MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 4476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	AGG	2	6	459	464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013223	TGC	2	6	527	532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013223	GTT	2	6	539	544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013223	AGG	2	6	651	656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013223	ACC	2	6	1556	1561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013223	TGC	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013223	GGC	2	6	2167	2172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013223	CAG	3	9	3718	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013223	GAA	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013223	AGG	2	6	8760	8765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013223	GGA	2	6	13252	13257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013223	CGG	2	6	13396	13401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013223	GGT	2	6	13566	13571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013223	CCG	2	6	24389	24394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013223	GTC	2	6	24444	24449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013223	AGA	2	6	25175	25180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013223	AGG	2	6	25191	25196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013223	TCC	2	6	27030	27035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013223	CGG	2	6	27052	27057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013223	CCA	2	6	27116	27121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013223	TGT	2	6	29713	29718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013223	CGG	2	6	29810	29815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013223	AGG	2	6	30003	30008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013223	CTC	2	6	31955	31960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013223	GCT	2	6	31966	31971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013223	GGT	2	6	33076	33081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013223	GGT	2	6	33255	33260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013223	CAA	2	6	35287	35292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013223	ATC	2	6	35407	35412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013223	TCC	2	6	35438	35443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013223	CAT	2	6	36953	36958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013223	AGG	2	6	37273	37278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013223	ACC	2	6	39346	39351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013223	GAG	2	6	46549	46554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013223	TGG	2	6	46648	46653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013223	CGA	2	6	46685	46690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013223	TCT	2	6	46775	46780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013223	CAT	2	6	46789	46794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013223	AGC	2	6	46833	46838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013223	TCA	2	6	46845	46850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013223	TTC	2	6	46971	46976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013223	AAG	2	6	52213	52218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013223	AAG	2	6	52227	52232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013223	GAA	2	6	52236	52241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013223	GAA	2	6	52308	52313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013223	GAA	2	6	52333	52338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013223	AGA	2	6	52401	52406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013223	CTT	2	6	52607	52612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013223	GGA	2	6	54200	54205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013223	CGG	2	6	54213	54218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013223	GGA	2	6	54228	54233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013223	ACC	2	6	54408	54413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013223	AGC	2	6	54624	54629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013223	TGC	2	6	56564	56569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013223	TTC	2	6	56732	56737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013223	CGG	2	6	57079	57084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013223	TGG	2	6	57107	57112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013223	GGT	2	6	57113	57118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013223	GCA	2	6	57162	57167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013223	CGC	2	6	57171	57176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013223	TGT	2	6	57207	57212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013223	AGG	2	6	57234	57239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013223	GGT	2	6	57270	57275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013223	GGA	2	6	57297	57302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013223	GGA	2	6	59849	59854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013223	AGG	2	6	60086	60091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013223	GAA	2	6	61540	61545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013223	ATC	2	6	61568	61573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013223	CCT	2	6	61598	61603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013223	TGC	2	6	61864	61869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013223	TGT	2	6	61945	61950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013223	TCC	2	6	64385	64390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013223	CCG	2	6	64433	64438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013223	TGA	2	6	64464	64469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013223	TGC	2	6	64547	64552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013223	CAC	2	6	64580	64585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013223	GCC	2	6	64768	64773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013223	GAA	2	6	65831	65836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013223	CCA	2	6	65951	65956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013223	AGA	2	6	66002	66007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013223	CGG	2	6	66067	66072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013223	CGC	2	6	66463	66468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013223	AGA	2	6	66509	66514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013223	GGA	2	6	66551	66556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013223	TGC	2	6	66576	66581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013223	CGC	2	6	66709	66714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013223	TCC	2	6	66721	66726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013223	GCA	2	6	67270	67275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013223	GGT	2	6	67324	67329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013223	CCG	2	6	67459	67464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013223	CGA	2	6	68841	68846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013223	GCC	2	6	68946	68951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013223	GCT	2	6	70220	70225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013223	ATG	2	6	70236	70241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013223	CGC	2	6	70274	70279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013223	TTC	2	6	70329	70334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013223	TTC	2	6	70383	70388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013223	CCG	2	6	70402	70407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013223	GGC	2	6	70419	70424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013223	TCC	2	6	70466	70471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013223	TTC	2	6	70482	70487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013223	GCG	2	6	71768	71773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013223	GAA	2	6	71805	71810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013223	GAG	2	6	71830	71835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013223	GGA	2	6	71838	71843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013223	GAC	2	6	71853	71858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013223	GAA	2	6	72367	72372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013223	GGT	2	6	72429	72434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013223	AGA	2	6	72496	72501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013223	CGG	2	6	72512	72517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013223	CCG	2	6	72691	72696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013223	GCC	2	6	72773	72778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013223	CGA	2	6	72986	72991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013223	CTT	2	6	73167	73172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013223	CTT	2	6	73223	73228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013223	CGC	2	6	73324	73329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013223	ACC	2	6	73411	73416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013223	TGG	2	6	73508	73513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013223	GGT	2	6	73615	73620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013223	GTG	2	6	73666	73671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013223	CCT	2	6	74749	74754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013223	GCA	2	6	74760	74765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013223	GTT	2	6	74775	74780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013223	GGT	2	6	74814	74819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013223	TTC	2	6	74843	74848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013223	TTC	2	6	74897	74902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013223	CCG	2	6	74916	74921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013223	GGT	2	6	76662	76667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013223	GGC	2	6	76707	76712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013223	CAA	2	6	76783	76788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013223	CCG	2	6	76903	76908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013223	TCT	2	6	77129	77134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013223	TCT	2	6	77160	77165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013223	TCC	2	6	77597	77602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013223	CCT	2	6	77682	77687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013223	GCA	2	6	77707	77712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013223	GTT	2	6	77740	77745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013223	GGT	2	6	79851	79856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013223	GCC	2	6	79872	79877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013223	CGG	2	6	79889	79894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013223	AGA	2	6	79907	79912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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