MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014836	TCCG	2	8	8200	8207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014836	GCTG	2	8	8320	8327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014836	GCGG	2	8	9307	9314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014836	GGCT	2	8	16393	16400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014836	CCAT	2	8	16442	16449	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014836	CAGT	2	8	26838	26845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014836	TGCT	2	8	29537	29544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014836	GATA	2	8	39320	39327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014836	CTGG	2	8	39371	39378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014836	TTAA	2	8	41041	41048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014836	AGGG	2	8	41583	41590	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014836	AATT	2	8	45914	45921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014836	CGCA	2	8	46002	46009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014836	ATAA	2	8	46099	46106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014836	CTAA	2	8	46292	46299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014836	GTGA	2	8	47142	47149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014836	GAGC	2	8	53347	53354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014836	GCAA	2	8	98309	98316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014836	CCGG	2	8	98323	98330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014836	TGTA	2	8	108313	108320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014836	AGGG	2	8	117288	117295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014836	GCCT	2	8	120695	120702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014836	TTCT	2	8	120850	120857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014836	TTCT	2	8	121770	121777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014836	TACA	2	8	129146	129153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014836	TCAT	2	8	148627	148634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014836	AATG	2	8	153663	153670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014836	GAGT	2	8	160338	160345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014836	GATG	2	8	163869	163876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014836	GTTT	2	8	165701	165708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014836	AAAG	2	8	165938	165945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014836	GTCA	2	8	166177	166184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014836	GAAC	2	8	167530	167537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014836	AGCC	2	8	167622	167629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014836	CAGT	2	8	167843	167850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014836	CTGA	2	8	169739	169746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014836	CTGG	2	8	170175	170182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014836	CTGG	2	8	170250	170257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014836	AGTG	2	8	170285	170292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014836	GAGC	2	8	176797	176804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014836	GCCA	2	8	177005	177012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014836	CAGG	2	8	178675	178682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014836	AAAG	2	8	179785	179792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014836	CGCT	2	8	179823	179830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014836	CAGT	2	8	181288	181295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014836	ATTA	2	8	203458	203465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014836	GAAC	2	8	220019	220026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014836	CAGG	2	8	229411	229418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014836	TCTT	2	8	244590	244597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014836	CCAT	2	8	247265	247272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014836	GTTT	2	8	264605	264612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014836	TGAT	2	8	264636	264643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014836	TGGG	2	8	267853	267860	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014836	CAGG	2	8	268417	268424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014836	GGTT	2	8	272081	272088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014836	GCTC	2	8	275264	275271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014836	CACT	2	8	275543	275550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014836	GCCA	2	8	275577	275584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014836	CCAG	2	8	275652	275659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014836	GCCA	2	8	279105	279112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014836	TTTC	2	8	285077	285084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014836	GAAA	2	8	286796	286803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014836	GCCA	2	8	297977	297984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014836	CCAG	2	8	298053	298060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014836	CACC	2	8	299055	299062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_014836	AGGA	2	8	299207	299214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014836	CTCA	2	8	300649	300656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014836	AACG	2	8	302758	302765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014836	AGCC	2	8	302834	302841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014836	CCTG	2	8	303663	303670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014836	TGAG	2	8	314131	314138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014836	TGCC	2	8	317357	317364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014836	GCTT	2	8	318802	318809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014836	GCAG	2	8	335151	335158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014836	GAAA	2	8	335198	335205	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014836	GCTC	2	8	346085	346092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014836	CACT	2	8	346430	346437	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014836	GCCA	2	8	346464	346471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014836	CCAG	2	8	346539	346546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014836	CTTG	2	8	346644	346651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014836	AGCA	2	8	350153	350160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014836	GCCA	2	8	362728	362735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014836	GCTC	2	8	365284	365291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014836	CTTT	2	8	365411	365418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014836	GGTT	2	8	372832	372839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014836	GAAC	2	8	377978	377985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014836	GGCA	2	8	380461	380468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014836	ATCT	2	8	403868	403875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014836	TGAT	2	8	407231	407238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014836	GGGT	3	12	407252	407263	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014836	TTTC	2	8	407282	407289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014836	AAAG	2	8	410706	410713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014836	GAAA	2	8	416296	416303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014836	TCTT	2	8	418565	418572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014836	TGCA	2	8	419533	419540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014836	GCAT	2	8	420077	420084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014836	CTTT	2	8	420630	420637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014836	CTCA	2	8	420766	420773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014836	GCAG	2	8	420999	421006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014836	CAGG	2	8	421135	421142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014836	CAGG	2	8	421710	421717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014836	GGTG	2	8	428673	428680	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014836	CTTT	2	8	430648	430655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014836	TGAG	2	8	430663	430670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014836	CACT	2	8	440619	440626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014836	GCCA	2	8	440652	440659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014836	CCAG	2	8	440727	440734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014836	GAGC	2	8	454608	454615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014836	GTCC	2	8	483689	483696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014836	GCAG	2	8	493006	493013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014836	TGCC	2	8	497221	497228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014836	GGGA	2	8	502287	502294	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014836	GCAG	2	8	505029	505036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014836	ATAA	2	8	511603	511610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014836	TTTG	2	8	511621	511628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014836	AATG	2	8	512652	512659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014836	TCAA	2	8	515288	515295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014836	GCTC	2	8	517270	517277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014836	GCTC	2	8	524801	524808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014836	CTGG	2	8	525172	525179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014836	CTGG	2	8	525246	525253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014836	AGTG	2	8	525280	525287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014836	CTGG	2	8	525454	525461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014836	CTGG	2	8	525527	525534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014836	AGTG	2	8	525562	525569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014836	GCTC	2	8	532837	532844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014836	TCTT	2	8	532903	532910	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014836	CTGC	2	8	535941	535948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014836	GCAG	2	8	536560	536567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014836	TCTG	2	8	538677	538684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014836	CACT	2	8	539690	539697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014836	GCCA	2	8	539724	539731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014836	CTTG	2	8	539904	539911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014836	ATGG	2	8	540004	540011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014836	CTGG	2	8	540245	540252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014836	GGCA	3	12	543775	543786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014836	AGCC	2	8	552662	552669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014836	CTCA	2	8	553334	553341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014836	TAGT	2	8	555835	555842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014836	GAGG	2	8	558442	558449	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014836	CTGT	2	8	562886	562893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014836	CCTG	2	8	565113	565120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014836	TTTA	2	8	568573	568580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014836	CAAA	2	8	568678	568685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014836	ACTT	2	8	573863	573870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014836	TCGC	2	8	574855	574862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014836	CTGG	2	8	574938	574945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014836	CTGG	2	8	575012	575019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014836	TTTC	2	8	578876	578883	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014836	CTGT	2	8	584886	584893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_014836	CAGC	2	8	1637115	1637122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_014836	TCCT	2	8	1652621	1652628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_014836	TGCA	2	8	1698621	1698628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014836	ACTC	2	8	1698869	1698876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_014836	TCCG	2	8	1705538	1705545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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