MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	TAGA	2	8	275	282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013940	ATTA	2	8	365	372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013940	GATA	2	8	402	409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013940	AAAC	2	8	476	483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013940	AAAT	2	8	2779	2786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013940	AAGG	2	8	3629	3636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013940	ATTT	2	8	4840	4847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013940	ATTA	2	8	16649	16656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013940	AAGC	2	8	25413	25420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013940	GCTT	2	8	25438	25445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013940	ATTA	2	8	26357	26364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013940	ATAA	2	8	28746	28753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013940	TTAA	2	8	31878	31885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013940	AATA	2	8	32323	32330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013940	ATAA	2	8	32342	32349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013940	TATT	2	8	37149	37156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013940	TATT	2	8	39388	39395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013940	GCTT	2	8	39489	39496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013940	AAAG	2	8	41584	41591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013940	CATT	2	8	41799	41806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013940	AATA	2	8	42669	42676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013940	AATA	2	8	42805	42812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013940	AAAG	2	8	42832	42839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013940	TAGA	2	8	42869	42876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013940	AATA	2	8	43210	43217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013940	TATT	2	8	43315	43322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013940	ATAA	2	8	43624	43631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013940	TAAT	2	8	43745	43752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013940	ATTT	2	8	43861	43868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013940	AAAT	2	8	43920	43927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013940	AATA	2	8	44347	44354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013940	ATTT	2	8	44480	44487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013940	TTAA	2	8	44668	44675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013940	ATAA	2	8	52865	52872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013940	AAGT	2	8	53263	53270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013940	TAAT	2	8	53320	53327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013940	TAAA	2	8	53446	53453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013940	AATT	2	8	53528	53535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013940	TAAA	2	8	53737	53744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013940	TAAA	3	12	53837	53848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013940	TACT	2	8	61118	61125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013940	TAAA	2	8	67761	67768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013940	AAAT	2	8	69956	69963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013940	TAAA	2	8	70009	70016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013940	TATT	2	8	70696	70703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013940	GATT	2	8	70912	70919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013940	ATTA	3	12	70922	70933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013940	TAAC	2	8	75609	75616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013940	CTTT	2	8	75893	75900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013940	CATA	2	8	75987	75994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013940	CATA	2	8	76056	76063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013940	ATTA	2	8	85380	85387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013940	TATT	2	8	85493	85500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013940	ATTA	2	8	85512	85519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013940	AATT	2	8	85811	85818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013940	ACTA	2	8	86119	86126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013940	ATTT	2	8	86803	86810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013940	ATTA	2	8	88920	88927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013940	CTTT	2	8	92056	92063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013940	TAGT	2	8	96936	96943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013940	TAAA	2	8	96980	96987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013940	TAAT	2	8	97026	97033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013940	ATTT	2	8	97122	97129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013940	GTAT	2	8	97569	97576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013940	ATTT	2	8	98053	98060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013940	TAAT	2	8	98244	98251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013940	ATAG	2	8	98252	98259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013940	AGTA	2	8	98786	98793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013940	ATTT	2	8	98934	98941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013940	TAAA	2	8	99309	99316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013940	ATTT	2	8	99477	99484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013940	TTAA	2	8	99554	99561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013940	TAAA	2	8	99615	99622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013940	TTTG	2	8	99670	99677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013940	TAAA	2	8	99795	99802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013940	TTAT	2	8	100050	100057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013940	TAAA	2	8	100071	100078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013940	CAAA	2	8	100389	100396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013940	TTAT	2	8	100440	100447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013940	GTAC	2	8	100856	100863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013940	TTAT	2	8	101470	101477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013940	AAAT	2	8	101529	101536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013940	AATA	2	8	101677	101684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013940	TAGA	2	8	102240	102247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013940	TCAA	2	8	104516	104523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013940	AAAT	2	8	104635	104642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013940	TTTG	2	8	104834	104841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013940	AATT	2	8	105509	105516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013940	AGCA	2	8	105854	105861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013940	AAAG	2	8	106239	106246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013940	AAAT	2	8	106457	106464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013940	GTTT	2	8	106479	106486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013940	TAAT	2	8	106557	106564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013940	AAGA	2	8	106701	106708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013940	TTTA	2	8	108033	108040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013940	TAAT	2	8	109673	109680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013940	TAAA	2	8	112217	112224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013940	ATTT	2	8	112313	112320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013940	ATTT	2	8	112637	112644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013940	ATTT	2	8	112695	112702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013940	TTTA	2	8	114407	114414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013940	AGTT	2	8	118432	118439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013940	TAAA	2	8	121025	121032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013940	AATA	3	12	121033	121044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013940	TTAA	2	8	125333	125340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013940	ATTA	2	8	125363	125370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013940	TATT	2	8	125740	125747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013940	AAAG	2	8	128538	128545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013940	TAAA	2	8	128825	128832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013940	TTAT	2	8	129076	129083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013940	AATA	2	8	129426	129433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013940	ATTA	2	8	130631	130638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013940	TACA	2	8	131532	131539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013940	ATAA	2	8	134220	134227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013940	GTTA	2	8	135795	135802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013940	AAAT	2	8	135819	135826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013940	CCAG	2	8	135968	135975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013940	ATGT	2	8	136030	136037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013940	ATAA	2	8	136066	136073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013940	ATAA	2	8	136077	136084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013940	TTTA	2	8	136581	136588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013940	TAAA	2	8	137021	137028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013940	ATTA	2	8	137063	137070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013940	TAAA	2	8	137130	137137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013940	ATTA	2	8	137261	137268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013940	AGAA	2	8	139456	139463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013940	ATTA	2	8	140173	140180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013940	TATT	2	8	140343	140350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013940	TTTA	2	8	140374	140381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013940	ATTT	2	8	140898	140905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013940	TCAT	2	8	142632	142639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013940	TTTA	2	8	143286	143293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013940	TAAT	2	8	145269	145276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013940	TAAA	2	8	149089	149096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013940	AGTA	2	8	149212	149219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013940	GACT	2	8	149318	149325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013940	AAAG	2	8	149497	149504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013940	TTTG	2	8	150502	150509	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013940	TAAA	2	8	150539	150546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013940	TAAA	2	8	152662	152669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013940	TGTA	2	8	153652	153659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013940	ATTT	2	8	153717	153724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013940	ATAA	2	8	153971	153978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013940	TTTA	2	8	155928	155935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013940	TTTA	2	8	156960	156967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013940	ACTT	2	8	161611	161618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013940	GTAG	2	8	163998	164005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013940	AAAT	2	8	164120	164127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013940	ATCT	2	8	165089	165096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013940	TTAA	2	8	165186	165193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013940	TATT	2	8	167398	167405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013940	ATAA	2	8	167504	167511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_013940	AATT	2	8	167596	167603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.