MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	AAAATC	2	12	34795	34806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013890	AAGCGA	2	12	48024	48035	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013890	TCTGCC	2	12	79419	79430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013890	TACCGC	2	12	94755	94766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013890	TCCGGC	2	12	104451	104462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013890	GGCAGA	2	12	200119	200130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013890	AAGGCA	2	12	255295	255306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013890	CTTAGC	2	12	345118	345129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013890	ACTATA	2	12	617848	617859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013890	ATAAAA	2	12	688138	688149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013890	TATGAT	2	12	732236	732247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013890	TTGAGC	2	12	811719	811730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013890	TAACAC	2	12	820569	820580	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013890	TCAGTG	2	12	821446	821457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013890	TAATAT	2	12	938398	938409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013890	CTAAGA	2	12	1005095	1005106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013890	ACATAC	2	12	1006900	1006911	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013890	ATTTTT	2	12	1012956	1012967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013890	GGAGGG	2	12	1043440	1043451	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013890	AAAACC	2	12	1047806	1047817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013890	ACCCCC	2	12	1098963	1098974	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_013890	AAAAAC	2	12	1114184	1114195	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013890	TAATTT	2	12	1154817	1154828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013890	TTTGCC	2	12	1207827	1207838	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013890	TAGCTA	2	12	1207918	1207929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013890	CTCTAT	2	12	1218104	1218115	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013890	TTTTTA	2	12	1249256	1249267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013890	TGGGAT	2	12	1253727	1253738	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013890	ATTTAT	2	12	1283067	1283078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013890	GATTAA	2	12	1288300	1288311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013890	AATTTC	2	12	1289297	1289308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013890	ATCTAT	2	12	1330404	1330415	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.