MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalogenimonas lykanthroporepellens BL-DC-9 chromosome

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014314	AGAGAA	2	12	47233	47244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014314	GGCGTC	2	12	66254	66265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014314	GCCGGC	2	12	67340	67351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014314	GTAAGA	2	12	82867	82878	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014314	TACTAA	2	12	115032	115043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014314	GCCGGG	2	12	127756	127767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014314	AAGCGA	2	12	128732	128743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014314	GAAGCC	2	12	135746	135757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014314	TTCCGG	2	12	152685	152696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014314	CCGATA	2	12	155261	155272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014314	AATTTG	2	12	167583	167594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014314	TTTGGA	2	12	169648	169659	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014314	AGCGGT	2	12	232966	232977	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014314	CTGATG	2	12	247516	247527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014314	CCCAGC	2	12	251655	251666	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014314	GATAAT	2	12	283637	283648	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014314	CTGTTT	2	12	299621	299632	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014314	GACCCG	2	12	378752	378763	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014314	CGTGAA	2	12	450684	450695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014314	AATTTC	2	12	452314	452325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014314	AATTTC	2	12	458033	458044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014314	GAAAAG	2	12	515662	515673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014314	TAAATA	2	12	532770	532781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014314	GGCGCC	2	12	574341	574352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014314	CGTTAT	2	12	695550	695561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014314	GTACTG	2	12	761184	761195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014314	CCCCTT	2	12	788102	788113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014314	GCCTGG	2	12	947110	947121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014314	TCTGCC	2	12	1165028	1165039	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014314	AGGCGG	2	12	1171612	1171623	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014314	CCGGTG	2	12	1171791	1171802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014314	AAAACA	2	12	1171834	1171845	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014314	TCCGGC	2	12	1253129	1253140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014314	GGAAGG	2	12	1261748	1261759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014314	GGAAGG	2	12	1261925	1261936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014314	ACCGGA	2	12	1269681	1269692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014314	GGTTCG	2	12	1285149	1285160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014314	CCCCGG	2	12	1305291	1305302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014314	GTAAAA	2	12	1358024	1358035	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014314	CAGGTA	2	12	1366452	1366463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014314	TATACA	2	12	1416590	1416601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014314	TTCCAA	2	12	1424098	1424109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014314	TATACC	2	12	1424462	1424473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014314	TGGCGG	2	12	1424481	1424492	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014314	ATCGGC	2	12	1425157	1425168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014314	AATGTT	2	12	1432787	1432798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014314	AGAATT	2	12	1457357	1457368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014314	TAAATA	2	12	1457429	1457440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014314	ATGGCC	2	12	1507636	1507647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014314	ATCTAT	2	12	1520255	1520266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014314	AGCCGA	2	12	1607408	1607419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014314	ACCGGA	2	12	1652671	1652682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014314	CCGGAG	2	12	1665430	1665441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014314	TCAGGG	2	12	1675280	1675291	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.