MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	TCC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015170	TTC	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015170	CTG	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015170	CGC	2	6	214	219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015170	TGC	2	6	258	263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015170	GCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015170	TGG	2	6	345	350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015170	CCG	2	6	351	356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015170	GCT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015170	GTG	2	6	547	552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015170	GGC	2	6	575	580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015170	TCC	2	6	633	638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015170	GAG	2	6	812	817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015170	CTT	3	9	3164	3172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015170	TTC	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015170	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015170	GGA	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015170	TTG	3	9	5841	5849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015170	CAA	3	9	5879	5887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015170	CCT	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015170	TCC	3	9	7403	7411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015170	CCT	2	6	7414	7419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015170	GCA	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015170	GCA	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015170	GCA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015170	GCA	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015170	GCC	2	6	12438	12443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015170	GCG	2	6	13592	13597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015170	GCT	2	6	13606	13611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015170	CTG	2	6	13675	13680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015170	TCC	2	6	13706	13711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015170	CAG	2	6	14862	14867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015170	GCT	2	6	16140	16145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015170	GAG	2	6	17662	17667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015170	AGT	2	6	17706	17711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015170	AAT	2	6	19487	19492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015170	AGG	2	6	19501	19506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015170	GAA	2	6	20257	20262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015170	GAA	2	6	23249	23254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015170	GCT	2	6	26413	26418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015170	CTG	2	6	26539	26544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015170	AGC	2	6	26593	26598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015170	TGC	2	6	26621	26626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015170	CTC	2	6	28793	28798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015170	TGC	2	6	28863	28868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015170	GCT	2	6	28951	28956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015170	TCA	3	9	31454	31462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015170	GCT	2	6	31489	31494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015170	GCT	2	6	31533	31538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015170	CCG	2	6	31583	31588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015170	CTG	2	6	33003	33008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015170	TGC	2	6	33081	33086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015170	TTC	2	6	34729	34734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015170	AGC	2	6	34796	34801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015170	GCT	2	6	34879	34884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015170	TGC	2	6	34966	34971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015170	TCC	2	6	35002	35007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015170	GTC	2	6	35008	35013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015170	CAG	2	6	35150	35155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015170	GCC	2	6	35222	35227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015170	GCT	2	6	35313	35318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015170	GAG	2	6	35428	35433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015170	CGG	2	6	37239	37244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015170	GCG	2	6	37248	37253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015170	GGC	2	6	37291	37296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015170	CCT	2	6	37299	37304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015170	GGC	2	6	37377	37382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015170	TGC	2	6	37441	37446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015170	ACC	2	6	37643	37648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015170	GAA	2	6	37664	37669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015170	GGC	2	6	37801	37806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015170	GGA	2	6	37840	37845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015170	GCT	2	6	37852	37857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015170	GAG	2	6	37909	37914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015170	TGC	2	6	37926	37931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015170	AGG	2	6	38123	38128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015170	CTA	2	6	38264	38269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015170	GCG	2	6	38294	38299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015170	TGA	2	6	38532	38537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015170	CAC	2	6	38555	38560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015170	TGT	2	6	38636	38641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015170	GAA	2	6	38648	38653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015170	TCG	2	6	38680	38685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015170	CAG	2	6	38879	38884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015170	TGG	2	6	38947	38952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015170	GCC	2	6	38969	38974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015170	GTC	2	6	38998	39003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015170	TGC	2	6	39025	39030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015170	AGG	2	6	39046	39051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015170	GAC	2	6	39092	39097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015170	CTT	2	6	39126	39131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015170	AAG	2	6	39149	39154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015170	AGC	2	6	39183	39188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015170	TGC	2	6	39214	39219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015170	AGC	2	6	39231	39236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015170	CGC	2	6	39241	39246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015170	AGC	2	6	39305	39310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015170	CGC	2	6	39320	39325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015170	CCA	2	6	39336	39341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015170	CGC	2	6	39342	39347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015170	TCG	2	6	39357	39362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015170	CGG	2	6	39454	39459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015170	GCT	2	6	39502	39507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015170	GCT	2	6	39532	39537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015170	ACC	2	6	39576	39581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015170	TGA	2	6	39588	39593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015170	GAA	2	6	39721	39726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015170	ACC	2	6	39759	39764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015170	AAC	3	9	39824	39832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015170	CGC	2	6	39835	39840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015170	CCA	2	6	39877	39882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015170	CGG	2	6	39886	39891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015170	CGG	2	6	39958	39963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015170	GGC	2	6	40216	40221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015170	GCG	2	6	40263	40268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015170	CAA	2	6	40312	40317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015170	AGC	2	6	40388	40393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015170	CAA	2	6	40504	40509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015170	CTG	2	6	41892	41897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015170	GAC	2	6	44328	44333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015170	CCA	2	6	45701	45706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015170	CAG	2	6	45717	45722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015170	GAT	2	6	45737	45742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015170	CTG	2	6	47887	47892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015170	CTG	2	6	47911	47916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015170	GCC	2	6	47931	47936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015170	CAG	2	6	47937	47942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015170	CGG	2	6	49285	49290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015170	CGG	2	6	49313	49318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015170	AGG	2	6	49412	49417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015170	GCC	2	6	51158	51163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015170	CGG	2	6	53349	53354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015170	TTG	2	6	53429	53434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015170	CGC	2	6	53475	53480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015170	CGG	2	6	53588	53593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015170	GTT	2	6	53771	53776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015170	ACA	2	6	53778	53783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015170	ATG	2	6	59991	59996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015170	ACC	2	6	60084	60089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015170	CCG	2	6	62781	62786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.