MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	CTTG	2	8	102	109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013890	GGGA	2	8	232	239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013890	TGGC	2	8	5985	5992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013890	CTTT	2	8	12318	12325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013890	AGAT	2	8	12328	12335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013890	AGGG	2	8	12412	12419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013890	TAAA	2	8	12445	12452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013890	AATC	2	8	15559	15566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013890	TCTT	2	8	18708	18715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013890	GGGC	2	8	20041	20048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013890	CAGC	2	8	20156	20163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013890	TTTA	2	8	20265	20272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013890	TAAA	2	8	20482	20489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013890	GCTT	2	8	20626	20633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013890	TAAA	2	8	24376	24383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013890	TATC	2	8	29153	29160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013890	AAAT	2	8	29165	29172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013890	GAAA	2	8	29268	29275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013890	AAAT	2	8	29276	29283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013890	CTTT	2	8	34487	34494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013890	GAGG	2	8	34691	34698	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013890	TCGT	2	8	34760	34767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013890	GCGA	2	8	47567	47574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013890	TTCT	2	8	47761	47768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013890	TGGA	2	8	49675	49682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013890	GGTC	2	8	49976	49983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013890	TTCA	2	8	50507	50514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013890	TTAA	2	8	50548	50555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013890	CTTT	2	8	50618	50625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013890	TATC	2	8	57548	57555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013890	GGTT	2	8	57775	57782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013890	AATC	2	8	76968	76975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013890	GATT	2	8	77214	77221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013890	AAAG	2	8	81780	81787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013890	TCGT	2	8	95058	95065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013890	GCTG	2	8	96855	96862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013890	ATTA	2	8	109393	109400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013890	TTAA	2	8	109665	109672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013890	TATT	2	8	113361	113368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013890	AAAG	2	8	113684	113691	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013890	CAAA	2	8	114871	114878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013890	TCTG	2	8	114957	114964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013890	AAAT	2	8	114977	114984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013890	CACT	2	8	115109	115116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013890	TAAT	2	8	115496	115503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013890	AATG	2	8	116401	116408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013890	TGAA	2	8	116673	116680	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013890	TTGG	2	8	117173	117180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013890	GATA	2	8	124530	124537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013890	ATAA	2	8	124660	124667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013890	TAAA	2	8	124904	124911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013890	CCCT	2	8	126409	126416	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_013890	GGCT	2	8	127512	127519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013890	TGCG	2	8	134143	134150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013890	GCAG	2	8	135440	135447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013890	AATA	2	8	139380	139387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013890	AAAT	2	8	140013	140020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013890	ATTT	2	8	143845	143852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013890	CTGT	2	8	154505	154512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013890	GGAA	2	8	154514	154521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013890	GCCA	2	8	159602	159609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013890	CTTT	2	8	164979	164986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013890	GTAA	2	8	169180	169187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013890	GGCA	2	8	169369	169376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013890	TCCC	2	8	170501	170508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_013890	TATG	2	8	170659	170666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013890	GGAT	2	8	172382	172389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013890	CAGC	2	8	182688	182695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013890	GCTT	2	8	184354	184361	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013890	ACGA	2	8	184485	184492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013890	CTTT	2	8	197762	197769	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013890	TTTA	2	8	217110	217117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013890	GTCA	2	8	217892	217899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013890	CTTT	2	8	226195	226202	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013890	CCTG	2	8	226233	226240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013890	CCCT	2	8	228423	228430	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_013890	AATT	2	8	232903	232910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013890	TAAA	2	8	233273	233280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013890	ATTT	2	8	233907	233914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013890	ATAA	2	8	244088	244095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013890	TTTC	2	8	245458	245465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013890	TATT	2	8	246182	246189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013890	AGGA	2	8	246528	246535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013890	TTTG	2	8	248790	248797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013890	TTTC	2	8	250207	250214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013890	TTTC	2	8	252964	252971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013890	CAAG	2	8	253917	253924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013890	GCCG	2	8	255233	255240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013890	CAAG	2	8	261703	261710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013890	GGAG	2	8	274413	274420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013890	ATCT	2	8	276925	276932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013890	TAGA	2	8	288627	288634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013890	ATTT	2	8	288697	288704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013890	TGGT	2	8	289429	289436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013890	AGGC	2	8	291218	291225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013890	GGAC	2	8	291232	291239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013890	TAGT	2	8	304787	304794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013890	CATT	2	8	310211	310218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013890	TTTG	2	8	312360	312367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013890	CGGG	2	8	316350	316357	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013890	CAAA	2	8	316388	316395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013890	TAAA	2	8	323170	323177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013890	TCTG	2	8	332983	332990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013890	ATTT	2	8	337426	337433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013890	AGCT	2	8	337492	337499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013890	TGGT	2	8	341515	341522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013890	AAAT	2	8	341698	341705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013890	ATAA	2	8	359273	359280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013890	CAAA	2	8	369148	369155	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013890	TAAA	2	8	378771	378778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013890	TCGG	2	8	387952	387959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013890	ATTG	2	8	388152	388159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013890	AATT	2	8	408241	408248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013890	GGGC	2	8	426681	426688	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013890	TTAA	2	8	443196	443203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013890	GGAT	2	8	445371	445378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013890	TAAA	2	8	473123	473130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013890	GTTT	2	8	473847	473854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013890	AGGC	2	8	478118	478125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013890	CAAA	2	8	521184	521191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013890	GGGA	2	8	535217	535224	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013890	TCCC	2	8	537911	537918	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_013890	TGGA	2	8	538127	538134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013890	CTTG	2	8	539853	539860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013890	ATTG	2	8	545231	545238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013890	AGGG	2	8	546248	546255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013890	GTTC	2	8	546432	546439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013890	AATG	2	8	546534	546541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013890	ATTT	2	8	552674	552681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013890	CAGG	2	8	555200	555207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013890	CAGA	2	8	569028	569035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013890	AACA	2	8	570006	570013	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013890	CTGC	2	8	591389	591396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013890	GCGG	2	8	593663	593670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013890	TTTA	2	8	593761	593768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013890	GCAA	2	8	596223	596230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013890	TTAA	3	12	596269	596280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013890	TGTT	2	8	596311	596318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013890	GGCT	2	8	596659	596666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013890	CCTT	2	8	603050	603057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013890	GTAG	2	8	606146	606153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013890	CCCT	2	8	608114	608121	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_013890	TCCT	2	8	608341	608348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013890	GCGG	2	8	608557	608564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013890	GATT	2	8	608751	608758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013890	TAAA	2	8	610710	610717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013890	CACC	2	8	610725	610732	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_013890	CAAG	2	8	614996	615003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013890	TCAC	2	8	615014	615021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013890	TAAT	2	8	618063	618070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013890	CTTT	2	8	618914	618921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013890	TAAA	2	8	620073	620080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.