MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 5662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015161	TCG	2	6	530185	530190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_015161	TCA	2	6	531385	531390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015161	GAC	2	6	531391	531396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_015161	TCC	2	6	531516	531521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_015161	CGT	2	6	531564	531569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_015161	AC	3	6	531755	531760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_015161	GACT	2	8	531790	531797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_015161	CGT	2	6	531815	531820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015161	CCT	2	6	531898	531903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_015161	CTT	2	6	531908	531913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015161	CGA	2	6	531919	531924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015161	CAG	2	6	531974	531979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_015161	GA	3	6	532074	532079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015161	TAC	2	6	532090	532095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015161	TGC	2	6	532129	532134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_015161	TCA	2	6	532239	532244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015161	TGG	2	6	532366	532371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015161	ATG	2	6	532393	532398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015161	TAT	2	6	532459	532464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015161	TTC	2	6	532483	532488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015161	AG	3	6	532547	532552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015161	ACT	2	6	532585	532590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015161	AATC	2	8	532597	532604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_015161	AGGC	2	8	532651	532658	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_015161	GAA	2	6	532767	532772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015161	AG	4	8	532777	532784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015161	CT	4	8	532805	532812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_015161	CA	3	6	533983	533988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_015161	AAC	2	6	534068	534073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_015161	CTT	2	6	534093	534098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_015161	ATA	2	6	534103	534108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015161	TTG	2	6	534121	534126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015161	AGT	2	6	534198	534203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015161	ATA	2	6	534274	534279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015161	TGA	2	6	534290	534295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015161	GTT	2	6	534297	534302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015161	AGG	2	6	534309	534314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015161	AT	4	8	534337	534344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015161	GAA	2	6	534426	534431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015161	TAA	2	6	534445	534450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015161	TTAGC	2	10	534452	534461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_015161	GTA	2	6	537584	537589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015161	TGG	2	6	537646	537651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015161	TGC	2	6	537699	537704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_015161	GCCG	2	8	537705	537712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_015161	GT	3	6	537718	537723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015161	A	6	6	537781	537786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015161	GT	3	6	538127	538132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015161	GTGC	2	8	538177	538184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_015161	GA	3	6	538212	538217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015161	CCT	2	6	538258	538263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_015161	C	6	6	538287	538292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1553	NC_015161	TCC	2	6	539386	539391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_015161	GACG	2	8	539402	539409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_015161	GCCTGC	2	12	539445	539456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_015161	ACA	2	6	539460	539465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_015161	CCT	2	6	539466	539471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_015161	CTGT	2	8	539524	539531	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_015161	GCA	2	6	539618	539623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_015161	ACG	2	6	539624	539629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015161	GCG	2	6	539663	539668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_015161	T	6	6	539682	539687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015161	C	6	6	539691	539696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1564	NC_015161	GCG	2	6	542851	542856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_015161	GCC	2	6	542875	542880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_015161	TGA	2	6	542940	542945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015161	GGA	2	6	544103	544108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015161	TTTCTG	2	12	544295	544306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1569	NC_015161	ACT	2	6	544404	544409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015161	CCTG	2	8	546263	546270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_015161	GCA	2	6	546291	546296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015161	GCC	2	6	546317	546322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_015161	GGC	2	6	546337	546342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_015161	CCT	2	6	546355	546360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_015161	TA	3	6	546370	546375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015161	GTG	2	6	546449	546454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015161	GGC	2	6	546620	546625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015161	TGAC	2	8	546689	546696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_015161	CGA	2	6	546840	546845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015161	GGCC	2	8	546868	546875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_015161	GCA	2	6	546914	546919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_015161	CGC	2	6	546961	546966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_015161	CAG	2	6	547069	547074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_015161	GGC	2	6	547134	547139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_015161	GAA	2	6	547520	547525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015161	AGC	2	6	547562	547567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015161	TGC	2	6	547598	547603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_015161	GTC	2	6	547610	547615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_015161	TCGTG	2	10	547619	547628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_015161	TTGG	2	8	547684	547691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015161	AGG	2	6	547720	547725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015161	AC	3	6	547772	547777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_015161	AC	3	6	547941	547946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_015161	AGGC	2	8	547998	548005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_015161	AGGT	2	8	548045	548052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015161	CCT	2	6	548077	548082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_015161	T	6	6	548157	548162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015161	TGC	2	6	548218	548223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_015161	TG	3	6	548299	548304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015161	TGACC	2	10	548327	548336	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1601	NC_015161	CAGAA	2	10	548533	548542	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_015161	CTG	2	6	548570	548575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_015161	TG	3	6	548609	548614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015161	GCC	2	6	548784	548789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_015161	CAG	2	6	548793	548798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_015161	AGC	2	6	548860	548865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_015161	GCC	2	6	548891	548896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_015161	CACC	2	8	549946	549953	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1609	NC_015161	TGG	2	6	549966	549971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015161	GCT	2	6	549977	549982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_015161	TAC	2	6	549997	550002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015161	TGGG	2	8	550024	550031	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015161	GCT	2	6	551086	551091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_015161	TCA	2	6	553284	553289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_015161	CCTGA	2	10	553352	553361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_015161	GAA	2	6	553460	553465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015161	CTGC	2	8	553511	553518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_015161	GCCATA	2	12	553639	553650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015161	GGC	2	6	553654	553659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015161	GTG	2	6	553706	553711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015161	TCC	2	6	553788	553793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_015161	CA	3	6	553817	553822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_015161	AGC	2	6	553857	553862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_015161	A	7	7	553863	553869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015161	GCCC	2	8	553870	553877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1626	NC_015161	AGGC	2	8	553883	553890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_015161	GCGCC	2	10	554250	554259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1628	NC_015161	CGC	3	9	554279	554287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_015161	GCC	2	6	554295	554300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_015161	T	6	6	554357	554362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015161	GGC	2	6	554363	554368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_015161	CGT	2	6	554390	554395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_015161	CCGG	2	8	554440	554447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_015161	GGT	2	6	554449	554454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015161	CCTG	2	8	554482	554489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1645	NC_015161	GA	3	6	564144	564149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1906	NC_015161	TG	3	6	662488	662493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1907	NC_015161	CTG	2	6	663397	663402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_015161	CCG	2	6	663409	663414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1909	NC_015161	GGCCG	2	10	663446	663455	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1911	NC_015161	GCC	2	6	665179	665184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1912	NC_015161	GGAAG	2	10	665218	665227	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1915	NC_015161	TGG	2	6	668307	668312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1924	NC_015161	GCC	2	6	671618	671623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1934	NC_015161	GA	3	6	672144	672149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1937	NC_015161	CTT	2	6	675094	675099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1940	NC_015161	TTC	2	6	678819	678824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1943	NC_015161	CGG	2	6	678961	678966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_015161	GCG	2	6	678974	678979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1945	NC_015161	CAG	3	9	678980	678988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1947	NC_015161	GGC	2	6	679095	679100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1949	NC_015161	GGC	2	6	679986	679991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1988	NC_015161	TC	3	6	697240	697245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1989	NC_015161	GC	3	6	697267	697272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1990	NC_015161	CTG	2	6	697285	697290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1992	NC_015161	GCT	3	9	699510	699518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1994	NC_015161	TTTG	2	8	699572	699579	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1995	NC_015161	TATC	2	8	699631	699638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1996	NC_015161	GCG	2	6	700588	700593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_015161	CCTG	2	8	703028	703035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1998	NC_015161	CCAG	2	8	704255	704262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1999	NC_015161	AAG	2	6	704283	704288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_015161	ACT	2	6	710329	710334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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