MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015161	AG	3	6	1796	1801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015161	AG	3	6	2115	2120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015161	AG	3	6	2122	2127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015161	AG	3	6	2173	2178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015161	AC	3	6	2221	2226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015161	GT	3	6	4881	4886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015161	CA	3	6	5034	5039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015161	CT	3	6	11329	11334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015161	TC	4	8	23905	23912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015161	GA	3	6	25455	25460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015161	AC	3	6	26871	26876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015161	AC	3	6	27040	27045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015161	AG	3	6	28785	28790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015161	AG	3	6	42759	42764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015161	AG	3	6	43667	43672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015161	CG	3	6	44115	44120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015161	CG	3	6	44753	44758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015161	GA	3	6	45280	45285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015161	TC	3	6	45368	45373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015161	GA	3	6	45844	45849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015161	TA	3	6	48526	48531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015161	CT	3	6	49459	49464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015161	CT	3	6	49789	49794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015161	GC	3	6	53013	53018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015161	GC	3	6	56368	56373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015161	GC	3	6	59068	59073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015161	TC	3	6	60834	60839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015161	CA	3	6	61799	61804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015161	TG	3	6	62396	62401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015161	CA	3	6	62425	62430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015161	AG	3	6	81999	82004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015161	CT	3	6	88160	88165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015161	GA	3	6	95968	95973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015161	CG	3	6	96237	96242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015161	GC	3	6	97471	97476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015161	GA	3	6	97477	97482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015161	TC	3	6	103355	103360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015161	CT	3	6	106041	106046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015161	TG	3	6	106684	106689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015161	AG	3	6	110754	110759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015161	GC	3	6	114294	114299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015161	GC	3	6	124457	124462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015161	GA	3	6	128758	128763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015161	CT	3	6	140158	140163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015161	CG	3	6	151024	151029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015161	AG	3	6	153395	153400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015161	GT	3	6	159836	159841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015161	GA	3	6	167340	167345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015161	TG	3	6	171015	171020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015161	GA	3	6	171314	171319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015161	CG	3	6	171583	171588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015161	GC	3	6	172817	172822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015161	GA	3	6	172823	172828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015161	CA	3	6	180778	180783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015161	AT	3	6	181335	181340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015161	CT	3	6	182881	182886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015161	CT	4	8	188497	188504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015161	AG	3	6	193147	193152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015161	GA	3	6	202263	202268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015161	CT	4	8	205165	205172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015161	CA	3	6	226026	226031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015161	GC	3	6	231807	231812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015161	CT	3	6	231856	231861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015161	AC	3	6	248023	248028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015161	TC	3	6	252830	252835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015161	CG	3	6	266552	266557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015161	CT	3	6	275860	275865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015161	GC	3	6	279107	279112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015161	CT	3	6	288497	288502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015161	GT	3	6	299297	299302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015161	CT	3	6	309587	309592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015161	GA	3	6	309646	309651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015161	GC	3	6	330636	330641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015161	CT	3	6	342667	342672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015161	AG	4	8	342923	342930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015161	GT	4	8	343637	343644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015161	AG	4	8	353073	353080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015161	CG	3	6	354492	354497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015161	GA	3	6	355019	355024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015161	CA	4	8	355241	355248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015161	CA	3	6	355803	355808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015161	CT	4	8	355956	355963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015161	AT	3	6	365319	365324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015161	CT	3	6	389978	389983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015161	CT	3	6	398529	398534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015161	GA	3	6	398672	398677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015161	GT	3	6	399576	399581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015161	CG	3	6	403788	403793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015161	GA	3	6	404361	404366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015161	CG	3	6	411570	411575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015161	CA	3	6	411627	411632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015161	TG	4	8	416807	416814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015161	GA	3	6	424660	424665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015161	CG	3	6	431247	431252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015161	TG	3	6	439967	439972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015161	TG	3	6	442306	442311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015161	CT	3	6	460587	460592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015161	TC	3	6	463254	463259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015161	GA	3	6	465412	465417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015161	GA	3	6	465471	465476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015161	GT	3	6	465839	465844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015161	TC	3	6	467865	467870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015161	GT	3	6	486967	486972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015161	GC	3	6	509170	509175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015161	CG	3	6	510432	510437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015161	GA	3	6	510959	510964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015161	CT	3	6	513753	513758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015161	CT	3	6	525164	525169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015161	AG	4	8	529989	529996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015161	AC	3	6	531755	531760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015161	GA	3	6	532074	532079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015161	AG	3	6	532547	532552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015161	AG	4	8	532777	532784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015161	CT	4	8	532805	532812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015161	CA	3	6	533983	533988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015161	AT	4	8	534337	534344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015161	GT	3	6	537718	537723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015161	GT	3	6	538127	538132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015161	GA	3	6	538212	538217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015161	TA	3	6	546370	546375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015161	AC	3	6	547772	547777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015161	AC	3	6	547941	547946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015161	TG	3	6	548299	548304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015161	TG	3	6	548609	548614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015161	CA	3	6	553817	553822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015161	GA	3	6	561434	561439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015161	GA	3	6	564144	564149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015161	TG	3	6	593243	593248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015161	GC	3	6	622173	622178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015161	TG	3	6	637741	637746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015161	CG	3	6	644644	644649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015161	AG	3	6	649998	650003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015161	GC	3	6	655373	655378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015161	GC	3	6	660479	660484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015161	GA	3	6	662354	662359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015161	TG	3	6	662488	662493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015161	GA	3	6	667175	667180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015161	GC	4	8	669557	669564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015161	GA	3	6	672132	672137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015161	GA	3	6	672144	672149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015161	AG	3	6	675074	675079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015161	AG	3	6	688981	688986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015161	CA	3	6	697105	697110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015161	GA	3	6	697203	697208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015161	TC	3	6	697240	697245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015161	GC	3	6	697267	697272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015161	CA	3	6	716698	716703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015161	TG	4	8	716891	716898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015161	GT	3	6	718588	718593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015161	CT	3	6	724716	724721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015161	AC	3	6	731760	731765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015161	TG	3	6	732890	732895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015161	TG	3	6	738683	738688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015161	GA	5	10	746056	746065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.