MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio aespoeensis Aspo-2 chromosome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014844	GGCCAT	2	12	8638	8649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014844	GAAAAT	2	12	19408	19419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014844	TCATGA	2	12	20823	20834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014844	GGGCCA	2	12	121540	121551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014844	TGGGGA	2	12	163688	163699	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014844	GGTTGG	2	12	163992	164003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014844	CCTCCC	2	12	168057	168068	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
8	NC_014844	ACAGTG	2	12	190164	190175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014844	CTCAAT	2	12	203752	203763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014844	GGGCCG	2	12	221260	221271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014844	GCCCTG	2	12	236403	236414	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014844	TGCGCC	2	12	241589	241600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014844	TGGGCG	2	12	316222	316233	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014844	TGGGTG	2	12	316234	316245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014844	TGCGCC	2	12	317343	317354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014844	GACACC	2	12	317809	317820	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014844	CTCGCA	2	12	370825	370836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014844	AACAGG	2	12	399896	399907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014844	CCGGGG	2	12	417812	417823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014844	TCGATT	2	12	464305	464316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014844	AGCCAT	2	12	472710	472721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014844	CAATAT	2	12	523236	523247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014844	ATGCAT	2	12	547523	547534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014844	GCGCGG	2	12	565574	565585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014844	GGGCTG	2	12	571652	571663	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014844	CTCCGG	2	12	598269	598280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014844	TGGGTG	2	12	598774	598785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014844	AGTTGG	2	12	629105	629116	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014844	CTTTTT	2	12	629725	629736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014844	CAGAGA	2	12	654197	654208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014844	TGCCCC	2	12	654648	654659	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014844	CTCCAC	2	12	669625	669636	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014844	AAATCG	2	12	670105	670116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014844	GGAAAC	2	12	677632	677643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014844	TTCCCA	2	12	694359	694370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014844	GTTGCG	2	12	714358	714369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014844	TGGGTG	2	12	736678	736689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014844	CAAGGC	2	12	842786	842797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014844	CTCTTC	2	12	845991	846002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014844	TGGTTG	2	12	926517	926528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014844	GAAAAG	2	12	947123	947134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014844	CTCCCA	2	12	1050375	1050386	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014844	TGGCAT	2	12	1096970	1096981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014844	CTATTT	2	12	1106250	1106261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014844	GGACAA	2	12	1113214	1113225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014844	GTCGGG	2	12	1145149	1145160	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014844	AATCAA	2	12	1152097	1152108	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014844	GGGCCG	2	12	1176569	1176580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014844	TTGCGC	2	12	1288957	1288968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014844	CTGGAG	2	12	1369968	1369979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014844	CTCCGC	2	12	1387565	1387576	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014844	GGCGCG	2	12	1453958	1453969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014844	TGCTTG	2	12	1516888	1516899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014844	TGTGGC	2	12	1524847	1524858	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014844	TGGGTT	2	12	1595144	1595155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014844	GAGCGG	2	12	1627103	1627114	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014844	GGGCCT	2	12	1663009	1663020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014844	TGGACA	2	12	1732339	1732350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014844	ACACGG	2	12	1750994	1751005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014844	GACTAC	2	12	1756002	1756013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014844	CCGGTT	2	12	1776999	1777010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014844	TCGGCT	2	12	1818815	1818826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014844	GCAATG	2	12	1846561	1846572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014844	AATCCC	2	12	1862990	1863001	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014844	CAGCCC	2	12	1881007	1881018	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014844	CTGGTC	2	12	1889679	1889690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014844	ACATCA	2	12	1938544	1938555	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014844	AGGAAA	2	12	1944989	1945000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014844	CTGTAC	2	12	1949837	1949848	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014844	AGACCG	2	12	1969403	1969414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014844	CATATT	2	12	1990408	1990419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014844	CGATTT	2	12	2039752	2039763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014844	CGACAA	2	12	2044105	2044116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014844	CTTCTG	2	12	2084327	2084338	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014844	TTGTTT	2	12	2090805	2090816	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014844	ACCCTT	2	12	2091021	2091032	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014844	TTCATT	2	12	2105246	2105257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014844	TGAATA	2	12	2117018	2117029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014844	GCCCGC	2	12	2142971	2142982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014844	GCTTAG	2	12	2146391	2146402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014844	GCCCCT	2	12	2159212	2159223	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014844	CCCGGC	2	12	2227967	2227978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014844	TTTCTT	2	12	2238151	2238162	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014844	GGACAC	2	12	2247711	2247722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014844	GGAAAC	2	12	2257268	2257279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014844	GAAAAG	2	12	2263961	2263972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014844	CCAGCC	2	12	2317264	2317275	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014844	TCGCTC	2	12	2322784	2322795	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014844	GACCAT	2	12	2354820	2354831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014844	CCGGGG	2	12	2376338	2376349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014844	AGGCGC	2	12	2382607	2382618	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014844	CTCCCC	2	12	2385183	2385194	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
93	NC_014844	CCTCTT	2	12	2394792	2394803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014844	GCAAAC	2	12	2408510	2408521	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014844	CGCCCG	2	12	2459340	2459351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014844	CCCCTT	2	12	2488090	2488101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014844	GCCAAG	2	12	2536776	2536787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014844	GGACTA	2	12	2593873	2593884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014844	ACCACT	2	12	2632275	2632286	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014844	CCTAAG	2	12	2647910	2647921	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014844	TCCGAT	2	12	2701905	2701916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014844	AGGAAG	2	12	2764587	2764598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014844	CACCTA	2	12	2775965	2775976	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014844	CAACCG	2	12	2779131	2779142	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014844	CAAGAA	2	12	2779366	2779377	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014844	CCCGGC	2	12	2782977	2782988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014844	ACAATC	2	12	2809350	2809361	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014844	TGCGGG	2	12	2829147	2829158	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014844	CGTGGC	2	12	2865499	2865510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014844	TACAGA	2	12	2871844	2871855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014844	CCGCAG	2	12	2913534	2913545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014844	GCAAGG	2	12	2913619	2913630	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014844	TCCGGC	2	12	2929251	2929262	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014844	GGGATG	2	12	2955854	2955865	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014844	TATTCA	2	12	3050226	3050237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014844	TTCCCC	2	12	3053319	3053330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014844	ATGCAA	2	12	3062366	3062377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014844	CGGTCG	2	12	3086763	3086774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014844	ACGGCG	2	12	3144597	3144608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014844	CCTAAG	2	12	3168929	3168940	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014844	TGCCGC	2	12	3202552	3202563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014844	TTTCAA	2	12	3206937	3206948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014844	CCCTTG	2	12	3210313	3210324	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014844	CTCGGA	2	12	3210464	3210475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014844	CGGCAG	2	12	3231695	3231706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014844	GTCGCT	2	12	3231806	3231817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014844	TTCCTC	2	12	3233697	3233708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014844	TTTCAG	2	12	3237335	3237346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014844	TGTGCG	2	12	3267512	3267523	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014844	AAAGGC	2	12	3307279	3307290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014844	CGTATA	2	12	3316676	3316687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014844	GAAGCT	2	12	3326248	3326259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014844	GTCGCT	2	12	3347209	3347220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014844	TGCGCC	2	12	3364566	3364577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014844	GTCGCT	2	12	3379150	3379161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014844	GGTATG	2	12	3437850	3437861	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014844	CCAACC	2	12	3453461	3453472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014844	CTTCCT	2	12	3453753	3453764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014844	CCACAG	2	12	3467618	3467629	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014844	CGGCCC	2	12	3467732	3467743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_014844	ACCCCA	3	18	3471057	3471074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_014844	GCGACG	2	12	3483364	3483375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014844	CCTAAG	2	12	3484998	3485009	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014844	CTTTTT	2	12	3542554	3542565	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014844	TCTCCC	2	12	3586576	3586587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_014844	AAATAA	2	12	3606918	3606929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.