MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015162	TGGT	2	8	9795	9802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015162	GACG	2	8	10124	10131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015162	GCCT	3	12	10828	10839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015162	GGCG	2	8	10875	10882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015162	CGGG	2	8	11581	11588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015162	CCCG	2	8	11741	11748	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015162	CAGC	2	8	11758	11765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015162	CAGC	2	8	11773	11780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015162	CAGC	2	8	11788	11795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015162	CCCG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015162	GCCA	3	12	12402	12413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015162	CCCG	2	8	12728	12735	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015162	CCCT	2	8	12910	12917	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015162	GGGA	2	8	14942	14949	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015162	CCCT	2	8	17662	17669	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_015162	GGGA	2	8	17675	17682	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015162	CCCG	2	8	19511	19518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015162	GCCC	2	8	19908	19915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_015162	GGCG	2	8	20392	20399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015162	CGCA	2	8	20947	20954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015162	GGAA	2	8	20989	20996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015162	TCCC	2	8	22203	22210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_015162	GCCC	2	8	25768	25775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_015162	GCAA	2	8	26049	26056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015162	TCCC	2	8	30767	30774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_015162	GACA	2	8	31834	31841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015162	TCCC	2	8	32804	32811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015162	CCTC	2	8	33336	33343	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_015162	AACC	2	8	34576	34583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015162	TGTC	2	8	35422	35429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015162	GCGT	2	8	37675	37682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015162	ACCA	2	8	38045	38052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015162	TCCC	2	8	42739	42746	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015162	TCCC	2	8	44022	44029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_015162	CGGG	2	8	48327	48334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015162	TCCC	2	8	53577	53584	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015162	ACCC	2	8	54526	54533	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015162	TCCC	2	8	61633	61640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_015162	GCCC	2	8	62918	62925	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_015162	GGCT	2	8	70028	70035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015162	ATAG	2	8	87851	87858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015162	TTCT	2	8	88832	88839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015162	TACT	2	8	88853	88860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015162	ATTA	2	8	89050	89057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015162	TCCC	2	8	89363	89370	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_015162	TCCC	2	8	90556	90563	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_015162	ACCA	2	8	92538	92545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015162	CGAC	2	8	93982	93989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015162	CTTC	2	8	95025	95032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015162	TGGT	2	8	98699	98706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015162	GAAG	2	8	98771	98778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015162	CAGC	2	8	106323	106330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015162	AACA	2	8	106466	106473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015162	GGCA	2	8	106817	106824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015162	GACT	2	8	107654	107661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015162	GAAG	2	8	108475	108482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015162	GAAC	2	8	109566	109573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015162	TCGT	2	8	117348	117355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015162	AGCC	2	8	117394	117401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015162	AGGC	2	8	117464	117471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015162	GCTC	2	8	118807	118814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015162	CGCA	2	8	121805	121812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015162	GCGT	2	8	124010	124017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015162	ACGC	2	8	124023	124030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015162	CCTC	2	8	124036	124043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015162	GGGC	2	8	124393	124400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015162	AACC	2	8	126000	126007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015162	AACC	2	8	132636	132643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015162	CAAC	2	8	136098	136105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015162	ACCA	2	8	143823	143830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015162	CGCC	2	8	148015	148022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_015162	GCCC	2	8	148024	148031	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_015162	AACC	2	8	149694	149701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015162	AACC	2	8	150980	150987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015162	GATT	2	8	153516	153523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015162	ACCA	2	8	154016	154023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015162	ACCA	2	8	155390	155397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015162	GCTG	2	8	156364	156371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015162	CCGA	2	8	162420	162427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015162	CGCC	2	8	165832	165839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_015162	GCGT	2	8	165853	165860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015162	GGAA	2	8	166551	166558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015162	AAAG	2	8	168580	168587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015162	AACC	2	8	172202	172209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015162	TGGT	2	8	177037	177044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015162	ACCA	2	8	177086	177093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015162	CAGG	2	8	177565	177572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015162	GGGA	2	8	177573	177580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015162	ACCA	2	8	186489	186496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015162	AACC	2	8	191339	191346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015162	GACG	2	8	195779	195786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.