MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus maricopensis DSM 21211 chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014958	TTACTA	2	12	1854	1865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014958	AAAGAG	2	12	1883	1894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014958	CCTGTG	2	12	5995	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014958	GGTGGG	2	12	66084	66095	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014958	GCTATG	2	12	75557	75568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014958	CGTGGC	2	12	93456	93467	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014958	GCGGGC	2	12	97585	97596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014958	CTGCGC	2	12	139821	139832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014958	CGTTTC	2	12	162415	162426	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014958	CCCACG	2	12	162647	162658	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014958	AGGGGG	2	12	215009	215020	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014958	GCAACC	2	12	222328	222339	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014958	TGGGTG	2	12	227756	227767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014958	TGGCGG	2	12	260064	260075	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014958	TGGAGG	2	12	260187	260198	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014958	CGGTGG	2	12	260292	260303	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014958	GGGGGT	2	12	285127	285138	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014958	GGTGGG	2	12	299153	299164	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014958	ACCCGG	2	12	310918	310929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014958	GTGCGG	2	12	320278	320289	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014958	CCAGCC	2	12	331041	331052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014958	TCTGGG	2	12	349717	349728	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014958	CGGGCG	2	12	370641	370652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014958	GACAGC	2	12	455511	455522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014958	CACCCT	2	12	499292	499303	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014958	CGCCTC	2	12	516413	516424	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014958	CAAGCG	2	12	522398	522409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014958	GCTATG	2	12	525714	525725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014958	GTGAAC	2	12	537232	537243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014958	TCGGTG	2	12	590021	590032	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014958	CGCCCT	2	12	598136	598147	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014958	TGCGCA	2	12	613530	613541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014958	GCTATG	2	12	640350	640361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014958	TGCTCC	2	12	657336	657347	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014958	GACCGT	2	12	697116	697127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014958	GCTCGC	2	12	697170	697181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014958	ACGCCC	2	12	703584	703595	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014958	GCGTGC	2	12	759604	759615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014958	CAGGAC	2	12	771425	771436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014958	CCACCC	2	12	779213	779224	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_014958	TCAAAT	2	12	780361	780372	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014958	CACGCC	2	12	781500	781511	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014958	GTAGCG	2	12	781572	781583	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014958	GGCCGG	2	12	790819	790830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014958	CAAGCG	2	12	812396	812407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014958	CCCGCC	2	12	813989	814000	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_014958	CGTCCC	2	12	849997	850008	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014958	CCCCGC	2	12	851226	851237	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
49	NC_014958	TTTATG	2	12	855813	855824	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014958	GGGTGG	2	12	857999	858010	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014958	CGCGCC	2	12	865602	865613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014958	GCCCCG	2	12	878555	878566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014958	CGGCAA	2	12	894132	894143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014958	CGCGCA	2	12	899967	899978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014958	CAATAG	2	12	930380	930391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014958	AACAGC	2	12	944905	944916	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014958	ACCACG	2	12	1035096	1035107	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014958	GCACGC	2	12	1070172	1070183	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014958	GCCCCC	2	12	1152179	1152190	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_014958	CACGCC	2	12	1188665	1188676	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014958	ACGGTG	2	12	1242660	1242671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014958	GCTATG	2	12	1279717	1279728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014958	CGCCCG	2	12	1316962	1316973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014958	AGCGTC	2	12	1330379	1330390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014958	CGCAGG	2	12	1330686	1330697	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014958	GCACGC	2	12	1350071	1350082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014958	CGGCAA	2	12	1432500	1432511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014958	GTACCT	2	12	1432695	1432706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014958	ATGAAT	2	12	1444855	1444866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014958	CGCGGG	2	12	1505006	1505017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014958	CCGCCA	2	12	1507838	1507849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014958	CCACCC	2	12	1518709	1518720	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_014958	GGCGCC	2	12	1537342	1537353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014958	GCCGAC	2	12	1569854	1569865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014958	GCCAAT	2	12	1607713	1607724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014958	CGTTCA	2	12	1632059	1632070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014958	CCCTCA	2	12	1684930	1684941	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014958	AGTTGT	2	12	1753809	1753820	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014958	AGCCGG	2	12	1790853	1790864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014958	GCCACC	2	12	1813655	1813666	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014958	GGCGCG	2	12	1818610	1818621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014958	TGACGC	2	12	1837022	1837033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014958	CATGAA	2	12	1837792	1837803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014958	GGTGGG	2	12	1854592	1854603	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014958	CCCACC	2	12	1868034	1868045	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_014958	CACGCG	2	12	1879134	1879145	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014958	TGTTTT	2	12	1895940	1895951	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014958	GGCCGA	2	12	1935858	1935869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014958	GTCCCC	2	12	1948343	1948354	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014958	CGCTCC	2	12	1968793	1968804	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014958	GCCGTG	2	12	2032646	2032657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014958	TGCGTG	2	12	2057980	2057991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014958	GCGTGG	2	12	2114601	2114612	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014958	CAGGCG	2	12	2139184	2139195	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014958	TGAAGA	2	12	2187992	2188003	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014958	GAAGCG	2	12	2195597	2195608	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014958	GCCCGC	2	12	2307080	2307091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014958	CTCGTC	2	12	2309968	2309979	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014958	CGCGTG	2	12	2443559	2443570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014958	ACGCCC	2	12	2449188	2449199	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014958	GCCCAC	2	12	2449256	2449267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014958	CCCGCC	2	12	2449479	2449490	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_014958	ACGCCT	2	12	2477484	2477495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014958	AGCGTC	2	12	2490489	2490500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014958	AGACGC	2	12	2490661	2490672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014958	GGCGCG	2	12	2497333	2497344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014958	CAGACA	2	12	2504306	2504317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014958	CGCGGG	2	12	2513717	2513728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014958	CGACCC	2	12	2622399	2622410	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014958	CCACCC	2	12	2769730	2769741	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
111	NC_014958	GCACCG	2	12	2770317	2770328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014958	GGCGTA	2	12	2861601	2861612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014958	CTGAAC	2	12	2883174	2883185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014958	GCGTTC	2	12	2883351	2883362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014958	TGGCGG	2	12	2980776	2980787	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014958	CGCCAC	2	12	2980819	2980830	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014958	GCGTGT	2	12	2991570	2991581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014958	CGCTCG	2	12	2993648	2993659	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014958	AGCGTC	2	12	2994432	2994443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014958	GGTGGG	2	12	2997563	2997574	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014958	CACCTC	2	12	2997802	2997813	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014958	GCCCCT	2	12	3027468	3027479	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014958	TGCGCG	2	12	3072329	3072340	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014958	AGCGTC	2	12	3078339	3078350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014958	CATGGC	2	12	3158156	3158167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014958	GCTGCC	2	12	3177923	3177934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014958	GGCGGG	2	12	3178078	3178089	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014958	CGCTTG	2	12	3179671	3179682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014958	CGTCGC	3	18	3184464	3184481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014958	GACGGC	2	12	3184500	3184511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014958	GACCAC	2	12	3242199	3242210	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014958	GGGCAC	2	12	3244293	3244304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014958	GGGTGT	2	12	3269129	3269140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014958	GCCCCT	2	12	3282970	3282981	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014958	GGCGGG	2	12	3284619	3284630	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014958	CGCTTG	2	12	3286212	3286223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014958	CACCCG	2	12	3292321	3292332	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014958	CGCACG	2	12	3293697	3293708	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014958	CGGGGG	2	12	3297695	3297706	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014958	CAACTT	2	12	3379119	3379130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014958	TCGGCG	2	12	3393812	3393823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014958	TCCGCG	2	12	3398974	3398985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014958	CGCGGG	2	12	3401597	3401608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014958	CACGCA	2	12	3441243	3441254	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014958	GGGGGT	2	12	3449705	3449716	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014958	GTGGGG	2	12	3469834	3469845	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014958	AAACGC	2	12	3483145	3483156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.