MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 1062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	TTCC	2	8	2292	2299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013223	AGCG	2	8	2471	2478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013223	CCAG	2	8	13514	13521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013223	CAGT	2	8	13578	13585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013223	TACC	2	8	20876	20883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013223	AGGA	2	8	20947	20954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013223	CTGC	2	8	29830	29837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013223	CCGG	2	8	29857	29864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013223	CGCC	2	8	33098	33105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_013223	TCGC	2	8	33276	33283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013223	TGGT	2	8	36702	36709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013223	GAAA	2	8	36979	36986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013223	CAGC	2	8	56882	56889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013223	CTTG	2	8	56951	56958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013223	ATTC	2	8	61800	61807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013223	CTCC	2	8	61853	61860	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013223	GGAG	2	8	64446	64453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013223	TGGA	2	8	64641	64648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013223	ATCC	2	8	65736	65743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013223	CTGG	2	8	65838	65845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013223	AAGG	2	8	66039	66046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013223	TTCT	2	8	66632	66639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013223	CAAC	2	8	67484	67491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013223	GGCC	2	8	70247	70254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013223	CCGG	2	8	72008	72015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013223	CTTC	2	8	72309	72316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013223	GAAG	2	8	72455	72462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013223	GCGG	2	8	72739	72746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013223	CGGA	2	8	72809	72816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013223	CTCC	2	8	72924	72931	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013223	GGGC	2	8	73176	73183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013223	CAAG	2	8	73434	73441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013223	GCAA	2	8	73553	73560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013223	ATTT	2	8	73654	73661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013223	GGGC	2	8	76722	76729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013223	GAAG	2	8	79946	79953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013223	GTCC	2	8	79975	79982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013223	AAAT	2	8	83942	83949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013223	TTGC	2	8	84043	84050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013223	CTTG	2	8	84162	84169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013223	CAGG	2	8	85990	85997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013223	TGTT	2	8	87595	87602	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013223	CAGA	2	8	89820	89827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013223	GCAT	2	8	90603	90610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013223	GATC	2	8	95261	95268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013223	CGAA	2	8	98898	98905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013223	CGGC	2	8	99051	99058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013223	CCAG	2	8	99157	99164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013223	CTGC	2	8	99306	99313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013223	CATA	2	8	105220	105227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013223	CGCT	2	8	106771	106778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013223	AGCA	2	8	109173	109180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013223	GCAG	2	8	116642	116649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013223	TTGA	2	8	124668	124675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013223	TTGA	3	12	140399	140410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013223	AGGC	2	8	140465	140472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013223	CAGG	2	8	141447	141454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013223	ATCC	2	8	142154	142161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013223	AGAA	2	8	153006	153013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013223	AGGG	2	8	166073	166080	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013223	GCAG	2	8	176062	176069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013223	TAAC	2	8	181213	181220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013223	CCCT	2	8	182374	182381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_013223	GAAG	2	8	195202	195209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013223	CCTG	2	8	197004	197011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013223	CTCG	2	8	198672	198679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013223	CCTG	2	8	202768	202775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013223	GGGC	2	8	203409	203416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013223	CGTT	2	8	208757	208764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013223	AGTG	2	8	213667	213674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013223	GCAG	2	8	222566	222573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013223	GTAT	2	8	222586	222593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013223	TGCA	2	8	222878	222885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013223	TTGG	2	8	230415	230422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013223	GCTT	2	8	230551	230558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013223	AGGC	2	8	231958	231965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013223	GAAG	2	8	239301	239308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013223	GTTG	2	8	241737	241744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013223	TTAC	2	8	242950	242957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013223	GATG	2	8	246432	246439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013223	TGAG	2	8	251853	251860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013223	AATA	2	8	251999	252006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013223	GCGG	2	8	252100	252107	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013223	CAGG	2	8	272446	272453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013223	GGGA	2	8	273485	273492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013223	CCTG	2	8	281761	281768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013223	CCAT	2	8	286609	286616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013223	TGAC	2	8	296430	296437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013223	CTTT	2	8	302225	302232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013223	AGTC	2	8	302615	302622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013223	GAAC	2	8	307745	307752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013223	TTCG	2	8	309302	309309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013223	ACCG	2	8	316811	316818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013223	CCTT	2	8	318485	318492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013223	GAAC	2	8	325581	325588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013223	CATT	2	8	327121	327128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013223	GCCC	2	8	333044	333051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_013223	GCCC	2	8	337834	337841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_013223	CGCC	2	8	337883	337890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013223	TTCC	2	8	339009	339016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013223	GACC	2	8	340463	340470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013223	GGCC	2	8	340504	340511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013223	TGTA	2	8	353894	353901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013223	TTAT	2	8	354002	354009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013223	AAAG	2	8	354051	354058	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013223	AGTT	2	8	354105	354112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013223	AAAG	2	8	354533	354540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013223	TTAT	2	8	354670	354677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013223	AATA	2	8	354951	354958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013223	GCCG	2	8	365117	365124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013223	GGGA	2	8	366284	366291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013223	CACC	2	8	371394	371401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013223	CTCC	2	8	373723	373730	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_013223	GGGC	2	8	373920	373927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013223	GCCC	2	8	373933	373940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_013223	AAAG	2	8	374029	374036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013223	AAGT	2	8	376087	376094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013223	CAAC	2	8	386157	386164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013223	AAGG	2	8	386166	386173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013223	TCAG	2	8	388554	388561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013223	CCCG	3	12	398877	398888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_013223	CCCG	3	12	399097	399108	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_013223	CCCG	2	8	399317	399324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_013223	CGTC	2	8	399348	399355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013223	TCAG	2	8	399372	399379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013223	CTCG	2	8	403622	403629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013223	GCTC	2	8	403739	403746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013223	CTCG	2	8	403852	403859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013223	TACG	2	8	407929	407936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013223	GGAA	2	8	407994	408001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013223	TGTC	2	8	410019	410026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013223	CGGC	2	8	410107	410114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013223	GTTC	2	8	414183	414190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013223	GGAA	2	8	418815	418822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013223	CCCT	2	8	419767	419774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_013223	CAGA	2	8	420339	420346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013223	CCCT	2	8	427228	427235	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_013223	GATA	2	8	427436	427443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013223	CAGG	3	12	427799	427810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013223	ATGG	2	8	432499	432506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013223	CGCA	2	8	442495	442502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013223	TTTC	2	8	447140	447147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013223	TCTT	2	8	447859	447866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013223	CGGA	2	8	450197	450204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013223	GGGC	2	8	453939	453946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013223	GCGA	2	8	454927	454934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013223	TATT	2	8	455089	455096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013223	AATA	2	8	458579	458586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013223	TATT	2	8	460855	460862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013223	AATA	2	8	460873	460880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013223	AATT	2	8	462781	462788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013223	GTTT	2	8	472632	472639	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_013223	GCAA	2	8	472723	472730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013223	ATCC	2	8	472944	472951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_013223	CTCG	2	8	525705	525712	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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185	NC_013223	GCTC	2	8	528024	528031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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193	NC_013223	TCGG	2	8	554022	554029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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232	NC_013223	AGGG	2	8	725324	725331	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013223	GGGC	2	8	726121	726128	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
234	NC_013223	GACA	2	8	728158	728165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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271	NC_013223	GCAA	2	8	811015	811022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
272	NC_013223	TTGC	2	8	815800	815807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_013223	ATGC	2	8	833917	833924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
282	NC_013223	TCTG	2	8	834584	834591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_013223	GAAG	2	8	836129	836136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_013223	GGCC	2	8	1262158	1262165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
445	NC_013223	GAGC	2	8	1267231	1267238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_013223	GTGG	2	8	1312822	1312829	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_013223	GATG	2	8	1343007	1343014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_013223	CCGT	2	8	1344127	1344134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_013223	TTTG	2	8	1385068	1385075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_013223	ATGT	2	8	1386853	1386860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013223	TTAT	2	8	1396090	1396097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013223	CCCT	2	8	1396493	1396500	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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492	NC_013223	TGGA	2	8	1411635	1411642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
493	NC_013223	TTTG	2	8	1411728	1411735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013223	TACG	2	8	1413887	1413894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_013223	CAGC	2	8	1413966	1413973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_013223	GGTT	2	8	1413999	1414006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013223	CGAG	2	8	1417410	1417417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_013223	GACG	2	8	1419913	1419920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_013223	CTAT	2	8	1424395	1424402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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