MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	AAAAAT	2	12	18839	18850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013940	TGTTAA	2	12	41842	41853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013940	TAGATT	2	12	42540	42551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013940	TAAAGA	2	12	53369	53380	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013940	TATTAA	2	12	53798	53809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013940	ATTAAA	3	18	67720	67737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013940	TAATAC	2	12	78249	78260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013940	TATATG	2	12	86206	86217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013940	CAAAAT	2	12	86860	86871	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013940	TAAAAA	2	12	90323	90334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013940	ATCATT	2	12	99186	99197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013940	ATTTAG	2	12	99492	99503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013940	CAAATA	2	12	100083	100094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013940	TGATAT	2	12	100159	100170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013940	TTTAAT	2	12	101150	101161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013940	TAAAAC	2	12	101947	101958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013940	ACATTA	2	12	102224	102235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013940	AACACA	2	12	106289	106300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013940	AGATAA	2	12	106417	106428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013940	TTTATT	2	12	106626	106637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013940	AAATAT	2	12	112566	112577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013940	ATAAAC	2	12	114448	114459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013940	AAAGAA	2	12	114493	114504	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013940	TAATAT	2	12	121100	121111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013940	CAAAAT	2	12	129607	129618	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013940	ATTTAA	2	12	137037	137048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013940	TTAAAT	2	12	139811	139822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013940	TTTTAT	2	12	140451	140462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013940	ATTTTT	2	12	140560	140571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013940	TAAAAA	2	12	149245	149256	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013940	AATAAA	2	12	153839	153850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013940	AAAAAT	2	12	154012	154023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013940	TAGATT	2	12	163867	163878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013940	TATTTT	2	12	166430	166441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013940	ATTTAT	2	12	166519	166530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013940	TATATC	2	12	175415	175426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013940	TTTATT	2	12	176558	176569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013940	TTAAAT	2	12	177496	177507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013940	ATAAAA	2	12	183491	183502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013940	TTTTAT	2	12	188583	188594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013940	AATTTT	2	12	191872	191883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013940	TAAAAA	2	12	193727	193738	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013940	TAAAGA	2	12	215834	215845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013940	AATAAA	2	12	218364	218375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013940	CATATG	2	12	223129	223140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013940	ATTTAT	2	12	232591	232602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013940	TTATTT	2	12	233594	233605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013940	AAAACA	2	12	233985	233996	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013940	AGTGGA	2	12	238232	238243	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013940	AAAAAT	2	12	238390	238401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013940	ATTATA	2	12	259799	259810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013940	AATTTT	2	12	261506	261517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013940	TATTTT	2	12	270818	270829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013940	AATCAA	2	12	294728	294739	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013940	AATTTT	2	12	295370	295381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013940	TAATTT	2	12	308242	308253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.