MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809 chromosome

Total Repeats: 7097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013943	AGA	2	6	3155401	3155406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_013943	CAGG	2	8	3155439	3155446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_013943	CTG	2	6	3155497	3155502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_013943	A	6	6	3161575	3161580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_013943	TCGAT	2	10	3161594	3161603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7006	NC_013943	TTA	2	6	3161647	3161652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013943	TAA	2	6	3161670	3161675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013943	AGC	2	6	3161682	3161687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_013943	GTT	2	6	3161701	3161706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_013943	A	7	7	3161720	3161726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_013943	ATT	2	6	3161746	3161751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_013943	AAG	2	6	3161753	3161758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_013943	TAT	2	6	3161772	3161777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_013943	GGTT	2	8	3161786	3161793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_013943	CAGG	2	8	3162294	3162301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7016	NC_013943	GAC	2	6	3162311	3162316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_013943	TAC	2	6	3164026	3164031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_013943	AT	3	6	3164036	3164041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013943	ATT	2	6	3164053	3164058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_013943	ATA	2	6	3165537	3165542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_013943	CCAT	2	8	3165933	3165940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_013943	TATCAA	2	12	3165971	3165982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7023	NC_013943	T	6	6	3165990	3165995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_013943	A	8	8	3165998	3166005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_013943	TA	3	6	3166029	3166034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_013943	AT	4	8	3166072	3166079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_013943	ATT	2	6	3166103	3166108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_013943	TAT	2	6	3166133	3166138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_013943	A	7	7	3168324	3168330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_013943	TAA	2	6	3170016	3170021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_013943	TAAA	2	8	3170076	3170083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_013943	AAG	2	6	3170136	3170141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_013943	TAGA	2	8	3170164	3170171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_013943	A	6	6	3170178	3170183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_013943	TAT	2	6	3170184	3170189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013943	AAAC	2	8	3170199	3170206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_013943	CTG	2	6	3173945	3173950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_013943	TGT	2	6	3173962	3173967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_013943	ATT	2	6	3173972	3173977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_013943	CAG	2	6	3174008	3174013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_013943	TAA	2	6	3175612	3175617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_013943	TATT	3	12	3175637	3175648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_013943	CTA	2	6	3188492	3188497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_013943	TA	3	6	3192878	3192883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_013943	GGC	2	6	3192918	3192923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_013943	CTG	2	6	3193011	3193016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_013943	T	7	7	3193031	3193037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_013943	TTG	2	6	3193121	3193126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_013943	TTG	2	6	3193233	3193238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_013943	GT	3	6	3193243	3193248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_013943	GA	3	6	3193353	3193358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_013943	TC	3	6	3195267	3195272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_013943	AG	3	6	3195277	3195282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_013943	TATAA	2	10	3197070	3197079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_013943	ATA	2	6	3197174	3197179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_013943	TTAG	2	8	3197187	3197194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_013943	TAA	2	6	3197215	3197220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_013943	TAT	2	6	3197230	3197235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_013943	TTCA	2	8	3197255	3197262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7060	NC_013943	ATA	2	6	3197293	3197298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_013943	TA	3	6	3197297	3197302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_013943	TTA	2	6	3197303	3197308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_013943	AT	4	8	3197356	3197363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_013943	TAT	2	6	3197372	3197377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_013943	AT	4	8	3197417	3197424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_013943	ATG	3	9	3197437	3197445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_013943	TAT	2	6	3197451	3197456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_013943	AAC	2	6	3197461	3197466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_013943	TAT	2	6	3197480	3197485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_013943	GGA	2	6	3197504	3197509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_013943	GCG	2	6	3198164	3198169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013943	GCC	2	6	3198180	3198185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_013943	AAT	2	6	3198446	3198451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_013943	A	7	7	3198489	3198495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_013943	TAG	2	6	3198538	3198543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_013943	AAG	2	6	3206292	3206297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_013943	AAAG	2	8	3206304	3206311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_013943	TA	3	6	3206458	3206463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_013943	T	6	6	3206528	3206533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_013943	CTT	3	9	3206561	3206569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_013943	TAA	2	6	3207410	3207415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_013943	GCTAT	2	10	3207719	3207728	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7083	NC_013943	TTG	2	6	3207764	3207769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_013943	TAA	2	6	3208326	3208331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_013943	CTA	2	6	3208337	3208342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_013943	AATT	2	8	3212480	3212487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_013943	TC	3	6	3212491	3212496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_013943	AGG	2	6	3212510	3212515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_013943	C	6	6	3212793	3212798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7090	NC_013943	T	6	6	3212804	3212809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_013943	AAG	2	6	3212810	3212815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_013943	TGG	2	6	3212844	3212849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_013943	GGA	2	6	3212898	3212903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_013943	ATT	2	6	3216856	3216861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_013943	ACC	2	6	3216928	3216933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7096	NC_013943	CT	3	6	3222013	3222018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7097	NC_013943	AT	3	6	3222071	3222076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.