	386176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015388	ACCAA	2	10	428149	428158	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015388	ATACA	2	10	428307	428316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015388	CGGTT	2	10	433884	433893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015388	AAGGG	2	10	435526	435535	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015388	CTAAC	2	10	438340	438349	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015388	ATAGG	2	10	446829	446838	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015388	ATAGG	2	10	448024	448033	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015388	CAAGA	2	10	450569	450578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015388	TCGGT	2	10	462831	462840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015388	TGGAA	2	10	465573	465582	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015388	TTGCA	2	10	475248	475257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015388	GCGCC	2	10	475991	476000	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_015388	ATTTT	2	10	479209	479218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015388	TGCGC	2	10	485750	485759	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015388	CAAAG	2	10	486509	486518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015388	TTACC	2	10	505549	505558	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015388	ATGAA	2	10	512315	512324	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015388	ATCTT	2	10	515379	515388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015388	TTTAA	2	10	520168	520177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015388	TTTCA	2	10	521070	521079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015388	CCTTG	2	10	531215	531224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015388	CACAC	2	10	531241	531250	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015388	GAATG	2	10	531397	531406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015388	TCCCG	2	10	544623	544632	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_015388	TTTTC	2	10	554166	554175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015388	TTCAA	2	10	554282	554291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015388	ATGGG	2	10	566555	566564	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015388	TGGAT	2	10	576760	576769	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015388	CCCCT	2	10	597839	597848	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_015388	TTCTC	2	10	597879	597888	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015388	CACTG	2	10	602631	602640	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015388	TGTAT	2	10	603260	603269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015388	TTTGG	2	10	615477	615486	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015388	AAGCG	2	10	633558	633567	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015388	TCATG	2	10	636639	636648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015388	ACAAG	2	10	640905	640914	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015388	AAAAG	2	10	667009	667018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015388	TAAGT	2	10	668949	668958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015388	GTCAG	2	10	671821	671830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015388	TGCAT	2	10	671871	671880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015388	CTCTG	2	10	678410	678419	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015388	AGCTT	2	10	695978	695987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015388	GCCTG	2	10	696030	696039	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015388	TCCTT	2	10	716805	716814	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015388	ACAAA	2	10	726575	726584	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015388	TGTTT	2	10	740590	740599	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015388	CTGCC	2	10	743132	743141	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_015388	CCTAT	2	10	749050	749059	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015388	GTTCT	2	10	751192	751201	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015388	TGCGC	2	10	751399	751408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015388	CGATA	2	10	752544	752553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015388	AGCAG	2	10	797792	797801	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015388	TTATC	2	10	801776	801785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015388	AAGCG	2	10	809995	810004	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015388	TAAGG	2	10	813289	813298	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015388	ATTAT	2	10	815140	815149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015388	AGACC	2	10	815693	815702	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015388	AGGAA	2	10	855630	855639	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015388	ACCGC	2	10	856418	856427	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_015388	TTTAC	2	10	883433	883442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015388	AATGT	2	10	884459	884468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015388	TCTTT	2	10	884492	884501	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015388	ATTCT	2	10	899939	899948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015388	ATAGG	2	10	910722	910731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015388	TGGCT	2	10	927877	927886	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015388	ATTTG	2	10	928127	928136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015388	CAGGC	2	10	928617	928626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015388	CTAAC	2	10	942695	942704	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015388	AAGGC	2	10	947269	947278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015388	CCGGA	2	10	949116	949125	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015388	GCCCG	2	10	950505	950514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_015388	CAAAG	2	10	965904	965913	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015388	CTGGT	2	10	985971	985980	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015388	AATTT	2	10	1001937	1001946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015388	ATTTA	2	10	1005411	1005420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015388	CAATT	2	10	1012264	1012273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015388	GAAAA	2	10	1029267	1029276	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015388	TCGGC	2	10	1030443	1030452	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015388	AAGTA	2	10	1048963	1048972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015388	ACGCC	2	10	1054289	1054298	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_015388	TCCCT	2	10	1060983	1060992	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_015388	TAGAT	2	10	1072009	1072018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015388	AAATA	2	10	1072847	1072856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015388	AGGAG	2	10	1103482	1103491	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015388	TCCTT	2	10	1106144	1106153	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015388	GGCCC	2	10	1106857	1106866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_015388	TTTAT	2	10	1107408	1107417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015388	CGCTC	2	10	1107555	1107564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_015388	ATTTC	2	10	1108555	1108564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015388	CGCGG	2	10	1113947	1113956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015388	ATAAA	2	10	1113997	1114006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015388	CCAGG	2	10	1114369	1114378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015388	CCCGA	2	10	1115058	1115067	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015388	TATGG	2	10	1115466	1115475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015388	GCTTT	2	10	1126904	1126913	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015388	CTGCC	2	10	1135949	1135958	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_015388	TATTT	2	10	1145510	1145519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015388	AAAGC	2	10	1155234	1155243	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015388	AATTA	2	10	1163685	1163694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015388	CTTAT	2	10	1174538	1174547	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015388	TATGA	2	10	1175191	1175200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015388	ACTGC	2	10	1175528	1175537	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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263	NC_015388	CTTTT	2	10	2128437	2128446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_015388	AAGGA	2	10	2130998	2131007	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_015388	GCTCT	2	10	2141991	2142000	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_015388	GACCC	2	10	2217994	2218003	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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285	NC_015388	AATAA	2	10	2222588	2222597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015388	TATAA	2	10	2233596	2233605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015388	GATAT	2	10	2248542	2248551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_015388	TTTAG	2	10	2268775	2268784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_015388	TATAT	2	10	3163865	3163874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_015388	TACAG	2	10	3225430	3225439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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407	NC_015388	GGATA	2	10	3231225	3231234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
408	NC_015388	GGTCA	2	10	3242861	3242870	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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410	NC_015388	ATAAA	2	10	3267552	3267561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_015388	AGCCG	2	10	3271049	3271058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
412	NC_015388	AACTG	2	10	3272493	3272502	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
413	NC_015388	CCCTG	2	10	3279916	3279925	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.